一种与油茶光合表型叶绿素含量相关的SNP分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与油茶光合表型叶绿素含量相关的SNP分子标记及其应用，该SNP分子标记为CaS900025_K01，所述SNP分子标记的SNP位点位于狭叶油茶的7号染色体的第94365530位的碱基处，所述SNP位点的碱基为G或T。本发明专利技术的SNP分子标记直接以DNA的形式表现，其基因型与油茶叶片的叶绿素含量高低显著相关，具有鉴定效率高、适用性强等优点；将其用于鉴定或辅助鉴定油茶光合表型叶绿素含量时，不仅可以快捷方便地预测油茶叶片光合表型叶绿素含量，还可以快速精准地筛选出高SPAD含量的油茶品种，从而大量节省传统育种的成本，加快油茶高SPAD含量光合表型新品种的选育进程。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于油茶分子生物学，具体涉及一种与油茶光合表型叶绿素含量相关的snp分子标记及其应用。

技术介绍

1、光合作用在植物生长发育过程中起着极其重要的作用，光合作用强弱不仅影响植物光合速率和作物产量，而且在一定程度上决定植物的品质。光合特性作为植物高产稳产的内在基础，一直以来都作为油茶研究领域的重要内容之一。然而光合作用是由多基因控制的复杂数量性状，对复杂数量性状的解析一直是油茶研究领域的重要内容之一。

2、由于油茶基因组庞大、遗传背景复杂，因此油茶光合特性的研究主要集中在以生理特性为研究的基础选择育种。但随着测序技术的发展，分子标记技术被广泛用于水稻、小麦等作物的表型变异和基因型相关性分析，并通过分子标记技术发现了一些与光合作用显著相关的数量性状位点。单核苷酸多态性snp(single nucleotide polymorphisms，snp)是指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性，利用snp分子标记可快速预测油茶叶片叶绿素含量，缩短育种年限，具有较高的遗传稳定性。snp基因分型主要包括taqman探针、限制性片段长度多态性本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种与油茶光合表型叶绿素含量相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为CaS900025_K01，所述SNP分子标记的SNP位点位于狭叶油茶的7号染色体的第94365530位的碱基处，所述SNP位点的碱基为G或T。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记包括DNA片段1和DNA片段2；所述DNA片段1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1；所述DNA片段2的核苷酸序列如SEQID NO.2所示。

3.一种如权利要求1或2所述的SNP分子标记在鉴定或辅助鉴定油茶光合表型叶绿素含量、验证油茶品种中的应用。

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【技术特征摘要】

1.一种与油茶光合表型叶绿素含量相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记为cas900025_k01，所述snp分子标记的snp位点位于狭叶油茶的7号染色体的第94365530位的碱基处，所述snp位点的碱基为g或t。

2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记包括dna片段1和dna片段2；所述dna片段1的核苷酸序列如seq id no.1；所述dna片段2的核苷酸序列如seqid no.2所示。

3.一种如权利要求1或2所述的snp分子标记在鉴定或辅助鉴定油茶光合表型叶绿素含量、验证油茶品种中的应用。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，待测油茶基因组dna中所述snp分子标记的snp位点的基因型为gg型时，所述待测油茶为高spad含量表型；待测油茶基因组dna中所述snp分子标记的snp位点的基因型为tt型时，所述待测油茶为低spad含量表型；

6.一种用于检测如权利要求1或2所述的snp...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵小英，杨海余，朱咏华，刘选明，袁德义，龚文芳，
申请(专利权)人：湖南大学，
类型：发明
国别省市：