一种中华绒螯蟹DNA指纹图谱及其构建方法和应用技术

技术编号:41517501 阅读:23 留言:0更新日期:2024-05-30 14:53
本发明专利技术公开了一种中华绒螯蟹DNA指纹图谱及其构建方法和应用,本发明专利技术对长江水域和辽河水域共46份中华绒螯蟹样品进行重测序和位点筛选后,得到78个可用于中华绒螯蟹种质资源鉴定的高特异性单核苷酸多态性(SNP)位点构建形成中华绒螯蟹DNA指纹图谱。本发明专利技术利用构建的中华绒螯蟹DNA指纹图谱可以快速且精准的鉴定长江水域和辽河水域群体,本发明专利技术首次利用SNP位点信息构建DNA指纹图谱,为中华绒螯蟹品种鉴定、群体来源和分子辅助育种等方面提供更有效、更精确的方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域,具体涉及一种中华绒螯蟹dna指纹图谱及其构建方法和应用。


技术介绍

1、中华绒螯蟹(eriocheir sinensis)隶属于十足目(decapoda)、弓蟹科(varunidae)、绒螯蟹属(eriocheir),又名河蟹和大闸蟹等,主要分布于我国长江和辽河等水域,是重要的水产养殖经济品种。由于过度捕捞、水环境恶化和生境破坏等因素导致中华绒螯蟹资源衰退。因此,从不同水系无序引种和盲目放苗的现象愈发频繁,这不可避免地导致河蟹种质资源退化,产量和品质下降,严重制约了河蟹产业的绿色发展。加之,我国中华绒螯蟹养殖规模不断扩大,种业保护措施和养殖管理不规范等问题日益凸显。此外,在养殖和运输过程中极易出现河蟹逃逸现象,这都加剧了种质资源的混杂。因此,急需一种能够精确鉴别不同品种中华绒螯蟹的方法,对后续种质资源鉴定和遗传多样性研究尤为重要。

2、利用高多态性snp位点构建的dna指纹图谱,具有多态性强、不易受环境条件和主观因素的影响、能更加精准的鉴别不同品种遗传信息等特点。dna指纹图谱在品种种质资源鉴定和遗传多样性上应用前本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种中华绒螯蟹DNA指纹图谱,其特征在于,所述DNA指纹图谱均包括78个SNP位点,所述SNP位点及特异性核苷酸如下:

2.一种中华绒螯蟹DNA指纹图谱,其特征在于,所述中华绒螯蟹DNA指纹图谱优选包括长江水域中华绒螯蟹DNA指纹图谱和辽河水域中华绒螯蟹DNA指纹图谱,两种DNA指纹图谱均包括78个SNP位点,所述长江水域中华绒螯蟹DNA指纹图谱的SNP位点及特异性核苷酸如下:

3.一种权利要求1或者2所述的中华绒螯蟹DNA指纹图谱的构建方法,包括如下步骤:

4.根据权利要求3所述的中华绒螯蟹DNA指纹图谱的构建方法,其特征在于,步骤(3)所述质控...

【技术特征摘要】

1.一种中华绒螯蟹dna指纹图谱,其特征在于,所述dna指纹图谱均包括78个snp位点,所述snp位点及特异性核苷酸如下:

2.一种中华绒螯蟹dna指纹图谱,其特征在于,所述中华绒螯蟹dna指纹图谱优选包括长江水域中华绒螯蟹dna指纹图谱和辽河水域中华绒螯蟹dna指纹图谱,两种dna指纹图谱均包括78个snp位点,所述长江水域中华绒螯蟹dna指纹图谱的snp位点及特异性核苷酸如下:

3.一种权利要求1或者2所述的中华绒螯蟹dna指纹图谱的构建方法,包括如下步骤:

4.根据权利要求3所述的中华绒螯蟹dna指纹图谱的构建方法,其特征在于,步骤(3)所述质控合格的dna片段上机重测序具体步骤为:将dna样品进行酶切片段化,用连接酶将测序接头与片段化dna链接在一起,对连接产物进行pcr扩增,用磁珠对pcr产物进行片段筛选,然后,将线性文库变性为单链后进行环化,形成单链环状文库,经过滚环复制形成dna纳米球(dnb),最后,利用加载设备mgidl-t7将dnb加载到测序芯片中,通过联合探针锚定聚合技术上机进行重测序。

5.根据权利要求3所述的中华绒螯蟹dna指纹图谱的构建方法,其特征在于,步骤(4)中得到的测序数据进行过滤、测序数据污染检测和测序数据质量评估包括测序数据和质量指标汇总、测序数据...

【专利技术属性】
技术研发人员:尹绍武蒋苏张凯宁先会郭鑫萍张聪
申请(专利权)人:南京师范大学
类型:发明
国别省市:

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