肝细胞癌预后评分模型构建方法、装置、设备及存储介质制造方法及图纸

本发明专利技术涉及一种生物信息技术领域，是一种肝细胞癌预后评分模型构建方法、装置、设备及存储介质，包括：构建训练集和验证集；利用训练集对机器学习算法集合中的所有组合进行训练，获得对应的预后评分模型；利用验证集对所有预后评分模型进行验证，输出指数平均值最高的预后评分模型作为最优预后评分模型。本发明专利技术基于RNA测序数据和机器学习，从免疫浸润和免疫相关预后基因方面构建预后评分模型，提高了后续训练出模型的评分效能，并且机器学习时是对若干不同组合的算法集合进行模型训练及筛选，进一步提高了预后评分的有效性及准确性，使其能够为免疫浸润在肝癌预后与耐药性方面的影响提供准确的数据参考。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种生物信息，是一种肝细胞癌预后评分模型构建方法、装置、设备及存储介质。

技术介绍

1、原发性肝癌是全球第六大恶性肿瘤和第四大致死恶性肿瘤，对人类健康构成显著威胁。肝细胞癌（hcc）是癌症最常见的类型。鉴于hcc在早期阶段往往没有症状，大多数患者在晚期被诊断出来，从而错过了最佳治疗的机会。目前，癌症的治疗主要是手术切除和化疗，主要基于临床病理分期；然而，这些方法可能导致过度治疗或治疗不足，因为它们无法解释分子特征。因此，在个性化医学时代，识别可靠的生物标志物来预测癌症的预后和治疗反应势在必行。

2、hcc是一种高度复杂的疾病，其特征是肿瘤间和肿瘤内的异质性。基因表达分析能够识别肿瘤中失调的基因，从而有助于发现癌症诊断的靶点和与组织学异质性相关的生物标志物（免疫相关预后基因）。多基因小组在解决这种异质性方面是一种有前景的策略。

3、随着生物信息学的不断发展，越来越多预后基因被鉴定出来，多基因图谱的综合分析被普遍运用于筛选候选生物标志物（免疫相关预后基因）。然而，由于数据利用不足、机器学习方法不当以及缺乏对不同队列的严格验本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，所述构建训练集，包括：

3.根据权利要求2所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，所述对TCGA-LIHC数据集依次进行免疫浸润分析、共识聚类、加权基因共表达网络分析，筛选出免疫相关基因，包括：

4.根据权利要求2或3所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，所述对TCGA-LIHC数据集进行差异分析，对差异分析的结果，以|logFC|>0.585，P值<0.05为标准筛选差异基因。</p>

5.根据...

【技术特征摘要】

1.一种肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，所述构建训练集，包括：

3.根据权利要求2所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，所述对tcga-lihc数据集依次进行免疫浸润分析、共识聚类、加权基因共表达网络分析，筛选出免疫相关基因，包括：

4.根据权利要求2或3所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，所述对tcga-lihc数据集进行差异分析，对差异分析的结果，以|logfc|>0.585，p值<0.05为标准筛选差异基因。

5.根据权利要求1或2或3所述的肝细胞癌预后评分模型构建方法，其特征在于，还包括获取tcga-lihc数据集、gse14520、gse7642和i...

【专利技术属性】
技术研发人员：王良海，杨春，侯隽，
申请(专利权)人：石河子大学，
类型：发明
国别省市：