【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及病毒数据分析，尤其涉及一种重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法及系统。
技术介绍
1、腺相关病毒(adeno-associated virus，aav)是细小病毒科(parvoviridae)的病毒，病毒颗粒大小约为20-25nm，是目前已知的最小的动物病毒。aav是一种复制缺陷型病毒，其增殖复制需要腺病毒(adenovirus，ad)或者单纯孢疹病毒(herpes simplex virus，hsv)的辅助。在缺乏辅助病毒的情况下，aav可以在许多类型的细胞中长期潜伏存在。
2、aav是单链dna病毒，基因组结构简单，全长约4.7kb。aav基因组dna的两端为145个核苷酸长度的反向末端重复序列(inverted terminal repeat，itr)，itr序列折叠成发卡结构，是dna复制起始和包装重组aav基因组为感染性的病毒颗粒所需的顺式作用元件。itr序列之间为病毒编码区，含有rep和cap两个基因。其中rep基因编码rep78、rep68、rep52和rep40四种蛋白质，主要作用于病毒基因组复...
【技术保护点】
1.一种重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，所述对所述完整测序数据去除5’端引物序列，得到干净测序数据的方法为：
3.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，对所述干净测序数据分别提取正向序列和反向序列，得到正向测序数据和反向测序数据的方法为：
4.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，对所述正向测序数据和所述反向测序数据提取barcode序列，得到目标数据的方法为：
<...【技术特征摘要】
1.一种重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，所述对所述完整测序数据去除5’端引物序列，得到干净测序数据的方法为：
3.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，对所述干净测序数据分别提取正向序列和反向序列，得到正向测序数据和反向测序数据的方法为：
4.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，对所述正向测序数据和所述反向测序数据提取barcode序列，得到目标数据的方法为：
5.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，所述对所述目标数据进行转换格式，得到fasta格式数据的方法为：
6.根据权利要求1所述的重组腺相关病毒组织分布鉴定的分析方法，其特征在于，所述根据得到的fasta格式数据，将反向barcode序列反向互补后，比较正向barcode序列与反向barcode序列是否一致，过滤不一致序列中与barcode序列错配多...
【专利技术属性】
技术研发人员：戴明星，张庆硕，
申请(专利权)人：瑞诺元苏州生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。