【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种用于检测与目标基因座相互作用的dna片段的文库构建方法，属于基因测序。
技术介绍
1、染色质构象捕获(chromatin conformation capture)是一种分子生物学技术，用于研究染色体内部三维结构的空间组织。它在揭示基因组三维结构、理解基因调控机制、研究疾病发生机制以及推动药物研发等方面具有重要的意义。
2、4c(circular chromosome conformation capture)使用已知dna片段的特异引物反向pcr扩增环化的重连dna片段，并进行高通量测序，从而获得特定区域与整个基因组的相互作用图谱，揭示了特定dna区域与整个基因组的相互作用。是研究基因调控、基因组稳定性和疾病发生的重要工具。
3、4c技术由于需要环化dna存在样本需求巨大，建库方法复杂、漫长且不稳定的问题。此外，在现有的4c文库构建过程中，经酶切的dna片段并不能全部重新连接，这些未经重连的酶切片段仍然能够进入到文库中，并在之后的测序过程中被检测到。这些片段占据了文库相当大的比例，从而在分析结...
【技术保护点】
1.一种用于检测与目标基因座相互作用的DNA片段的文库构建方法，该方法包括下述步骤：
2.根据权利要求1所述文库构建方法，所述加测序接头的DNA片段通过其添加的测序接头重新连接，所述重连DNA片段内部包括两个测序接头。
3.根据权利要求1所述文库构建方法，所述测序接头由两条DNA单链组成，所述测序引物序列设置在3'端与所述交联的DNA片段相连接的单链上，所述测序引物序列设置在其所在单链的3'端。
4.根据权利要求3所述文库构建方法，所述设置测序引物序列的单链的5'端为突出的SEQ ID NO：1所示核苷酸序列，或，未设置测序引物序列...
【技术特征摘要】
1.一种用于检测与目标基因座相互作用的dna片段的文库构建方法，该方法包括下述步骤：
2.根据权利要求1所述文库构建方法，所述加测序接头的dna片段通过其添加的测序接头重新连接，所述重连dna片段内部包括两个测序接头。
3.根据权利要求1所述文库构建方法，所述测序接头由两条dna单链组成，所述测序引物序列设置在3'端与所述交联的dna片段相连接的单链上，所述测序引物序列设置在其所在单链的3'端。
4.根据权利要求3所述文库构建方法，所述设置测序引物序列的单链的5'端为突出的seq id no：1所示核苷酸序列，或，未设置测序引物序列的单链的3'端为突出的seq id no：1所示核苷酸序列，
5.根据权利要求1所述文库构建方法，在酶切步骤后对交联的...
【专利技术属性】
技术研发人员：宋健，李小林，韦所苏，
申请(专利权)人：广西壮族自治区人民医院，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。