核酸片段及其作为标志物在制备回旋状视网膜脉络膜萎缩的诊断试剂中的应用制造技术

本发明专利技术涉及基因诊断技术领域，尤其涉及核酸片段及其作为标志物在制备回旋状视网膜脉络膜萎缩的诊断试剂中的应用。本发明专利技术基于临床资源，借助基因捕获芯片及深度测序技术，通过遗传学、结合临床表现及人群验证，首次发现GA致病基因OAT的新突变位点，其在先证者OAT基因上检测到纯合突变，此新突变位点位于5′端非编码区。本发明专利技术进一步分别通过生物信息学和实验手段，验证了该突变造成启动子右侧缺失95bp且Exon1跳跃，造成异常剪接，由此证实此变异为有害致病变异。本发明专利技术新致病突变扩展了OAT致病基因突变谱，为该疾病的诊断和治疗提供了新的检测位点和新方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因诊断，尤其涉及核酸片段及其作为标志物在制备回旋状视网膜脉络膜萎缩的诊断试剂中的应用。

技术介绍

1、回旋状视网膜脉络膜萎缩(gyrate atrophy of the choroid and retina,ga)是一种罕见的、由于oat基因突变引起的常染色体隐性遗传疾病。其主要的眼部症状和体征包括夜盲、高度近视、早期白内障形成以及脉络膜视网膜环形萎缩、黄斑病变等，萎缩性病变具有扇形或花环状边界。此病还可累及全身其他组织器官，主要有脑部、周围神经系统、骨骼肌和毛发异常等。该病通常儿童期发病，40-60岁失明。可给予维生素b6、赖氨酸、低蛋白、低精氨酸饮食进行治疗，但治疗效果尚难肯定，且脉络膜视网膜萎缩是不可逆的。

2、ga为单基因遗传病，具有显著的临床和遗传异质性，即使是同一家系中携带相同致病突变的患者也可出现不同的临床特征。由于其眼外表现在多数情况下是亚临床的，导致其易被误诊、漏诊，基因检测使得早期、快速的精准诊断成为可能。

3、流行病学研究显示，ga的全球发病率约为1/1500000，芬兰地区发病率较高，约为1/本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.核酸片段，其具有如SEQ ID NO:1所示的核酸序列。

2.基因突变体，其为在OAT基因中缺失权利要求1所述的核酸片段。

3.权利要求1所述的核酸片段和/或权利要求2所述的基因突变体在如下任一项中的应用：

4.回旋状视网膜脉络膜萎缩的诊断试剂，其包括权利要求1所述核酸片段的检测试剂和/或权利要求2所述的基因突变体的检测试剂。

5.根据权利要求4所述的诊断试剂，其特征在于，所述检测试剂为PCR检测试剂，所述PCR检测试剂包括2个引物对，

6.构建回旋状视网膜脉络膜萎缩模型的试剂，其特征在于，包括敲除权利要求1所述的核酸片段的...

【技术特征摘要】

1.核酸片段，其具有如seq id no:1所示的核酸序列。

2.基因突变体，其为在oat基因中缺失权利要求1所述的核酸片段。

3.权利要求1所述的核酸片段和/或权利要求2所述的基因突变体在如下任一项中的应用：

4.回旋状视网膜脉络膜萎缩的诊断试剂，其包括权利要求1所述核酸片段的检测试剂和/或权利要求2所述的基因突变体的检测试剂。

5.根据权利要求4所述的诊断试剂，其特征在于，所述检测试剂为pcr检测试剂，所述pcr检测试剂包括2个引物对，

6.构建回旋状视网膜脉络膜萎缩模型的试剂，其特征在于，包括敲除权利要求1所述的核酸片段的试剂。

7.回...

【专利技术属性】
技术研发人员：高凤娟，段聪，宗媛，徐格致，胡竹林，张婷，居钰乔，张利伟，李娟娟，马璇，
申请(专利权)人：复旦大学附属眼耳鼻喉科医院，
类型：发明
国别省市：