【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物测序，具体地，涉及基于16s rdna测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法和应用。
技术介绍
1、柔嫩艾美耳球虫(eimeria tenella,e.tenella)是现代集约化养禽生产中危害最严重的一种寄生虫病。它能引起病鸡盲肠肿胀、出血，增重减少，饲料转化率下降，甚至造成死亡，全球每年因鸡球虫病导致的经济损失超104亿英镑。肠道菌群、寄生虫和宿主三者之间关系密切。肠道菌群可影响寄生虫在宿主体内的入侵和毒力，寄生虫感染则会引起机体肠道菌群稳态失衡、丰度降低，甚至引发系列疾病。已有研究表明一些肠道益生菌可治疗或预防寄生虫感染。当前，有关鸡球虫与肠道菌群相互作用的研究较少，大多是评估已知或公认的益生菌对鸡球虫感染的保护效果。球虫感染后鸡肠道菌群的变化及鸡肠道内是否存在特有益生菌还不清晰。
2、基于此，对柔嫩艾美耳球虫感染后鸡肠道内菌群的变化研究，并在此基础上从肠道微生物多样性方向提供鸡感染柔嫩艾美耳球虫后的研究方向是本专利技术亟需解决的问题。
技术实现思路>
1、针对上述本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种基于16S rDNA测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的一种方法，其特征在于，步骤S100中，感染组的待试验雏鸡感染柔嫩艾美耳球虫的方式为经口接种含有柔嫩艾美耳球虫卵囊的感染液；
3.根据权利要求1或2所述的一种方法，其特征在于，步骤S200中，在对盲肠内容物DNA的扩增产物纯化前，还包括在扩增产物末端加上带有Index序列的接头。
4.根据权利要求1或2所述的一种方法，其特征在于，步骤S400中，数据过滤至少包括对原始测序数据中的嵌合体序列进行去除。
...【技术特征摘要】
1.一种基于16s rdna测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的一种方法，其特征在于，步骤s100中，感染组的待试验雏鸡感染柔嫩艾美耳球虫的方式为经口接种含有柔嫩艾美耳球虫卵囊的感染液；
3.根据权利要求1或2所述的一种方法，其特征在于，步骤s200中，在对盲肠内容物dna的扩增产物纯化前，还包括在扩增产物末端加上带有index序列的接头。
4.根据权利要求1或2所述的一种方法，其特征在于，步骤s400中，数据过滤至少包括对原始测序数据中的嵌合体序列进行去除。
5.根据权利要求1或2所述的一种方法，其特征在于，步骤s400中，聚类过程采用vsearch软件实现。
6.根据权利要求1或2所述的一种方法，其特征在于，步骤s500中，菌群...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘剑华，袁橙，丁小丽，赵长菁，李昕烨，季苏润，
申请(专利权)人：江苏农牧科技职业学院，
类型：发明
国别省市：
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