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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及rna的分析方法。
技术介绍
1、作为核酸(dna、rna)的质谱分析方法之一,已知有使用基质辅助激光解吸电离(matrix assisted laser desorption/ionization:maldi)的质谱分析方法(以下称为maldi质谱分析。)。在maldi质谱分析中,为了将难以吸收激光束的物质、容易因激光束而受到损伤的物质电离,使用被称为基质的电离助剂。
2、例如,在核酸的maldi质谱分析方面,非专利文献1记载了使用3-羟基-2-吡啶甲酸(3-hydroxypicolinic acid:3-hpa)和1,5-二氨基萘(1,5-diaminonaphthalene:1,5-dan)作为基质。非专利文献2记载了使用2,4-二羟基苯乙酮(2,4-dihydroxyacetophenone:2,4-dhap)作为基质。非专利文献3记载了使用包含2,4,6-三羟基苯乙酮(2,4,6-trihydroxyacetophenone:2,4,6-thap)和2,3,4-三羟基苯乙酮(2,3,4-trihydroxyacetophenone:2,3,4-thap)的混合基质、以及包含邻氨基苯甲酸(anthranilicacid:aa)和烟酸(nicotinic acid:na)的混合基质作为基质。
3、基质通常制成溶解于规定溶剂的基质溶液,与包含分析对象物质的试样通过各种方法混合。例如,将基质溶液和试样溶液预先混合而制作试样/基质混合溶液,将该试样/基质混合溶液滴加于在被称为样品板的金属制的
4、现有技术文献
5、非专利文献
6、非专利文献1:nathan a.hagan,其他5人,"enhanced in-source fragmentationin maldi-tof-ms of oligonucleotides using1,5-diaminonapthalene",journal ofthe american society for mass spectrometry,(美国),2012,23,pp.773-777
7、非专利文献2:h.shimizu,其他6人,"application of high-resolution esi andmaldi mass spectrometry to metabolite profiling of small interfering rnaduplex",journal of mass spectrometry,(美国),2012,47,pp.1015-1022
8、非专利文献3:li-kang zhang,其他1人,"matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry methods for oligodeoxynucleotides:improvementsin matrix,detection limits,quantification,and sequencing",journal of theamerican society for mass spectrometry,(美国),2000,11,pp.854-865
技术实现思路
1、专利技术要解决的问题
2、以往,在使用作为核酸的maldi质谱分析用基质而已知的基质制备分析用试样时,试样/基质混合晶体不均匀地形成在孔上的情况较多。因此,即使为了得到作为分析对象物质的核酸的分子量相关离子([m+h]+或[m-h]-,m为分子,h为氢原子)而对孔上照射激光束,某些照射位置也无法得到足够量的分子量相关离子。如果能够对孔上的形成有试样/基质混合晶体且作为分析对象物质的试样分子的离子较为容易检测的位置(称为甜蜜点(sweetspot))照射激光束,则能够以充分的灵敏度检测良好的分子量相关离子峰,但是如果测定者不熟练则难以在短时间内找到这样的位置,导致分析耗费时间。
3、通过使用光栅扫描功能对孔上所形成的试样/基质混合晶体上进行激光照射,能够更容易更迅速地进行试样/基质混合晶体中所含的分析对象物质的质谱分析。但是,当试样/基质混合晶体在孔上形成得不均匀而孔上的晶体部位的偏差大、或者试样/基质混合晶体不均匀而混合晶体中的试样分布(位置)偏差大时,根据照射位置的不同,生成的分析对象物质的离子量容易产生偏差,例如容易产生如下情况:根据照射位置的不同,分析对象物质的分子量相关离子过度地生成,或者相反地未能生成足够量的分子量相关离子。
4、进而,相较于dna,对于rna而言,所报道的用于maldi质谱分析的基质种类少,另外,所报道的用于rna分析的现有基质容易产生上述问题。因此,期望rna的高灵敏度且迅速的分析方法。
5、本专利技术的课题在于,提供在使用maldi质谱分析来分析rna时能够高灵敏度、容易且迅速地检测分子量相关离子的方法。
6、用于解决问题的方案
7、为了解决上述课题而作出的本专利技术的rna的分析方法为下述方法:
8、使用包含2,4-二羟基苯乙酮(dhap)和2,4,6-三羟基苯乙酮一水合物(thap)的混合基质作为基质,利用基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对试样中所含的rna进行分析。
9、另外,为了解决上述课题而作出的本专利技术的rna的基质辅助激光解吸电离质谱分析用基质包含2,4-二羟基苯乙酮(dhap)和2,4,6-三羟基苯乙酮一水合物(thap)。
10、专利技术的效果
11、根据本专利技术的rna的分析方法,在使用基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对试样中所含的rna进行分析时,能够制作相对均匀的试样/基质混合晶体,能够高灵敏度、容易且迅速地检测分子量相关离子。另外,通过使用本专利技术的rna的基质辅助激光解吸电离质谱分析用基质制备包含rna的试样的分析用试样,从而在进行基质辅助激光解吸电离质谱分析时能够制作相对均匀的试样/基质混合晶体,能够高灵敏度、容易且迅速地检测分子量相关离子。因此,能够良好地对试样中的rna进行分析。
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1.一种RNA的分析方法,其使用包含2,4-二羟基苯乙酮(DHAP)和2,4,6-三羟基苯乙酮一水合物(THAP)的混合基质作为基质,利用基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对试样中所含的RNA进行分析。
2.根据权利要求1所述的RNA的分析方法,其中,所述混合基质的DHAP与THAP的混合比为30:1~10:1。
3.根据权利要求1所述的RNA的分析方法,其中,使用柠檬酸氢二铵作为所述混合基质的基质添加剂而对所述试样中所含的RNA进行分析。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的RNA的分析方法,其中,将包含RNA的试样溶液、包含DHAP的基质溶液、和包含THAP的基质溶液混合而制作试样/混合基质混合溶液,或将包含RNA的试样溶液与包含DHAP和THAP的混合基质溶液混合而制作试样/混合基质混合溶液,将该试样/混合基质混合溶液滴加于样品板上并干燥而制作试样/混合基质混合物,利用所述基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对所述试样/混合基质混合物进行测定。
5.根据权利要求1~3中任一项所述的RNA的分析方法,其中,将包含RNA的试样溶液、包含
6.根据权利要求1~3中任一项所述的RNA的分析方法,其中,将包含RNA的试样溶液、包含DHAP的基质溶液和包含THAP的基质溶液分别滴加到样品板上,在该样品板上制作试样/混合基质溶液,将该试样/混合基质溶液干燥而制作试样/混合基质混合物,利用所述基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对所述试样/混合基质混合物进行测定。
7.根据权利要求1~3中任一项所述的RNA的分析方法,其中,所述基质辅助激光解吸电离质谱分析装置为数字离子阱型。
8.一种RNA的基质辅助激光解吸电离质谱分析用基质,其包含2,4-二羟基苯乙酮(DHAP)和2,4,6-三羟基苯乙酮一水合物(THAP)。
...【技术特征摘要】
1.一种rna的分析方法,其使用包含2,4-二羟基苯乙酮(dhap)和2,4,6-三羟基苯乙酮一水合物(thap)的混合基质作为基质,利用基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对试样中所含的rna进行分析。
2.根据权利要求1所述的rna的分析方法,其中,所述混合基质的dhap与thap的混合比为30:1~10:1。
3.根据权利要求1所述的rna的分析方法,其中,使用柠檬酸氢二铵作为所述混合基质的基质添加剂而对所述试样中所含的rna进行分析。
4.根据权利要求1~3中任一项所述的rna的分析方法,其中,将包含rna的试样溶液、包含dhap的基质溶液、和包含thap的基质溶液混合而制作试样/混合基质混合溶液,或将包含rna的试样溶液与包含dhap和thap的混合基质溶液混合而制作试样/混合基质混合溶液,将该试样/混合基质混合溶液滴加于样品板上并干燥而制作试样/混合基质混合物,利用所述基质辅助激光解吸电离质谱分析装置对所述试样/混合基质混合物进行测定。
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