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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学与遗传育种,涉及用于检测丝瓜新品种浙丝203种子纯度和真实性的snp分子标记及其应用、产品及方法。
技术介绍
1、丝瓜隶属葫芦科(cucurbitaceae)丝瓜属(luffa),为一年生攀援性草本植物,起源于亚洲热带地区。丝瓜兼具营养、药用、商业和生态价值,经济效益显著,市场潜力较大。近年来,随着社会经济的发展和城乡居民生活水平的提高,消费者对蔬菜产品已从量的追求逐步向高品质方向转变。在生产、流通、销售等各个环节,对蔬菜产品的外观商品性和内在品质的要求均不断提高。因此,具有自主知识产权优质丝瓜新品种的培育与推广对满足人民群众的消费升级需求和高质量生活需求、丝瓜产业的健康发展具有重要意义。
2、‘浙丝203’是由浙江省农业科学院蔬菜研究所自主选育的短棒特色类型丝瓜杂交种,瓜长约28cm,横径约5.0cm;商品瓜皮色黄绿,粗细均匀,外观商品性佳;肉质较致密、口感软糯微甜、品质优。‘浙丝203’目前已申请农业植物新品种权保护,其品种权申请号为20241000963。
3、snp分子标记是目前应用最广泛的遗传标记,其多态性高、数量多,标记表现为显性或共显性,适用于分子标记辅助育种。用于snp检测的kasp技术成本低、准确性高、适合检测大量样本,在作物指纹图谱构建等方面具有较高的应用价值。目前,snp分子标记已被国际植物新品种保护联盟确定为优先推荐的标记方法。
4、因此,为了方便快捷、精准有效地鉴定丝瓜新品种‘浙丝203’的纯度和真实性,本领域亟需开发可用于鉴定丝瓜新品种‘浙丝
技术实现思路
1、为了解决方便快捷、精准有效地鉴定丝瓜新品种‘浙丝203’种子纯度和真实性这一技术问题,本专利技术提供用于检测丝瓜新品种浙丝203种子纯度和真实性的snp分子标记及其应用、产品及方法。
2、本专利技术的技术方案如下:
3、丝瓜snp位点开发snp分子标记的用途,其特征在于,所述丝瓜snp位点选自下述三个位点:
4、丝瓜基因组第2号染色体第27317224位的g>t snp位点;
5、丝瓜基因组第11号染色体第7149937位的a>g snp位点;
6、丝瓜基因组第13号染色体第5801004位的g>a snp位点。
7、所述丝瓜基因组版本为sponge gourd(p93075)v1 genome。
8、用于鉴定植物新品种的snp分子标记,用于检测丝瓜新品种‘浙丝203’纯度和真实性的snp分子标记包括下述分子标记:zs203-1、zs203-2、zs203-3;
9、所述zs203-1与丝瓜基因组第2号染色体第27317224位的g>t snp位点连锁;
10、所述zs203-2与丝瓜基因组第11号染色体第7149937位的a>g snp位点连锁;
11、所述zs203-3与丝瓜基因组第13号染色体第5801004位的g>a snp位点连锁。
12、所述丝瓜基因组版本为sponge gourd(p93075)v1 genome;
13、优选地,扩增所述zs203-1的特异性引物分别如seq id no.1、seq id no.2、seqid no.3所示;
14、优选地,扩增所述zs203-2的特异性引物分别如seq id no.4、seq id no.5、seqid no.6所示;
15、优选地,扩增所述zs203-3的特异性引物分别如seq id no.7、seq id no.8、seqid no.9所示。
16、所述的snp分子标记鉴定植物新品种的用途。
17、所述植物新品种为:丝瓜新品种‘浙丝203’。
18、用于鉴定植物新品种的引物,其包括下述特异性引物组:
19、扩增所述zs203-1的特异性引物组分别如seq id no.1、seq id no.2、seq idno.3所示;
20、扩增所述zs203-2的特异性引物组分别如seq id no.4、seq id no.5、seq idno.6所示;
21、扩增所述zs203-3的特异性引物组分别如seq id no.7、seq id no.8、seq idno.9所示。
22、扩增所述片段序列zs203-1的特异性引物组、和扩增所述片段序列zs203-2的特异性引物组、和扩增所述片段序列zs203-3的特异性引物组用于鉴定丝瓜新品种‘浙丝203’。
23、用于鉴定植物新品种的试剂盒,其包括所述的用于鉴定植物新品种的引物。
24、所述的用于鉴定植物新品种的试剂盒,还包括:扩增试剂;
25、优选地,所述植物新品种选自:丝瓜新品种‘浙丝203’。
26、一种鉴定植物新品种的方法,包括如下步骤:采用所述的snp分子标记、和/或所述的用于鉴定植物新品种的引物、和/或所述的用于鉴定植物新品种的试剂盒对待测植物进行基因分型鉴定。
27、所述的一种鉴定植物新品种的方法,还包括如下步骤:pcr扩增;
28、优选地,pcr扩增的反应体系包括:10-20ng/μl dna、0.5μl/μl kasp master mix、0.03125μl/μl引物;
29、优选地,pcr扩增的反应程序包括:94℃预变性15min;94℃变性20s,61-55℃退火延伸60s,每个循环的退火温度降低0.6℃,共10个循环;94℃变性20s,55℃退火延伸60s,共26个循环;
30、优选地,所述基因分型鉴定指:根据特异性引物组pcr扩增待测植物dna得到的扩增产物反映的基因型与植物新品种的父本、母本和f1的基因型分别进行比对;
31、优选地,所述待测植物为丝瓜;所述植物新品种选自:丝瓜新品种‘浙丝203’;
32、优选地,zs203-1扩增丝瓜新品种‘浙丝203’的父本、母本和f1的基因型分别为:gg、tt、gt;
33、优选地,zs203-2扩增丝瓜新品种‘浙丝203’的父本、母本和f1的基因型分别为:cc、tt、ct;
34、优选地,zs203-3扩增丝瓜新品种‘浙丝203’的父本、母本和f1的基因型分别为:cc、tt、ct。
35、本专利技术的有益效果如下:
36、本专利技术基于前期筛选获得的普通丝瓜核心snp分子标记集及转化的kasp引物,对‘浙丝203’进行筛选,分别获得用于鉴定‘浙丝203’种子纯度及真实性的3个snp分子标记。本专利技术可为丝瓜新品种纯度检测及品种权保护奠定重要的技术支撑。本专利技术提供的3个snp分子标记对144个‘浙丝203’杂交种种子的纯度及真实性进行检测,均能准确测出;同时用该3个snp分子标记检测商购的8个公知公用的丝瓜品种,基因型均与‘浙丝203’基因型不符,说明这些市面上的丝瓜本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.丝瓜SNP位点开发SNP分子标记的用途,其特征在于,所述丝瓜SNP位点选自下述三个位点:
2.根据权利要求1所述的丝瓜SNP位点开发SNP分子标记的用途,其特征在于,所述丝瓜基因组版本为Sponge gourd(P93075)v1 Genome。
3.用于鉴定植物新品种的SNP分子标记,其特征在于,包括下述分子标记:ZS203-1、ZS203-2、ZS203-3;
4.根据权利要求1所述的用于鉴定植物新品种的SNP分子标记,其特征在于,所述丝瓜基因组版本为Sponge gourd(P93075)v1 Genome;
5.权利要求3或4所述的SNP分子标记鉴定植物新品种的用途。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于,所述植物新品种为:丝瓜新品种‘浙丝203’。
7.用于鉴定植物新品种的引物,其特征在于,包括下述特异性引物组:
8.根据权利要求7所述的用于鉴定植物新品种的引物,其特征在于,扩增所述片段序列ZS203-1的特异性引物组、和扩增所述片段序列ZS203-2的特异性引物组、和扩增所述片
9.用于鉴定植物新品种的试剂盒,其特征在于,包括权利要求7或8所述的用于鉴定植物新品种的引物。
10.根据权利要求9所述的用于鉴定植物新品种的试剂盒,其特征在于,还包括:扩增试剂;
11.一种鉴定植物新品种的方法,其特征在于,采用权利要求3或4所述的SNP分子标记、和/或权利要求7或8所述的用于鉴定植物新品种的引物、和/或权利要求9或10所述的用于鉴定植物新品种的试剂盒对待测植物进行基因分型鉴定。
12.根据权利要求11所述的一种鉴定植物新品种的方法,其特征在于,包括:PCR扩增;
...【技术特征摘要】
1.丝瓜snp位点开发snp分子标记的用途,其特征在于,所述丝瓜snp位点选自下述三个位点:
2.根据权利要求1所述的丝瓜snp位点开发snp分子标记的用途,其特征在于,所述丝瓜基因组版本为sponge gourd(p93075)v1 genome。
3.用于鉴定植物新品种的snp分子标记,其特征在于,包括下述分子标记:zs203-1、zs203-2、zs203-3;
4.根据权利要求1所述的用于鉴定植物新品种的snp分子标记,其特征在于,所述丝瓜基因组版本为sponge gourd(p93075)v1 genome;
5.权利要求3或4所述的snp分子标记鉴定植物新品种的用途。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于,所述植物新品种为:丝瓜新品种‘浙丝203’。
7.用于鉴定植物新品种的引物,其特征在于,包括下述特...
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