【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、本专利技术总体上涉及计算领域，并且更具体地涉及识别病原体特征。
2、病原体可以是引起疾病的生物体。不同类型的病原体以及它们引起的疾病的严重程度可能有所不同。病原生物可能有五种主要类型：病毒、细菌、真菌、原生动物、以及蠕虫。病原体的一些特征性特征可以包括但不限于包括：传播模式、复制机制、病原体引起疾病的发病机制或方式、以及病原体引发的反应。在理解和/或预测新病原体的特征时，研究者可以利用相关和/或充分理解的病原体。
3、直接分析新病原体可能需要结构域注释，这可能是耗时的并且导致确定可能的免疫靶点和/或有效治疗的延迟。
技术实现思路
1、本专利技术的实施例公开了用于病原体识别的方法、计算机系统和计算机程序产品。本专利技术可以包括基于靶病原体的基因组来鉴定一种或多种类似的病原体。本专利技术可以包括使用对应于所选条件的域代码搜索一种或多种类似病原体中每一种的注释基因组。本专利技术可以包括基于结构域代码鉴别一种或多种类似病原体中每一种的一种或多种表位和一种或多种表位的蛋白质区。本专利技术可以包括使用在一种或多种类似病原体的注释基因组中鉴定的一种或多种表位的氨基酸序列来搜索靶病原体的基因组。
【技术保护点】
1.一种用于病原体识别的方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中利用所述一种或多种表位的氨基酸序列搜索所述靶病原体的基因组进一步包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述一种或多种搜索方法至少包括精确字符串匹配和近似字符串匹配。
4.根据权利要求2所述的方法，进一步包括：
5.根据权利要求4所述的方法，进一步包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其中，根据相似性得分，对所述一种或多种治疗进行排序。
7.根据权利要求1所述的方法，其中，所选条件由用户使用病原体搜索用户界面来选择。
8.一种用于病原体识别的计算机系统，包括：
9.根据权利要求8所述的计算机系统，其中利用所述一种或多种表位的氨基酸序列搜索所述靶病原体的基因组进一步包括：
10.根据权利要求9所述的计算机系统，其中，所述一种或多种搜索方法至少包括精确字符串匹配和近似字符串匹配。
11.根据权利要求9所述的计算机系统，进一步包括：
12.根据权利要求11所述的计算机系统，
13.根据权利要求12所述的计算机系统，其中，根据相似性得分，对所述一种或多种治疗进行排序。
14.根据权利要求8所述的计算机系统，其中，所选条件由用户使用病原体搜索用户界面来选择。
15.一种用于病原体识别的计算机程序产品，包括：
16.根据权利要求15所述的计算机程序产品，其中利用所述一种或多种表位的所述氨基酸序列搜索所述靶病原体的基因组进一步包括：
17.根据权利要求16所述的计算机程序产品，其中，所述一种或多种搜索方法至少包括精确字符串匹配和近似字符串匹配。
18.根据权利要求16所述的计算机程序产品，进一步包括：
19.根据权利要求18所述的计算机程序产品，进一步包括：
20.根据权利要求19所述的计算机程序产品，其中，根据相似性得分，对所述一种或多种治疗进行排序。
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于病原体识别的方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中利用所述一种或多种表位的氨基酸序列搜索所述靶病原体的基因组进一步包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述一种或多种搜索方法至少包括精确字符串匹配和近似字符串匹配。
4.根据权利要求2所述的方法，进一步包括：
5.根据权利要求4所述的方法，进一步包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其中，根据相似性得分，对所述一种或多种治疗进行排序。
7.根据权利要求1所述的方法，其中，所选条件由用户使用病原体搜索用户界面来选择。
8.一种用于病原体识别的计算机系统，包括：
9.根据权利要求8所述的计算机系统，其中利用所述一种或多种表位的氨基酸序列搜索所述靶病原体的基因组进一步包括：
10.根据权利要求9所述的计算机系统，其中，所述一种或多种搜索方法至少包括精确字符串匹配和近似字符串匹配。
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【专利技术属性】
技术研发人员：A·阿加瓦尔，J·H·考夫曼，
申请(专利权)人：国际商业机器公司，
类型：发明
国别省市：
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