一种蒙古冰草母系来源特有的SNP位点、分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种蒙古冰草母系来源特有的SNP位点、分子标记及其应用，属于分子生物学及植物分子育种技术领域。所述SNP位点位于蒙古冰草叶绿体基因组MH285848.1的第27375位碱基处，该SNP位点存在G/A突变。根据该SNP位点设计出一组KASP引物组合，能够实现对冰草母系的溯源鉴定，该方法具有操作简便、成本低廉、检测周期短和标记稳定等优点。同时在基因组水平上拓展了冰草可用标记位点的范围；为冰草种质资源鉴定、育种、亲缘关系评价以及细胞质遗传特性等研究提供了新的思路和方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物学及植物分子育种，特别是涉及一种蒙古冰草母系来源特有的snp位点、分子标记及其应用。

技术介绍

1、叶绿体是绿色植物进行光合作用的细胞器，拥有自身完整的一套基因组，称为叶绿体基因组。叶绿体基因组结构非常保守，dna一般为双链环状分子，高等植物中叶绿体基因组大小一般为120-160kb。双链环形dna有4个基本部分组成，分别是大单拷贝区(largesingle copy region，lsc)，小单拷贝区(small single copy region，ssc)以及两个反向重复区(inverted repeats，irs)。叶绿体基因组信息由于具有以下优势而被广泛应用于植物品种和种质资源鉴定、亲缘关系评价、系统进化以及母系溯源等研究和应用中：(1)叶绿体基因组较小且相对保守，其全序列容易获得；(2)叶绿体基因是母系遗传，不同个体间基因的交换和融合很少发生，叶绿体各基因间有很好的共线性；(3)叶绿体基因组除反向重复区外均为单拷贝基因，几乎不存在旁系同源基因干扰；(4)叶绿体编码区与非编码区进化速度差异显著，存在一些高突变区，可以解决种以本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蒙古冰草母系来源特有的SNP位点在鉴定冰草母系来源中的应用，其特征在于，所述SNP位点位于蒙古冰草叶绿体基因组MH285848.1的第27375位碱基处，该SNP位点存在G/A突变。

2.一种蒙古冰草母系来源特有的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在第123位碱基处存在G/A突变，该位点的基因型包括GG、AA和GA基因型。

3.一种检测权利要求2所述分子标记的KASP引物组，其特征在于，包括核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的上游引物K27375-FA、核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的上游引物K2737...

【技术特征摘要】

1.一种蒙古冰草母系来源特有的snp位点在鉴定冰草母系来源中的应用，其特征在于，所述snp位点位于蒙古冰草叶绿体基因组mh285848.1的第27375位碱基处，该snp位点存在g/a突变。

2.一种蒙古冰草母系来源特有的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，在第123位碱基处存在g/a突变，该位点的基因型包括gg、aa和ga基因型。

3.一种检测权利要求2所述分子标记的kasp引物组，其特征在于，包括核苷酸序列如seq id no.2所示的上游引物k27375-fa、核苷酸序列如seq id no.3所示的上游引物k27375-fb和核苷酸序列如seq id no.4所示的下游引物k27375-r。

4.一种权利要求2所述分子标记的检测试剂盒，其特征在于，包含权利要求3所述的kasp引...

【专利技术属性】
技术研发人员：沙莉娜，文泽隆，凡星，张越，颜浩，马啸，程怡然，吴丹丹，王益，康厚扬，周永红，
申请(专利权)人：四川农业大学，
类型：发明
国别省市：