一种蛋鸡全基因组低密度SNP芯片及其应用制造技术

本发明专利技术涉及蛋鸡分子育种技术领域，尤其涉及一种蛋鸡全基因组低密度SNP芯片及其应用。SNP芯片数据在全基因组和染色体水平分布均匀，且相较于50K芯片连锁不平衡程度没有下降，降低了育种成本的同时保障了用于蛋鸡基因组遗传评估的准确性；而且，该低密度芯片收集了蛋鸡重要经济性状的显著关联位点，更适用于蛋鸡选育；此外，芯片中位点来源于蛋鸡全产蛋期的表型显著关联位点，满足生产中任意时期的遗传评估，也能满足于科研工作者的研究需求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及蛋鸡分子育种，尤其涉及一种蛋鸡全基因组低密度snp芯片及其应用。

技术介绍

1、单核苷酸多态性(snp)是基因组上最常见的重要遗传变异，占已知多态性的90％以上，具有分布广、密度高、遗传稳定、检测便捷等优点，是继第一代限制性片段长度多态性标记、第二代微卫星标记后的第三代分子遗传标记。基于snp的高通量分子标记检测技术主要为两大类：一类是基于高通量测序手段获取snp信息，其可获取的snp信息十分丰富，但由于检测成本过高仍无法在大规模群体中推广应用；另一类则是基于基因芯片分型的分子标记检测技术，基因芯片可通过微小的基片集成大量的分子识别探针靶点，其检测通量大、准确性高、成本低，在畜禽分子育种、种质资源保护、亲缘关系鉴定、功能基因定位中被广泛应用。

2、基于snp芯片对个体进行基因型检测，通过成熟的基因组选择模型，评估个体育种值并进行选种的技术即为基因组选择，该技术目前已在畜禽育种领域得到广泛应用。目前，鸡的商业化芯片主要包括axiom 600k、illumina 50k、illumina 60k，已经广泛应用于国内外育种企业和科研单位本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋鸡全基因组SNP分子标记组合，其特征在于，其由11146个SNP分子标记组成，所述SNP分子标记在鸡参考基因组GRCg6a上的位置如说明书表1中的编号1～11146所示。

2.一种蛋鸡全基因组SNP芯片，其特征在于，其利用权利要求1所述的SNP分子标记组合制得。

3.根据权利要求2所述的SNP芯片，其特征在于，其为固相芯片或液相芯片。

4.根据权利要求2所述的SNP芯片，其特征在于，所述SNP分子标记组合与蛋鸡经济性状相关联；

5.权利要求1所述的SNP分子标记组合、或权利要求2～4中任一项所述的SNP芯片在不同品系蛋鸡基因组选择...

【技术特征摘要】

1.一种蛋鸡全基因组snp分子标记组合，其特征在于，其由11146个snp分子标记组成，所述snp分子标记在鸡参考基因组grcg6a上的位置如说明书表1中的编号1～11146所示。

2.一种蛋鸡全基因组snp芯片，其特征在于，其利用权利要求1所述的snp分子标记组合制得。

3.根据权利要求2所述的snp芯片，其特征在于，其为固相芯片或液相芯片。

4.根据权利要求2所述的snp芯片，其特征在于，所述snp分子标记组合与蛋鸡经济性状相关联；

5.权利要求1所述的snp分子标记组合、或权利要求2～4中任一项所述的snp芯片在不同品系蛋鸡基因组选择中的应用。

【专利技术属性】
技术研发人员：连玲，吴俊锋，闫奕源，杨宁，孙从佼，吴桂琴，李光奇，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：