System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 不同PCR仪器间定量或定性检测结果同质化换算方法技术_技高网

不同PCR仪器间定量或定性检测结果同质化换算方法技术

技术编号:41284537 阅读:3 留言:0更新日期:2024-05-11 09:33
不同PCR仪器间定量或定性检测结果同质化换算方法,涉及医学检测技术领域,对于定量检测,利用仪器标准曲线及等比例计算方法进行换算。对于定性检测,步骤为:通过选择N个样本分别在参比仪器和测试仪器检测,获得N‑1对一一对应子线段,建立参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线,该标准曲线各为一根横线,横坐标为循环次数Cq值,纵坐标为仪器信号值;再对待测样本,获得其在测试仪器上荧光信号达到阈值线时对应Cq值的实际测试值,找到该实际测试值处于横线上的具体子直线段;再利用等比例计算方法计算出实际测试值对应到参比仪器上的同质化结果值。本发明专利技术可使不同仪器检测结果具有一致性和可比性,实现PCR检测结果互认。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及医学检测,特别涉及不同pcr仪器间定量或定性检测结果同质化换算方法。


技术介绍

1、聚合酶链反应(pcr)是一种在分子生物学和医学研究中广泛应用的技术。它将特定基因或序列的拷贝数通过测量pcr过程中dna模板产生的荧光信号进行量化。pcr具有灵敏度高、动态范围广等优点,因此被广泛应用于许多领域。pcr的检测原理是根据每个pcr循环中荧光的增加情况进行实时监测。扩增反应的定量循环cq值(又称ct值)定义为荧光达到定量阈值所需循环的次数。目标复制越多,达到定量阈值所需要的扩展周期就越小。这种简单的关系是原始pcr数据分析的基础,也是大部分pcr分析方法的出发点。pcr定性检测通常用于确定样品中是否存在特定的基因或dna序列,通过比较已知阳性样本和未知样本的扩增曲线,可以确定未知样本中是否存在相同的基因或dna序列。如果未知样本的扩增曲线与阳性样本的扩增曲线相似或一致,则可以认为未知样本是阳性的,即存在目标基因或dna序列。但不同医院使用的仪器和试剂不同,扩增效率和不同平台的阈值设置也有差异,这是导致检测结果在不同医院之间存在差异,从而无法互相比对和认可的主要原因。

2、因此,2009年stephen a等人发表文章规定了pcr结果想要发表需要提供的最少信息,旨在更好的解读pcr检测结果从而达到实验pcr结果的标准化。与此同时,为了实现pcr检测结果同质化这一目标,大部分国内外的研究学者主要从以下几个传统方面出发:1、标准化方法:研究人员通过制定和推广一致的实验操作方法和分析流程,以确保不同仪器在样品处理和数据分析等方面的一致性。这包括标准化反应体系、引物和探针设计、pcr条件等。2、校准样品:研究人员使用特定的校准样品来评估不同仪器之间的差异,并建立校准曲线或校准模型。这样可以通过校准样品的测量结果来对不同仪器的数据进行校正和比较。3、多中心研究:通过多个独立实验室之间的合作研究,针对不同仪器进行大规模的样本测试和数据比较,以评估不同仪器之间的一致性和可比性。4、质量控制和认证:研究人员对pcr仪器进行质量控制和认证,确保其性能和准确性。这包括仪器的校准和维护,以及参与相关质量认证项目。5、数据分析和统计方法:研究人员开发和应用不同的数据分析和统计方法,以评估不同仪器之间的结果差异,并提供一致性和可比性的指标。

3、近年来,有部分学者开始尝试通过数学算法来解决不同仪器检测间结果差异这一问题。相比于传统的方法,数学算法只需通过数学计算的过程,从而就可解决不同仪器之间的结果差异问题,无需对仪器进行仪器校正、标准曲线校标等工作,这对于实验室、仪器制造商以及国家医疗系统可以节省大量的人力和财力成本。如aldo clerico小组在2020年的研究中采用百分位转换和重新校准数学算法实现tsh检测结果的协调化,这一研究为实现不同仪器检测结果之间具有可比性和一致性提供了新的方向和策略。aldo clerico通过收集125,419个来自7个不同实验室的3种检测仪器的tsh检测结果,对这些tsh数值进行百分位数转换和自举分布从而推导出不同的校正方程,以实现不同仪器检测结果的协调化。

4、结果同质化发展需要多方面的努力和推动,包括标准化和规范化、实验室认可和认证、信息化和数字化、人工智能和大数据分析以及跨学科合作等。目前还没有相关文献和研究报道通过数学算法的方法实现不同仪器pcr检测结果同质化。


技术实现思路

1、基于以上问题,本专利技术的目的在于提供不同pcr仪器间定量或定性检测结果同质化换算方法,实现不同仪器检测结果间具有一致性和可比性,进而实现pcr检测结果相互认可。

2、对于定量检测,本专利技术实现其专利技术目的所采用的技术方案是,不同pcr仪器间定量检测结果同质化换算方法,包括下述步骤:

3、s1、选取两台pcr仪器,一台作为参比仪器,另一台作为测试仪器,通过梯度稀释标准品n个梯度得到的n个样本分别在两台仪器上检测,分别获得参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线,其纵坐标为循环次数cq值,横坐标为初始样本浓度对数值;所述参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线均由多段子直线段组成,每一段子直线段的第一端点对应一个样本,第二端点与下一段子直线段的第一端点重合;

4、所述标准曲线是仪器根据检测结果输出的曲线;

5、s2、对待测样本,获得其在测试仪器上的初始样本浓度对数值的实际测试值,找到所述初始样本浓度对数值的实际测试值处于测试仪器标准曲线上的具体子直线段,同时找到对应的参比仪器标准曲线上的具体子直线段;

6、s3、在步骤s2中确定的两段具体子直线段上,利用等比例计算方法,先求出比例值,再计算出所述初始样本浓度对数值的测试值对应到参比仪器标准曲线上的同质化结果值。

7、等比例计算是指:测试值到测试仪器曲线上对应子直线段第一端点的距离与该子直线段长度的比例,等于同质化结果值到参比仪器曲线上对应子直线段第一端点的距离与该子直线段长度的比例。

8、进一步,所述比例值,其中xn为待测样本在测试仪器上的初始样本浓度对数值的实际测试值,xi-1为测试仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的初始样本浓度对数值,xi为测试仪器标准曲线上对应子直线段第二端点的初始样本浓度对数值。

9、更进一步,所述参比仪器标准曲线上的初始样本浓度对数值的同质化结果值为:,其中为参比仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的初始样本浓度对数值,为参比仪器标准曲线上对应子直线段第二端点的初始样本浓度对数值。

10、对于定性检测,本专利技术实现其专利技术目的所采用的技术方案是,不同pcr仪器间定性检测结果同质化换算方法,包括下述步骤:

11、s1、选取两台pcr仪器,一台作为参比仪器,另一台作为测试仪器,通过cq值为均匀分布于参比仪器检测范围的n个样本分别在两台仪器上检测,首先分别获得参比仪器扩增曲线和测试仪器扩增曲线,其横坐标为循环次数cq值,纵坐标为应过程中实时荧光强度为纵坐标,再利用所述参比仪器扩增曲线和测试仪器扩增曲线分别获得参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线,所述参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线各为一根横线,所述横线的横坐标为循环次数cq值,纵坐标分别等于参比仪器和测试仪器的仪器阈值,所述仪器阈值为提前设定的反应过程中荧光强度阈值;所述参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线均由多段子直线段组成,每一段子直线段的第一端点对应一个样本,第二端点与下一段子直线段的第一端点重合;

12、所述扩增曲线是仪器根据检测结果输出的曲线;而参比仪器标准曲线和测试仪器标准曲线各为一根横线,这两根横线是本专利技术根据n个样本检测后获得的扩增曲线及仪器阈值而建立的标准曲线,用于后续转换计算;

13、仪器阈值的默认设置通常是仪器3~15个循环的荧光信号的标准差的10倍;

14、s2、对待测样本,获得其在测试仪器上荧光信号达到阈值线时对应的循环次数cq值的实际测试值,找到所述实际测试值处于测试仪器曲线上的具体子直线段,同时找到对本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.不同PCR仪器间定量检测结果同质化换算方法,其特征在于,包括下述步骤:

2.根据权利要求1所述的不同PCR仪器间定量检测结果同质化换算方法,其特征在于:所述比例值其中XN为待测样本在测试仪器上的初始样本浓度对数值的实际测试值,Xi-1为测试仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的初始样本浓度对数值,Xi为测试仪器标准曲线上对应子直线段第二端点的初始样本浓度对数值。

3.根据权利要求2所述的不同PCR仪器间定量检测结果同质化换算方法,其特征在于:所述参比仪器标准曲线上的初始样本浓度对数值的同质化结果值为:其中为参比仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的初始样本浓度对数值,为参比仪器标准曲线上对应子直线段第二端点的初始样本浓度对数值。

4.不同PCR仪器间定性检测结果同质化换算方法,其特征在于,包括下述步骤:

5.根据权利要求4所述的不同PCR仪器间定性检测结果同质化换算方法,其特征在于:所述比例值,其中XM为待测样本在测试仪器上荧光信号达到阈值线时对应的循环次数Cq值的实际测试值,Xj-1为测试仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的荧光信号达到阈值线时的循环次数Cq值,Xj为测试仪器曲线上对应子直线段第二端点的荧光信号达到阈值线时的循环次数Cq值。

6.根据权利要求5所述的不同PCR仪器间定性检测结果同质化换算方法,其特征在于:所述参比仪器标准曲线上的循环次数Cq同质化结果值为:,其中为参比仪器曲线上对应子直线段第一端点的荧光信号达到阈值线时的循环次数Cq值,为参比仪器曲线上对应子直线段第二端点的荧光信号达到阈值线时循环次数Cq值。

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【技术特征摘要】

1.不同pcr仪器间定量检测结果同质化换算方法,其特征在于,包括下述步骤:

2.根据权利要求1所述的不同pcr仪器间定量检测结果同质化换算方法,其特征在于:所述比例值其中xn为待测样本在测试仪器上的初始样本浓度对数值的实际测试值,xi-1为测试仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的初始样本浓度对数值,xi为测试仪器标准曲线上对应子直线段第二端点的初始样本浓度对数值。

3.根据权利要求2所述的不同pcr仪器间定量检测结果同质化换算方法,其特征在于:所述参比仪器标准曲线上的初始样本浓度对数值的同质化结果值为:其中为参比仪器标准曲线上对应子直线段第一端点的初始样本浓度对数值,为参比仪器标准曲线上对应子直线段第二端点的初始样本浓度对数值。

4.不同pcr仪器间定性检测结...

【专利技术属性】
技术研发人员:武永康周鑫鄢骑兵武宇翔
申请(专利权)人:四川大学华西医院
类型:发明
国别省市:

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