【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及法医物证，具体涉及一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法。
技术介绍
1、癌症是全世界的主要公共卫生问题。肿瘤的发病率和死亡率居高不下，是最常见的死亡原因之一。因肿瘤组织样本标记错误、混乱及污染等问题导致的医疗纠纷愈发频繁，涉及肿瘤组织溯源的司法鉴定案件也随之增加。因此，肿瘤组织的身源鉴定变得更加重要。如何准确进行肿瘤组织的身源鉴定仍是司法鉴定领域的难题，主要体现在以下两个方面：(1)肿瘤组织样本均为肿瘤细胞和正常细胞的混合样本，对于其较低组分的检出难度较大；(2)许多肿瘤在生长期间广泛存在str水平的突变，这些突变导致无法用常规的个体识别判定标准来进行鉴定，这也是目前最主要的鉴定难点。虽然基于毛细管电泳(capillaryelectrophoresis，ce)平台的str分型技术已开发出许多成熟的体系用于普通检材的个体识别，但在肿瘤组织个体识别中的应用还比较缺乏。
2、二代测序(next-generation sequencing，ngs)技术是目前生物学领域主流的基因分型方法，具有高通量、高灵敏度等技术特点。相较于传统的ce分型平台，更适合低拷贝数的分子检出。根据分子克隆学说，肿瘤组织是正常细胞与肿瘤细胞的混合物，因此，采用灵敏度更高的检测手段，更有助于目标基因的检出。虽然，专利cn117219162a与专利cn101921851a已建立了肿瘤组织身源鉴定方法，但是，该方法仅限于ce平台。随着分子生物学技术的革新，ngs技术得到了进一步的发展，广泛应用于法医物证溯源的各方面研究。基于两种平台在灵
3、目前，已有研究报道了基于ngs的肿瘤组织身源鉴定方法，但是其结果多以单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)标记为检测目标。由于绝大多数的法医学人群数据库均以str标记为目标，因而基于snp的肿瘤组织身源鉴定方法用处有限，str标记仍是司法鉴定领域最具实用性的分子标记。forenseq dna signature prep kit系统是目前最常用的ngs技术平台，有研究表明，基于该平台的27个str标记，可进行肿瘤组织身源鉴定。但是，该检测方法局限于检测平台的27个str组合，忽略了不同str分子对于检测结果的影响，使得稳定欠佳的标记被纳入计算范围，降低了鉴定方法系统效能。
4、因此，研发一种准确性更高的基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法是有必要的。
技术实现思路
1、针对现有技术的不足，本专利技术提供了一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，该方法可以用于对人类肿瘤组织样本进行精准溯源。
2、为实现以上目的，本专利技术通过以下技术方案予以实现：
3、本专利技术公开了一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，步骤如下：
4、a)将肿瘤组织样本与待测正常样本进行分型检测；
5、b)统计肿瘤组织样本与待测正常样本在步骤a)的结果中，基因座标记d3s1358、fga、d8s1179、vwa、d7s820、csf1po、d2s1338、d19s433、th01、tpox、d12s391、d6s1043、pentae、d4s2408和d20s482的分型结果；
6、c)统计肿瘤组织样本与待测正常样本在步骤b)的15个str标记上的共有等位基因数量；
7、d)计算判定结果；
8、e)根据肿瘤组织样本身源鉴定方法进行肿瘤组织样本身源的判断。
9、优选的，在步骤c)中，统计肿瘤组织样本与待测正常样本在15个str标记中，有2个相同分型的基因座数量，记作a2；当a2≥9时，排除肿瘤组织样本与待测正常样本来源于无关个体；当a2≥12时，判定肿瘤组织样本与待测正常样本来源于同一个体。
10、本专利技术具备以下有益效果：
11、本专利技术提供的一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，可以利用二代测序技术对15个str标记的分型结果，进行简单的计数统计，通用性好，计算更方便；相较于传统的str标记检测数据，灵敏度更高，更适用于法医学微量检材(特别是微量穿刺组织样本)的分型检测；相较于现有的str标记组合，本专利技术所用的15个str标记组合表现更稳定，准确性高。
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1.一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，其特征在于：步骤如下：
2.根据权利要求1所述的一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，其特征在于：在步骤c)中，统计肿瘤组织样本与待测正常样本在15个STR标记中，有2个相同分型的基因座数量，记作A2；当A2≥9时，排除肿瘤组织样本与待测正常样本来源于无关个体；当A2≥12时，判定肿瘤组织样本与待测正常样本来源于同一个体。
【技术特征摘要】
1.一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，其特征在于：步骤如下：
2.根据权利要求1所述的一种基于二代测序平台的肿瘤组织身源鉴定方法，其特征在于：在步骤c)中，统计肿瘤组织样本与...
【专利技术属性】
技术研发人员：李成涛，陈安琪，张素华，李士林，黄平，王红艳，陈吉，尤雪纯，
申请(专利权)人：复旦大学，
类型：发明
国别省市：
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