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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物医药,具体涉及呼出冷凝液微生物菌属组合、试剂盒及在预测新冠感染后咳嗽中的应用。
技术介绍
1、随着新冠病毒在全球的持续传播,越来越多的患者报告了持续和长期的症状,其中持续至少2个月,慢性咳嗽是与covid-19相关的最常见的呼吸道症状之一。全面了解新冠病毒omicron毒株感染后的长期健康影响和潜在危险因素对公共卫生至关重要。
2、呼出气冷凝液(ebc)样本采用无创方法收集,含有水蒸气和呼吸气溶胶的混合物,是一种容易获得的生物标本,可以从健康人群和患者身上收集。由于其内容物包括内源性微生物,因此ebc中的微生物与患者疾病和恢复相关。ebc已用于多项临床和转化研究,如;监测哮喘、过敏、药物使用、炎症、氧化应激、职业暴露和公共卫生方面。代谢物作为气道炎症反应和疾病的调节因子,可能在疾病的发生发展中发挥重要作用。然而,在评估感染omicron的健康成人前后的ebc中,微生物的使用尚未得到很好的探讨,它们与慢性炎症和咳嗽症状的关系仍不清楚。因此探讨健康成人omicron感染前后呼吸道我微生态的动态变化,以确定其与康复和咳嗽症状的关系具有十分重要的临床意义。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提出呼出冷凝液代谢物组合标志物,通过组合标志物,能够实现对新冠感染后咳嗽的高灵敏、高特异性预测,为临床预测提供有力参考。
2、鉴于此,本专利技术的方案如下:
3、本专利技术的第一个方面在于,提出用于预测新冠感染后咳嗽的呼出冷凝液微生物菌属组合,包
4、本专利技术的第二个方面在于,提出检测第一个方面所述呼出冷凝液微生物菌属组合的试剂在制备预测新冠感染后咳嗽试剂盒中的应用。
5、进一步地,所述检测试剂包括16s rrna基因v3-v4可变区特异性扩增引物。
6、优选地,所述引物的核苷酸序列如seq id no:1-2所示。
7、进一步地,所述试剂盒用于预测新冠感染后咳嗽过程包括如下步骤:
8、1)取受试者呼出冷凝液样品提取溶液,检测得到提取液中的链球菌属相对含量a、嗜血杆菌属相对含量b、无色杆菌属相对含量c、奈瑟氏菌属相对含量d、罗氏菌属相对含量e、孪生球菌属相对含量f、和梭杆菌属相对含量g;
9、2)计算新冠感染后咳嗽概率prob,若prob>0.62,则预测受试者新冠感染后咳嗽;所述新冠感染后咳嗽概率的计算方法为:prob=1/(1+e-x),其中:
10、x=-0.026a*103+0.009b*103+0.016c*103-0.083d*103+0.096e*103+0.57f*103+
11、0.083g*103-12.527。
12、本专利技术的第三个方面在于,提出用于预测新冠感染后咳嗽的系统,包括:
13、样本收集处理单元:用于收集待测者呼出冷凝液并处理得到提取液样本;
14、检测单元:用于检测提取液样本中的链球菌属相对含量a、嗜血杆菌属相对含量b、无色杆菌属相对含量c、奈瑟氏菌属相对含量d、罗氏菌属相对含量e、孪生球菌属相对含量f、和梭杆菌属相对含量g;
15、预测单元:用于计算新冠感染后咳嗽概率prob,若prob>0.62,则预测受试者新冠感染后咳嗽;所述新冠感染后咳嗽概率的计算方法为:prob=1/(1+e-x),其中:x=-0.026a*103+0.009b*103+0.016c*103-0.083d*103+0.096e*103+0.57f*103+0.083g*103-12.527。
16、进一步地,所述检测单元基于16s rrna基因v3-v4可变区设计特异性扩增引物进行检测。
17、优选地,所述引物的核苷酸序列如seq id no:1-2所示。
18、与现有技术相比,本专利技术有益效果包括但不限于:
19、本专利技术提供的呼出冷凝液中代谢物吲哚乙酸和甲基谷氨酸可以联合用于新冠感染后咳嗽患者的预测;通过本专利技术涉及的组合标志物,对新冠感染后咳嗽的高灵敏、高特异性预测,为临床预测提供有力参考。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.用于预测新冠感染后咳嗽的呼出冷凝液微生物菌属组合,其特征在于,包括链球菌属、嗜血杆菌属、无色杆菌属、奈瑟氏菌属、罗氏菌属、孪生球菌属和梭杆菌属。
2.检测权利要求1所述呼出冷凝液微生物菌属组合的试剂在制备预测新冠感染后咳嗽试剂盒中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测试剂包括16S rRNA基因V3-V4可变区特异性扩增引物。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-2所示。
5.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂盒用于预测新冠感染后咳嗽过程包括如下步骤:
6.用于预测新冠感染后咳嗽的系统,其特征在于,包括:
7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述检测单元基于16S rRNA基因V3-V4可变区设计特异性扩增引物进行检测。
8.根据权利要求7所述的系统,其特征在于,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-2所示。
【技术特征摘要】
1.用于预测新冠感染后咳嗽的呼出冷凝液微生物菌属组合,其特征在于,包括链球菌属、嗜血杆菌属、无色杆菌属、奈瑟氏菌属、罗氏菌属、孪生球菌属和梭杆菌属。
2.检测权利要求1所述呼出冷凝液微生物菌属组合的试剂在制备预测新冠感染后咳嗽试剂盒中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测试剂包括16s rrna基因v3-v4可变区特异性扩增引物。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述引物的核苷酸序列...
【专利技术属性】
技术研发人员:金阳,许娟娟,罗萍,曹兴辉,胡远洋,梁梦圆,周梅,
申请(专利权)人:华中科技大学同济医学院附属协和医院,
类型:发明
国别省市:
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