【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物学，特别是涉及一种与玉米花丝颜色相关的qtl、snp分子标记及应用。
技术介绍
1、玉米是我国第一大粮食作物，也是重要的粮饲作物，被广泛应用于食品，饲料，医药等多个领域。目前随着市场对肉蛋奶等需求量的增加，玉米的需求量也随之增加，良种培育也变的格外重要。花丝花青苷显色性状在玉米dus测试中为必测的基本性状，对于玉米品种审定和品种保护来说是一个重要的农艺性状。玉米的花丝颜色由于花青苷积累呈现绿色、粉色、红色、棕色和橙红色等几种。玉米的花丝颜色调控受多对基因控制，表现为数量性状遗传，彼此之间存在复杂的遗传关系。植物中的花青素属于水溶性色素，广泛存在于各种植物中，花青素属于多酚类物质。花青素在植物中大多都以花色素苷的形式存在，可以提高植物不同组织部位的环境胁迫的能力，提高对环境胁迫的抗性。
2、在玉米中，约有20个基因调控花青苷的产生，其中的关键基因包括a1(二氢黄酮醇-4-还原酶)、a2(花青素合酶)、c2(查尔酮合酶)、chi(查尔酮-黄酮异构酶)、bz1(udpg-类黄酮3-氧基葡萄糖转移酶)、bz2(谷胱甘肽s-转移酶)、pr1(类黄酮3'-单加氧酶)、fht1(黄酮3-双加氧酶)和aa1(花青素酰基转移酶)。所有花青素生物合成基因都受一个由r2r3-myb、myc样bhlh和wd40蛋白组成的蛋白复合体调控。
3、目前已定位到一些与花丝颜色相关的qtl，但由于受遗传群体、遗传背景、标记类型等因素的影响，得到的结果可比性差。随着近年来分子标记技术的发展，前人对玉米植株各部位颜色的遗
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种与玉米花丝颜色相关的qtl、snp分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题。
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、一种与玉米花丝花青苷显色性状相关的主效qtl，所述主效qtl命名为qsc5，所述qsc5位于玉米基因组的第5染色体，其标记区间为chr.05_19156257和chr.05_19800985。
4、本专利技术还提供所述qtl在玉米花丝颜色相关的分子标记辅助育种中的应用。
5、本专利技术提供一种与玉米花丝颜色相关的snp分子标记，所述分子标记位于玉米基因组第5号染色体上，包括突变位点snp 1和snp2；
6、所述snp 1为chr5-19156257，位于seq id no.1所示的核苷酸序列的第101位，该处碱基为t或c；
7、所述snp2为chr5-19800985，位于seq id no.2所示的核苷酸序列的第101位，该处碱基为a或c。
8、优选的是，所述snp 1存在基因型tt和cc；所述snp2存在基因型aa和cc。
9、本专利技术还提供一种利用所述snp分子标记鉴定玉米花丝颜色的方法，检测待鉴定玉米基因组dna中所述snp分子标记相应单核苷酸多态性位点的基因型，若突变位点snp1和snp2的基因型为cccc，则待鉴定玉米花丝颜色较深，分级较高。
10、本专利技术还提供所述snp分子标记在玉米花丝颜色相关性状育种中的应用。
11、本专利技术还提供所述snp分子标记在鉴定或辅助鉴定玉米花丝颜色相关性状中的应用。
12、本专利技术还提供所述snp分子标记在制备鉴定或辅助鉴定玉米花丝颜色相关性状的产品中的应用。
13、优选的是，所述玉米包括玉米自交系wl134、d7和以二者为亲本选育的后代。
14、基于上述技术方案，本专利技术具有以下技术效果：
15、本专利技术在第5染色体上稳定检测到一个主效qtl位点qsc5，位于19.16mb-19.80mb之间。为玉米花丝颜色相关基因的克隆提供了实用基础。基于qsc5两侧的snp标记在鉴定玉米花丝颜色方面效果显著，可用于玉米花丝颜色相关分子标记辅助育种，加快育种进程。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与玉米花丝花青苷显色性状相关的QTL，其特征在于，位于玉米基因组的第5染色体，其标记区间为Chr.05_19156257和Chr.05_19800985。
2.如权利要求1所述QTL在玉米花丝颜色相关的分子标记辅助育种中的应用。
3.一种与玉米花丝颜色相关的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记位于玉米基因组第5号染色体上，包括突变位点SNP 1和SNP2；
4.根据权利要求3所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP 1存在基因型TT和CC；所述SNP2存在基因型AA和CC。
5.一种利用权利要求3或4所述SNP分子标记鉴定玉米花丝颜色的方法，其特征在于，检测待鉴定玉米基因组DNA中所述SNP分子标记相应单核苷酸多态性位点的基因型，若突变位点SNP1和SNP2的基因型为CCCC，则待鉴定玉米花丝颜色较深，分级较高。
6.如权利要求3或4所述SNP分子标记在玉米花丝颜色相关性状育种中的应用。
7.如权利要求3或4所述SNP分子标记在鉴定或辅助鉴定玉米花丝颜色相关性状中的应用。
8.如权
9.根据权利要求6-8任一项所述的应用，其特征在于，所述玉米包括玉米自交系WL134、D7和以二者为亲本选育的后代。
...【技术特征摘要】
1.一种与玉米花丝花青苷显色性状相关的qtl，其特征在于，位于玉米基因组的第5染色体，其标记区间为chr.05_19156257和chr.05_19800985。
2.如权利要求1所述qtl在玉米花丝颜色相关的分子标记辅助育种中的应用。
3.一种与玉米花丝颜色相关的snp分子标记，其特征在于，所述分子标记位于玉米基因组第5号染色体上，包括突变位点snp 1和snp2；
4.根据权利要求3所述的snp分子标记，其特征在于，所述snp 1存在基因型tt和cc；所述snp2存在基因型aa和cc。
5.一种利用权利要求3或4所述snp分子标记鉴定玉米花丝颜色的...
【专利技术属性】
技术研发人员：安洪周，高增玉，李魁英，王延兵，黄缓缓，
申请(专利权)人：河北省农林科学院粮油作物研究所，
类型：发明
国别省市：
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