System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法及应用技术_技高网

生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法及应用技术

技术编号:41313803 阅读:4 留言:0更新日期:2024-05-13 14:56
本发明专利技术公开了生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法及应用,属于微生物基因工程技术领域。本发明专利技术通过反向PCR鉴定得到生物膜分散调控基因kinA,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;通过重叠PCR获得敲除kinA基因的目的片段,即生物膜分散调控基因kinA的敲除片段;将该片段通过化学转化的方法导入野生型FZB42,得到kinA敲除株△kinA。△kinA菌株与野生型FZB42相比,分泌吲哚乙酸(IAA)的水平显著提高;色氨酸合成基因trpB、trpC及吲哚乙酸(IAA)合成基因ysnE的相对表达水平均显著上升。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于微生物基因工程,更具体地说,涉及生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法及应用。


技术介绍

1、瓦雷兹芽孢杆菌(bacillus velezensis)fzb42是革兰氏阳性植物根际促生菌,它在1998年从德国甜菜根际分离并在2007年作为第一个解淀粉芽孢杆菌进行了全基因组测序。fzb42已经商品化,其以生物膜方式定殖于植物根部并促进植物生长。细菌生物膜的发育是一个复杂的循环过程,包括初始附着、形成、成熟和分散等环节。除了形成生物膜帮助定殖外,fzb42还可以合成吲哚乙酸(iaa)促进植物生长。fzb42作为植物根际促生菌拥有广泛的应用前景,因此分析其促生机理具有深远的意义。

2、fzb42已完成全基因组测序,这为筛选生物膜调控基因提供了前提。鉴于生物膜对fzb42定殖是发挥其促生功能的关键因素,因此筛选fzb42生物膜调控基因有助于发掘其促生价值。

3、芽孢杆菌形成芽孢以在营养物质的培养中存活。多年来,控制芽孢形成的复杂调控网络已被逐步阐明。五种组氨酸激酶,即kina、kinb、kinc、kind和kine,感知并传递环境信号,最终导致spo0a磷酸化,spo0a是产孢基因的中心转录调节因子。

4、kina是磷酸酯酶中调节芽孢形成的主要组氨酸激酶。在饥饿和应激时,kina自身磷酸化,并通过spo0f和spo0b将其磷酸盐转移到spo0a。kina有三个pas结构域,用于感应细胞的氧化还原状态,它的转录受稳定期sigma因子σh的控制。

5、然而关于kina在生物膜分散中的作用未有相关文献报导,也没有关于其与促生物质iaa的生成之间的相关研究。


技术实现思路

1、针对现有技术存在的上述问题,本专利技术所要解决的技术问题在于提供生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法,用于构建生物膜分散调控基因kina敲除株;本专利技术所要解决的另一技术问题在于提供生物膜分散调控基因kina敲除株的应用,用于筛选优良促生菌株。

2、为了解决上述技术问题,本专利技术所采用的技术方案如下:

3、生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法,包括以下步骤:

4、1)构建生物膜分散调控基因kina敲除片段;

5、2)将所构建的生物膜分散调控基因kina敲除片段转化到瓦雷兹芽孢杆菌fzb42中;

6、3)培育筛选得到生物膜分散调控基因kina敲除株;

7、所述生物膜分散调控基因kina的核苷酸序列如seq id no.1所示。

8、所述生物膜分散调控基因kina敲除片段的核苷酸序列如seq id no.3所示。

9、所述生物膜分散调控基因kina敲除片段的敲除片段的构建方法为:基于生物膜分散突变文库,通过反向pcr鉴定得到生物膜分散调控基因kina,通过重叠pcr获得敲除kina基因的目的片段,即生物膜分散调控基因kina的敲除片段。

10、所述反向pcr引物序列如下:

11、fbo752-f:5’-gcttgtaaattctatcataattg-3’,

12、fbo753-r:5’-agggaatcatttgaaggttgg-3’。

13、任一所述的生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法构建得到的生物膜分散调控基因kina敲除株。

14、生物膜分散调控基因kina敲除株在促进瓦雷兹芽孢杆菌fzb42分泌吲哚乙酸中的应用。

15、生物膜分散调控基因kina敲除株在促进色氨酸合成基因trpb、trpc表达中的应用。

16、生物膜分散调控基因kina敲除株在促进吲哚乙酸合成基因ysne表达中的应用。

17、生物膜分散调控基因kina在抑制瓦雷兹芽孢杆菌fzb42分泌吲哚乙酸中的应用。

18、生物膜分散调控基因kina在抑制色氨酸合成基因trpb、trpc与吲哚乙酸合成基因ysne表达中的应用。

19、相比于现有技术,本专利技术的有益效果为:

20、1)本专利技术基于生物膜分散突变文库,反向pcr鉴定得到生物膜分散调控基因kina,通过重叠pcr获得敲除kina基因的目的片段,将该片段通过化学转化的方法导入野生型fzb42菌株得到kina敲除株△kina。

21、2)本专利技术△kina菌株与野生型fzb42相比,生物膜分散能力缺失。

22、3)本专利技术△kina菌株与野生型fzb42相比,分泌吲哚乙酸(iaa)的水平显著提高。

23、4)本专利技术△kina菌株与野生型fzb42相比,色氨酸合成基因trpb、trpc及吲哚乙酸(iaa)合成基因ysne的相对表达水平均显著上升。

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【技术保护点】

1.生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法,其特征在于,所述生物膜分散调控基因kinA敲除片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

3.根据权利要求1所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法,其特征在于,所述生物膜分散调控基因kinA敲除片段的构建方法为:基于生物膜分散突变文库,通过反向PCR鉴定得到生物膜分散调控基因kinA,通过重叠PCR获得敲除kinA基因的目的片段,即生物膜分散调控基因kinA的敲除片段。

4.根据权利要求3所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法,其特征在于,所述反向PCR引物序列如下:

5.权利要求1-4任一所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株的构建方法构建得到的生物膜分散调控基因kinA敲除株。

6.权利要求5所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株在促进瓦雷兹芽孢杆菌FZB42分泌吲哚乙酸中的应用。

7.权利要求5所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株在促进色氨酸合成基因trpB、trpC表达中的应用。

8.权利要求5所述的生物膜分散调控基因kinA敲除株在促进吲哚乙酸合成基因ysnE表达中的应用。

9.权利要求1所述的生物膜分散调控基因kinA在抑制瓦雷兹芽孢杆菌FZB42分泌吲哚乙酸中的应用。

10.权利要求1所述的生物膜分散调控基因kinA在抑制色氨酸合成基因trpB、trpC与吲哚乙酸合成基因ysnE表达中的应用。

...

【技术特征摘要】

1.生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法,其特征在于,所述生物膜分散调控基因kina敲除片段的核苷酸序列如seq id no.3所示。

3.根据权利要求1所述的生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法,其特征在于,所述生物膜分散调控基因kina敲除片段的构建方法为:基于生物膜分散突变文库,通过反向pcr鉴定得到生物膜分散调控基因kina,通过重叠pcr获得敲除kina基因的目的片段,即生物膜分散调控基因kina的敲除片段。

4.根据权利要求3所述的生物膜分散调控基因kina敲除株的构建方法,其特征在于,所述反向pcr引物序列如下:

5.权利要求1-4...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵银娟邵林樊奔
申请(专利权)人:南京林业大学
类型:发明
国别省市:

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