杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质制造方法及图纸

技术编号:41496869 阅读:41 留言:0更新日期:2024-05-30 14:40
本申请公开了杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质。该检测方法包括获得杂交种的第一基因组数据;将第一基因组数据比对至参考基因组并对比对结果进行处理得到第二基因组数据;提取第二基因组数据中所述变异位点数据;根据变异位点数据判断杂交种亲本基因型。利用杂交种子胚乳的测序数据,通过生物信息学分析,直接推测出测序位点的亲本基因型,它克服了传统方法的一系列局限性,实现了对亲本基因型的直接推测,弥补了现有技术不能直接由杂交种溯源亲本的缺陷。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及杂交种,具体涉及杂交种亲本基因型的检测方法、装置、电子设备及介质


技术介绍

1、纯合亲本杂交产生的杂交种具有重要的经济意义,其表现出更强的抗性、适应性和生产力,可显著提高农作物产量和质量,是农业生产的重要资源。现代农业中,新品种的培育需要大量的时间和资源。追溯亲本基因型可以为品种知识产权保护提供有力的支持,确保品种的遗传稳定性和独特性,更好地保护育种者的劳动成果,防止未经授权的种植和销售。利用杂交种推测亲本的基因型在亲子关系鉴定、品种知识产权保护、育种实践中都具有重要的作用。液相芯片测序技术是一种结合了芯片技术和二代测序技术的创新性工具。这项技术通过在微小的芯片表面上固定核酸分子,实现对大量dna或rna片段的并行测序,具有高通量、高分辨率和多样性的优势,成为基因组学研究中的重要工具。杂交种子具有亲本的全部遗传信息,其中胚乳是三倍体(具有两份母本以及一份父本单倍型的信息),是推测亲本基因型的良好资源。

2、传统的杂交种双亲鉴定方法通常依赖于分子标记、同工酶、蛋白质标记等。这些方法不仅在样本处理、分析效率和成本等方面存在一些局限性,可本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种杂交种亲本基因型的检测方法,其包括:

2.根据权利要求1所述的检测方法,其中,“根据所述变异位点数据判断所述杂交种亲本基因型”的步骤包括:

3.根据权利要求2所述的检测方法,所述第一胚乳基因型的数据量为所述第二基因型数据中每一变异位点的第一胚乳基因型的reads数,所述第二胚乳基因型的数据量为所述第二基因型数据中每一变异位点的第二胚乳基因型的reads数。

4.根据权利要求2所述的检测方法,可选地,若所述第一胚乳基因型的数据量大于所述第二胚乳基因型的数据量,且所述第一胚乳基因型的数据量与所述第二胚乳基因型的数据量的比值大于10,则所述杂交种的父...

【技术特征摘要】

1.一种杂交种亲本基因型的检测方法,其包括:

2.根据权利要求1所述的检测方法,其中,“根据所述变异位点数据判断所述杂交种亲本基因型”的步骤包括:

3.根据权利要求2所述的检测方法,所述第一胚乳基因型的数据量为所述第二基因型数据中每一变异位点的第一胚乳基因型的reads数,所述第二胚乳基因型的数据量为所述第二基因型数据中每一变异位点的第二胚乳基因型的reads数。

4.根据权利要求2所述的检测方法,可选地,若所述第一胚乳基因型的数据量大于所述第二胚乳基因型的数据量,且所述第一胚乳基因型的数据量与所述第二胚乳基因型的数据量的比值大于10,则所述杂交种的父本基因型对应于第一胚乳基因型,所述杂交种的母本基因型对应于...

【专利技术属性】
技术研发人员:李林周涛李昭韩瑞
申请(专利权)人:华中农业大学
类型:发明
国别省市:

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