免疫基因个体化差异预测方法和装置制造方法及图纸

技术编号:41060809 阅读:18 留言:0更新日期:2024-04-24 11:12
本发明专利技术公开了一种免疫基因个体化差异预测方法和装置,所述方法包括:获取目标患者的转录组数据和预存的免疫基因列表;基于所述免疫基因列表,在所述转录组数据中提取目标免疫基因的表达谱,并将所述表达谱转换为矩阵化的秩谱;根据所述秩谱分别确定各所述目标免疫基因在正常组织中的稳定免疫基因对,以及各所述目标免疫基因在肿瘤组织中的逆转免疫基因对;在所述逆转免疫基因对达到预设数量的情况下,则确定对应的目标免疫基因存在个体化差异表达。该方法和装置提高了个体化的基因差异表达分析的准确性,从而提高了基因差异表达的准确性,为后续肿瘤预后预测提供了更为准确的数据支持。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及人工智能领域,具体涉及一种免疫基因个体化差异预测方法和装置


技术介绍

1、肿瘤治疗的预后情况常与个体的差异基因相关。专利cn106460067a提供了研究免疫基因表达对于原发性gbm中贝伐珠单抗治疗的潜在预测价值,通过无监督分析将avaglionanostring数据中的潜在免疫相关基因细分成关联基因簇。无监督分析将193种基因分组成15个簇(簇1-15),其成员在avaglio生物标志物数据集间显示一致表达。

2、现有研究使用肿瘤患者个体间的差异表达分析方法来识别肿瘤相关差异基因,如t检验和deseq,既有方法旨在检测人群水平的差异表达基因。专利cn115831216a选取关键免疫细胞、hlas和免疫检查点,结合tme这三个方面的免疫相关基因构建免疫基因评分,并通过联合免疫基因评分、tmb评分和lncrna评分构建基于肿瘤免疫微环境的肿瘤免疫治疗疗效预测模型,该预测模型相较于免疫基因评分、tmb评分、lncrna评分等单因素预测策略,能够显著提高肿瘤免疫治疗疗效预测的效能,具有更高的准确性和敏感性,为肿瘤患者的治疗策略提供更准本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,获取目标患者的转录组数据,之后还包括:

3.根据权利要求1所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,根据所述秩谱分别确定各所述目标免疫基因在正常组织中的稳定免疫基因对,具体包括:

4.根据权利要求1所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,根据所述秩谱分别确定各所述目标免疫基因在肿瘤组织中的逆转免疫基因对,具体包括:

5.根据权利要求4所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,与在正常组织中的稳定顺序进...

【技术特征摘要】

1.一种免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,获取目标患者的转录组数据,之后还包括:

3.根据权利要求1所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,根据所述秩谱分别确定各所述目标免疫基因在正常组织中的稳定免疫基因对,具体包括:

4.根据权利要求1所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,根据所述秩谱分别确定各所述目标免疫基因在肿瘤组织中的逆转免疫基因对,具体包括:

5.根据权利要求4所述的免疫基因个体化差异预测方法,其特征在于,与在正常组织中的稳定顺序进行比较,判断目标免疫基因对是否显示出反转顺序,具体包括:

6.根据权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:张力元李仕成张军军
申请(专利权)人:核工业总医院
类型:发明
国别省市:

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