节水抗旱稻育种芯片（WDR6K）的探针组合、检测体系及应用制造技术

本发明专利技术公开一种水稻节水抗旱性能鉴定的分子探针组合、基因芯片、检测体系及应用，涉及分子生物学、基因组学、作物遗传育种及植物分子设计育种技术领域，本发明专利技术提供了在基因水平上鉴定水稻节水抗旱性能的5895个SNP位点组合，利用本发明专利技术提供的5895个SNP位点获得的分子探针组合、基因芯片、试剂盒能够对水稻节水抗旱性能进行遗传评估，以适应干旱背景下水稻育种的需求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物学、基因组学、作物遗传育种及植物分子设计育种，更具体的说是涉及节水抗旱稻育种基因芯片wdr6k的探针组合、检测体系及应用。

技术介绍

1、水稻作为单子叶植物研究中的模式植物，同时也是全球最重要的粮食作物，面对目前全球日益升高的温度和部分地区极度缺水的情况，水稻抗旱育种迫在眉睫，建立一套快速高效、成熟稳定、成本低的抗旱育种方式是水稻抗旱育种的一大挑战。

2、基因组育种是目前作物育种的主流手段，基因组育种指的是将分子生物学技术应用于育种中，在基因组水平上进行育种。其有三点优势：第一，可对植物种子或者幼苗在分子水平进行鉴定，进行前景选择，加快育种进程并提高育种精度；第二，分子生物学检测及分析流程的固定，可以大大降低个人经验对育种材料选择的影响；第三，通过基因组育种中的标记技术可以进行背景选择，从而保证育种过程中的稳定性。分子标记技术(molecularmarker technologies)是基因组育种中的一个重要工具，该技术已经对作物的功能基因组研究及遗传改良做出了巨大的贡献。其中snp(single nucleotide p本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.5895个SNP位点组合在水稻节水抗旱性鉴定与育种中的应用，其特征在于，所述5895个SNP位点组合的位点物理信息如表1和表2所示，所述表1和表2中的位点组合的物理位置信息基于水稻参考基因组MSU7.0序列比对确定。

2.根据权利要求1所述5895个SNP位点组合在水稻节水抗旱性鉴定与育种中的应用，其特征在于，所述5895个SNP位点组合通过下述方法获得：

3.根据权利要求2所述5895个SNP位点组合在水稻节水抗旱性鉴定与育种中的应用，其特征在于，获得5895个SNP位点组合的方法中优先考虑陆稻-水稻分化水平较高、且对基因功能产生潜在影响的非同义SNP或3’...

【技术特征摘要】

1.5895个snp位点组合在水稻节水抗旱性鉴定与育种中的应用，其特征在于，所述5895个snp位点组合的位点物理信息如表1和表2所示，所述表1和表2中的位点组合的物理位置信息基于水稻参考基因组msu7.0序列比对确定。

2.根据权利要求1所述5895个snp位点组合在水稻节水抗旱性鉴定与育种中的应用，其特征在于，所述5895个snp位点组合通过下述方法获得：

3.根据权利要求2所述5895个snp位点组合在水稻节水抗旱性鉴定与育种中的应用，其特征在于，获得5895个snp位点组合的方法中优先考虑陆稻-水稻分化水平较高、且对基因功能产生潜在影响的非同义snp或3’/5’-utr snp。

4.鉴定评价水稻抗旱性的方法，其特征在于，将待测水稻样本的基因组dna的5895个snp位点基因型与对照水稻基因组dna的所述5895个...

【专利技术属性】
技术研发人员：夏辉，刘毅，李自明，王磊，马孝松，张安宁，罗利军，
申请(专利权)人：上海市农业生物基因中心，
类型：发明
国别省市：