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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,特别是涉及线粒体病相关iars2基因突变位点及其应用。
技术介绍
1、leigh综合征(ls),又称亚急性坏死性脑病,是由线粒体或核基因突变引起的儿童期最常见的线粒体疾病。ls由denis archibald leigh于1951年首次报道,患病率约为1:40,000。虽然ls的发病率低,但临床症状迅速恶化,并可能导致婴儿期死亡。ls主要特点是中枢神经系统(包括脑、脊髓和视神经)退行性变,表现为运动技能丧失、食欲不振、呕吐、易怒和/或癫痫发作,以及全身无力、肌张力缺乏、乳酸性酸中毒,进而导致心、肝、胃肠和肾小管功能障碍。目前已经报道了超过75个基因缺陷导致ls发生。ls与氧化磷酸化系统(oxphos)密切相关,80%的ls患者存在呼吸链酶复合物缺乏。虽然五种oxphos复合物缺陷都能导致ls发生,但复合物i缺乏最为常见,单独的复杂iv缺陷和多种oxphos缺陷也较常见,这为ls的临床诊断提供了生化缺陷的证据。
2、iars2编码线粒体异亮氨酰-trna合成酶,其是i类线粒体氨酰-trna合成酶(ars)。ars家族有37个成员,与细胞质或线粒体翻译相关。编码ars的基因突变可产生高度多样的临床表型,影响代谢需求特别高的组织。作为核编码的线粒体蛋白,iars2需要从细胞质输入到线粒体中,并催化异亮氨酸残基与同源mt-trna的连接。据报道,iars2缺乏可导致白内障、生长激素缺乏、感觉神经病、感觉神经性听力损失和ls,但iars2突变的发病机制和分子机制尚不清楚,还需进一步的探索研究。迄今为止,全球
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供线粒体病相关iars2基因突变位点及其应用,以解决上述现有技术存在的问题,本专利技术发现了iars2基因缺陷导致线粒体病发生的分子机制,并发现了iars2缺陷相关线粒体病的4个新变异位点,通过功能分析验证了位点的致病性,拓展了iars2基因突变谱,为iars2缺陷相关线粒体病的临床诊断和预测提供重要参考。
2、为实现上述目的,本专利技术提供了如下方案:
3、本专利技术提供线粒体病相关iars2基因突变位点,所述iars2基因突变位点包括c.1_390del、c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a中的一种或多种;
4、所述c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a突变位点依次位于iars2参考转录组序列的第2090、2122和2450位碱基处;其中,所述c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a突变位点碱基均突变为a;
5、所述c.1_390del突变位点的缺失片段位于iars2参考转录组序列的第1-390位碱基处;
6、所述iars2参考转录组序列登录号为nm_018060.4。
7、本专利技术还提供一种用于检测上述iars2基因突变位点的试剂在制备iars2基因缺陷相关线粒体病辅助诊断或预测试剂盒中的应用。
8、进一步地,所述试剂包含引物组。
9、进一步地,所述引物组包括:
10、检测所述c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a突变位点的如seq id no:1-2所示的引物;检测所述c.1_390del突变位点的如seq id no:3-4所示的引物。
11、进一步地,若所述c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a突变位点均突变为a,和/或所述c.1_390del突变位点缺失目的片段,判断患者罹患iars2基因缺陷相关线粒体病;
12、所述目的片段为iars2参考转录组序列的第1-390位碱基片段;所述iars2参考转录组序列登录号为nm_018060.4。
13、本专利技术还提供一种辅助诊断和预测iars2基因缺陷相关线粒体病的试剂盒,包含上述的引物组。
14、本专利技术公开了以下技术效果:
15、本专利技术发现了iars2基因缺陷导致线粒体病发生的分子机制,并发现了iars2缺陷相关线粒体病的4个新变异位点(c.1_390del、c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a),通过功能分析验证了位点的致病性,拓展了iars2基因突变谱,为iars2缺陷相关线粒体病的临床诊断和预测提供重要参考。
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1.线粒体病相关IARS2基因突变位点,其特征在于,所述IARS2基因突变位点包括c.1_390del、c.2090G>A、c.2122G>A和c.2450G>A中的一种或多种;
2.一种用于检测权利要求1所述IARS2基因突变位点的试剂在制备IARS2基因缺陷相关线粒体病辅助诊断或预测试剂盒中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂包含引物组。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述引物组包括:
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,若所述c.2090G>A、c.2122G>A和c.2450G>A突变位点均突变为A,和/或所述c.1_390del突变位点缺失目的片段,判断患者罹患IARS2基因缺陷相关线粒体病;
6.一种辅助诊断和预测IARS2基因缺陷相关线粒体病的试剂盒,其特征在于,包含权利要求4中所述的引物组。
【技术特征摘要】
1.线粒体病相关iars2基因突变位点,其特征在于,所述iars2基因突变位点包括c.1_390del、c.2090g>a、c.2122g>a和c.2450g>a中的一种或多种;
2.一种用于检测权利要求1所述iars2基因突变位点的试剂在制备iars2基因缺陷相关线粒体病辅助诊断或预测试剂盒中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂包含引物组。
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