【技术实现步骤摘要】
本专利技术明具体涉及遗传工程中的玉米开花期抗旱性相关的indel分子标记开发与应用领域。
技术介绍
1、玉米(zea mays l.)世界上最重要的粮食作物之一，也是我国种植面积最大、总产最多的粮食作物，在保障粮食安全中发挥了重要的作用。然而我国玉米种植面积的65％分布在干旱和半干旱的雨养农业地区，干旱造成的玉米减产严重威胁国家粮食安全。抗旱玉米品种培育和推广应用是应对干旱危害的主要策略。开花期是玉米对水分最为敏感的时期，作为一种异花授粉作物，开花期受旱将导致散粉-吐丝花期不遇，平均造成籽粒减产约40％，这一时期受旱是所有生育时期中减产最为严重阶段。因此，利用优异的抗旱玉米种质资源，挖掘优异等位基因并开发分子标记，对玉米抗旱分子育种具有重要的理论和应用价值。
技术实现思路
1、本专利技术解决的技术问题是如何提供一种玉米开花期抗旱性相关的indel分子标记。
2、为了解决上述问题，本专利技术提供了下述应用。
3、indel分子标记或检测所述indel分子标记的物质的下述任一种的应用：
4、a1)在鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔中的应用和/或制备鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔的产品中的应用；
5、a2)在鉴定或辅助鉴定玉米散粉期中的应用和/或制备鉴定或辅助鉴定玉米玉米散粉期的产品中的应用；
6、a3)在鉴定或辅助鉴定吐丝期中的应用和/或制备鉴定或辅助鉴定玉米玉米吐丝期的产品中的应用；
7、a4)在制备玉
8、所述indel分子标记是核苷酸序列为序列2中的第91位-102位的dna分子。
9、上文中，吐丝期是从播种日至植株雌穗的花丝从苞叶中伸出2cm的天数。散粉期(开花期)是从播种日至植株雄穗开始散粉的天数。散粉-吐丝间隔是散粉期和吐丝期之间的间隔时间。
10、上文中，所述散粉期与吐丝期间隔可为干旱胁迫条件下的玉米散粉期与吐丝期间隔。
11、上文中，所述散粉期可为干旱胁迫条件下的散粉期。
12、上文中，所述吐丝期可为干旱胁迫条件下的吐丝期。
13、所述物质可为产品。所述检测物质可包括检测上述indel分子标的试剂、试剂盒和仪器。具体的说，为检测上述indel分子标进行核酸体外扩增所需的引物和/或其他试剂和仪器。
14、为了解决上述问题，本专利技术还提供了产品。
15、所述产品为含有上述检测所述indel分子标记的物质，且可为下述g1)-g3)中的任一种：
16、g1)检测所述indel分子标记的产品；
17、g2)鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔中的应用和/或制备鉴定或辅助鉴定玉米玉米散粉期与吐丝期间隔的产品中的应用；
18、g3)鉴定或辅助鉴定玉米散粉期中的应用和/或制备鉴定或辅助鉴定玉米玉米散粉期的产品中的应用；
19、g4)鉴定或辅助鉴定吐丝期间隔中的应用和/或制备鉴定或辅助鉴定玉米玉米吐丝期的产品中的应用；
20、g5)制备玉米育种产品中的应用。
21、为了解决上述问题，本专利技术还提供了鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔的方法。
22、所述方法包括检测玉米基因组中是否含有上述的indel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述indel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔：
23、所述基因型为插入型的玉米的散粉期与吐丝期间隔短于或候选短于所述基因型为缺失型的玉米的散粉期与吐丝期间隔，所述插入型是存在上述indel分子标记的纯合型，所述缺失型是不存在上述indel分子标记的纯合型。
24、为了解决上述问题，本专利技术还提供了鉴定或辅助鉴定玉米散粉期的方法。
25、所述方法包括检测玉米基因组中是否含有上述的indel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述indel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米散粉期：
26、所述基因型为插入型的玉米的散粉期早于或候选早于所述基因型为缺失型的玉米的散粉期，所述插入型是存在上述indel分子标记的纯合型，所述缺失型是不存在上述indel分子标记的纯合型。
27、为了解决上述问题，本专利技术还提供了鉴定或辅助鉴定玉米吐丝期的方法。
28、所述方法包括检测玉米基因组中是否含有上述的indel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述indel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米吐丝期：
29、所述基因型为插入型的玉米的吐丝期早于或候选早于所述基因型为缺失型的玉米的吐丝期，所述插入型是存在上述indel分子标记的纯合型，所述缺失型是不存在上述indel分子标记的纯合型。
30、上文中，含有所述indel分子标记的玉米散粉期早于或候选早于不携带所述indel分子标记的玉米的散粉期。
31、上文中，含有所述indel分子标记的玉米吐丝期早于或候选早于不携带所述indel分子标记的玉米的吐丝期。
32、上文中，含有所述indel分子标记散粉期与吐丝期间隔短于或候选短于不携带所述indel分子标记的玉米的散粉期与吐丝期间隔。
33、上文中，吐丝期是从播种日至植株雌穗的花丝从苞叶中伸出2cm的天数。散粉期(开花期)是从播种日至植株雄穗开始散粉的天数。散粉-吐丝间隔是散粉期和吐丝期之间的间隔时间。
34、上文中，缺失型是序列3第90位-91位之间不存在核苷酸是seq id no.1的纯合型。
35、上文中，插入型是序列3第90位-91位之间存在核苷酸是seq id no.1的纯合型。
36、上文中，缺失型的基因组的两条同源染色体均具有如下特征：基因组中序列3(seqidno.3)的第90位-91位之间不存在核苷酸是seq id no.1的12个核苷酸的插入。基因型为缺失型的玉米为缺失型单株。
37、上文中，插入型(的基因组的两条同源染色体均具有如下特征：基因组中序列3(seq idno.3)的第90位-91位之间存在核苷酸是seq id no.1的12个核苷酸的插入。基因型为插入型的玉米为插入型单株。
38、为了解决上述问题，本专利技术还提供了玉米育种的方法。
39、所述方法包括选择基因组中含有上述indel分子标记的纯合型玉米作为亲本进行育种。
40、上文中，上述方法在玉米育种中的应用。
41、上述的应用、产品火方法中，所述育种的目的包括培育或选育散粉期早和/或吐丝期早和/或散粉期与吐丝期间隔短的玉米。
42、上述的应用、产品、方法或上述的应用、产品或方法中，所述检测所述indel分子标记的物质为如下d1)、d2)、d3)或d4)：
43、d1)含有特异性扩增indel分子标记的体外核酸扩增引物；
44、d2)含有d1)所述体外核酸扩增引物的体外核酸扩增试剂；
45、d3)含有d1)本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.InDel分子标记或检测所述InDel分子标记的物质的下述任一种的应用：
2.产品，其特征在于，所述产品为含有权利要求1或2所述检测所述InDel分子标记的物质，且可为下述G1)-G3)中的任一种：
3.鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔的方法，其特征在于，所述方法包括检测玉米基因组中是否含有权利要求1所述的InDel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述InDel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔：
4.鉴定或辅助鉴定玉米散粉期的方法，其特征在于，所述方法包括检测玉米基因组中是否含有权利要求1所述的InDel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述InDel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米散粉期：
5.鉴定或辅助鉴定玉米吐丝期的方法，其特征在于，所述方法包括检测玉米基因组中是否含有权利要求1所述的InDel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述InDel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米吐丝期：
6.玉米育种的方法，包括选择基因组中含有权利要求1所述InDel分子标记的纯合型玉米作为亲本进行育种。
7.根据
8.权利要求1所述的应用、权利要求2所述的产品、权利要求3-6任一所述的方法或权利要求7所述的应用、产品或方法，其特征在于，所述检测所述InDel分子标记的物质为如下D1)、D2)、D3)或D4)：
9.权利要求1所述的应用、权利要求2所述的产品、权利要求3-6任一所述的方法或权利要求7或8所述的应用、产品或方法，其特征在于，所述检测InDel分子标记或基因型的物质，或所述检测单倍型的物质，为如下D1)、D2)、D3)或D4)：
10.DNA分子，其特征在于，所述DNA分子是核苷酸序列为序列2的DNA分子。
...【技术特征摘要】
1.indel分子标记或检测所述indel分子标记的物质的下述任一种的应用：
2.产品，其特征在于，所述产品为含有权利要求1或2所述检测所述indel分子标记的物质，且可为下述g1)-g3)中的任一种：
3.鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔的方法，其特征在于，所述方法包括检测玉米基因组中是否含有权利要求1所述的indel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述indel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米散粉期与吐丝期间隔：
4.鉴定或辅助鉴定玉米散粉期的方法，其特征在于，所述方法包括检测玉米基因组中是否含有权利要求1所述的indel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述indel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米散粉期：
5.鉴定或辅助鉴定玉米吐丝期的方法，其特征在于，所述方法包括检测玉米基因组中是否含有权利要求1所述的indel分子标记，根据玉米基因组中是否含有所述indel分子标记鉴定或辅助鉴定玉米吐丝期：...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘旭洋，胡悦，陶柯宇，李春辉，李永祥，张登峰，何冠华，王天宇，黎裕，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：
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