【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体涉及分析嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因的方法。
技术介绍
1、原生动物嗜热四膜虫是在淡水中普遍存在的单细胞模式动物，其基因组信息和毒理学研究数据丰富。近年来的研究表明嗜热四膜虫中含有丰富的重金属解毒遗传资源，比如嗜热四膜虫基因组中含有五种金属硫蛋白编码基因，分别编码金属硫蛋白mtt1、mtt2、mtt3、mtt4、mtt5，研究工作证实嗜热四膜虫基因组中的金属硫蛋白可以螯合重金属离子而解毒。但是关于嗜热四膜虫响应重金属的分子机制仍不清楚，嗜热四膜虫参与重金属耐受的相关基因也有待进一步挖掘。
2、各种组学分析技术可以帮助我们在不同层面进行生物毒理学研究，系统了解生物体在暴露于有毒物质后的分子机制，从而筛选可能应用于毒性物质风险监测和评估的关键基因表达产物或代谢物，并探索其作为生物标志物、制定预防和解决毒性物质的有效策略。细胞转录组水平差异可以反映细胞的整体基因表达信息，通过差异表达基因的功能注释可帮助我们发现细胞响应环境胁迫的可能代谢机制。随着二代测序技术的快速发展和测序成本的逐渐降低，基于高通量测序的转...
【技术保护点】
1.分析嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，提取培养的嗜热四膜虫的RNA包括提取在正常条件下和镉应激条件下培养不同时间的嗜热四膜虫的RNA。
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，培养时间为2小时、6小时或24小时。
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，对测序数据进行质控使用Trim Galore工具进行，Trim Galore识别低质量碱基和3'末端的接头序列，然后去除。
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，低质量碱基为质量分...
【技术特征摘要】
1.分析嗜热四膜虫镉耐受机制关联基因的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，提取培养的嗜热四膜虫的rna包括提取在正常条件下和镉应激条件下培养不同时间的嗜热四膜虫的rna。
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，培养时间为2小时、6小时或24小时。
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，对测序数据进行质控使用trim galore工具进行，trim galore识别低质量碱基和3'末端的接头序列，然后去除。
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，低质量碱基为质量分数小于20的碱基。
6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，利用将质控后的...
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