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【技术实现步骤摘要】
技术介绍
1、在奶牛育种中,因为产奶性状拥有极高的经济价值,与其有关的遗传改良工作的重要性不言而喻。qtl定位的准确性对于育种工作者寻找影响产奶性状的基因或区域影响甚深,准确的qtl定位能有效提高选种的准确性,为育种工作提供科学依据,加快育种进程。因此,利用遗传手段对资源群体牛的产奶性状进行改良是可行的。在过去十多年里,国内外关于奶牛产奶性状遗传基础的研究报道很多。到目前为止,仅有少数几个基因是国际公认的影响产奶性状的主效基因,较大的qtl置信区间限制了基因鉴定的效率,奶牛产奶性状功能基因的深度挖掘才刚刚起步,寻求数量性状主效基因鉴定新策略迫在眉睫。鉴定新的影响产奶性状的分子标记,将其中具有显著效应的分子标记加入到分子标记辅助选择(marker assisted selection,mas)、基因组选择(genomic selection,gs)中则能加快奶牛群体的遗传改良进展,进而提高经济性状的生产性能,增加养殖企业的经济效益。
技术实现思路
1、针对现有技术存在的问题,本专利技术提供通过基因分型和相关性分析策略鉴别到的与奶牛产奶性状的显著相关的分子标记,将其用于分子标记辅助选择和基因组选择中,选择有利的基因型进行留种,从而逐代提高优势等位基因的基因频率,则能加快种奶牛遗传育种改良的进程,为地方奶牛养殖带来巨大经济效益。
2、首要目的在于确定影响奶牛产奶性状的snp分子标记。所述分子标记位于奶牛基因组参考序列19号染色体(nc_037346.1)上。
3
4、所述分子标记位于如下序列中:
5、5’-cttgggttcagagcattttggtccaggcagcaagcaggcatgtgatgctggcctgcaacgcctcgagcacacaccaggtgcagcgactgtgcctttaacaagcttgttatttggctgtgccgggtcttagttgcggcccaggggctctcgatctggggatctgggcgcagagcagccagagggcgcccacccaccccagcgttgttccagtggacctgtttgctcctgtcttttttccgttgtactgatcgtagcgcgtgtttcaggcctcagtgtgctggtctgaccatcgcacagtgtgaaagggctcccgcagccga[c/t]gtcgctcagccgtcacctcgcatcaccttttttactttggtgagagcgctccggctcggctgtcagcggggatcggtacacagtccgggactgcacggcagcccccgtgttgccctgtcccacgcgggagcctctttctcccccgcctctagctgatgaccaagcaccccgggaagcggctgggctgcgggcccgagggcgagcgcgacgtgcgggagcatgccttcttccggaggatcgactgggagaagctggagaaccgtgagatccagccacccttcaagcccaaagtggtgagtt-3’
6、本专利技术的另一目的在于提供检测上述分子标记的引物和探针组,其特征在于,所述引物和探针组的碱基序列如下:
7、seq id no.1:5’-acgttggatgaaaaggtgatgcgaggtgac-3’
8、seq id no.2:5’-acgttggatgaccatcgcacagtgtgaaag-3’
9、seq id no.3:5’-tgacggctgagcgac-3’
10、本专利技术的另一目的在于提供检测上述分子标记的试剂盒,所述试剂盒包含前述引物和探针组。
11、本专利技术的另一目的在于提供上述的分子标记在筛选优良产奶性状的奶牛个体中的应用。具体为,检测奶牛基因组ars-ucd1.2基因组19号染色体(nc_037346.1)上第62955914碱基位点基因型,淘汰该位点为杂合tc型的个体。
12、在一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型或cc型的个体。
13、在另一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型的个体。
14、本专利技术的另一目的在于提供一种上述飞行时间质谱引物和探针组或检测试剂盒在鉴定与奶牛产奶性状相关的位点基因型中的应用。具体为,利用上述引物和探针组或试剂盒检测奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点的基因型,淘汰该位点为杂合tc型的个体。
15、在一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型或cc型的个体。
16、在另一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型的个体。
17、进一步地,将上述的引物和探针组或检测试剂盒在奶牛基因组选择育种中的应用。具体为,利用上述引物和探针组或试剂盒检测奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点的基因型,淘汰该位点为杂合tc型的个体。
18、在一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型或cc型的个体。
19、在另一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型的个体。
20、进一步地,将上述的引物和探针组或检测试剂盒在改良奶牛产奶性状中的应用。具体为,利用上述引物和探针组或试剂盒检测奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点的基因型,淘汰该位点为杂合tc型的个体。
21、在一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型或cc型的个体。
22、在另一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型的个体。
23、本专利技术的另一目的在于提供一种奶牛的遗传改良的方法,所述方法包括:确定核心奶牛资源群体中的种用奶牛的上述与奶牛产奶性状的分子标记位点的基因型,并根据所述分子标记的基因型做出相应的选择:在所述奶牛资源群体中淘汰奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为杂合tc型的个体,以逐代提高该位点的纯合基因型频率,从而提高后代奶牛的产奶质量。所述奶牛群体包括荷斯坦奶牛及其合成系。
24、在一个优选实施例中,保留奶牛19号染色体(nc_037346.1)上第62955914位点为纯合tt型或cc本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.与奶牛产奶性状相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记包含对应于牛基因组ARS-UCD1.2基因组19号染色体(NC_037346.1)上第62955914为C>T突变。
2.用于检测权利要求1所述的分子标记的引物和探针组,其特征在于,所述引物和探针组的碱基序列如下:
3.用于检测权利要求1所述的分子标记的试剂盒。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,试剂盒包含权利要求2所述的引物。
5.一种改良奶牛产奶性状的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:检测奶牛基因组ARS-UCD1.2基因组19号染色体(NC_037346.1)上第62955914位点的基因型,淘汰该位点为杂合TC基因型的个体。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述检测奶牛的奶牛基因组ARS-UCD1.2基因组19号染色体(NC_037346.1)上第62955914位点基因型的方法包括以下步骤:
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述奶牛群体包括中国荷斯坦奶牛及其合成系。
8.权利要求1所述的分子
9.权利要求2所述的引物和探针组或权利要求3所述的试剂盒在改良奶牛产奶性状中的应用。
...【技术特征摘要】
1.与奶牛产奶性状相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记包含对应于牛基因组ars-ucd1.2基因组19号染色体(nc_037346.1)上第62955914为c>t突变。
2.用于检测权利要求1所述的分子标记的引物和探针组,其特征在于,所述引物和探针组的碱基序列如下:
3.用于检测权利要求1所述的分子标记的试剂盒。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,试剂盒包含权利要求2所述的引物。
5.一种改良奶牛产奶性状的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:检测奶牛基因组ars-ucd1.2基因组19...
【专利技术属性】
技术研发人员:张娟,马若霜,王荟珺,田佳,周佳敏,侯丽娥,马丽琴,张艳梅,路婷婷,王琨,朱熙春,陈亚飞,张国俊,张虎,徐寒,
申请(专利权)人:宁夏大学,
类型:发明
国别省市:
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