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基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立和应用制造技术

技术编号:40844804 阅读:5 留言:0更新日期:2024-04-01 15:12
本发明专利技术涉及胃癌预测技术领域,公开了基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立和应用。步骤S1:采集舌苔代谢物作为样本;步骤S2:对样本进行分析,获得舌苔代谢物样本数据集;舌苔代谢物样本数据集包括M个舌苔代谢物样本数据子集,每个舌苔代谢物样本数据子集包含舌苔代谢物中各组分的丰度数据;步骤S3:数据前处理,针对舌苔代谢物样本数据集进行前处理,得到最终舌苔代谢物样本数据集;步骤S4:将最终舌苔代谢物样本数据集输入胃癌预测模型,得到最终胃癌患病概率。采集舌苔代谢物对人体无损,受试者接受度好,预测准确度高。根据预测精度要求灵活选择采集舌苔代谢物各组分的组合,提升预测模型的便捷性、易用性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及胃癌预测,尤其涉及基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立和应用


技术介绍

1、胃癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,严重危害人类健康。由于胃癌缺乏早期的显著症状,其在诊断时往往处于晚期,导致死亡率很高。胃癌早期筛查依赖于胃镜的检查,而胃镜检查依赖于仪器和专业医师,同时面临患者依从性较差的问题,严重限制胃癌的诊断,尤其是限制胃癌早期的筛查。因此开发非侵入性的新型胃癌筛查工具至关重要。

2、代谢组学是一种强有力的生物标志物挖掘工具,以代谢物作为代表,是所有小分子化合物的集合,可以表征生理或疾病新陈代谢动态系统的最下游阶段,其优势在于能够提供关于生物体内部代谢状态的全面信息,从而揭示疾病发展的微妙变化。癌症对宿主的新陈代谢产生广泛的影响,肿瘤细胞代谢重编程促进其增殖和改变肿瘤免疫微环境,同时某些代谢物直接促进癌症的进展和发生。

3、因此,亟需一种基于舌苔代谢物的胃癌预测模型,用于提升胃癌预测的准确率。


技术实现思路

1、为了解决上述技术问题,本专利技术提供了基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,以提升胃癌预测的准确率,包括如下步骤:

2、步骤s1:采集舌苔代谢物作为样本;

3、步骤s2:对所述样本进行分析,获得舌苔代谢物样本数据集,所述舌苔代谢物样本数据集包括m个舌苔代谢物样本数据子集,每个舌苔代谢物样本数据子集包含舌苔代谢物中各组分的丰度数据,舌苔代谢物的组分包括:n-乙酰-亮氨酸、丙酰肉碱、17α-雌二醇、乳果糖、乙醇胺;

4、步骤s3:数据前处理,针对所述舌苔代谢物样本数据集进行前处理,得到最终舌苔代谢物样本数据集;

5、步骤s4:将所述最终舌苔代谢物样本数据集输入胃癌预测模型,得到最终胃癌患病概率。

6、优选地,所述舌苔代谢物的组分还包括:本胆烷醇酮、3-羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、6β-羟基-17β-雌二醇、n-乙酰胞壁酸。

7、优选地,所述舌苔代谢物的组分还可以是:n-乙酰-亮氨酸、丙酰肉碱、17α-雌二醇、乳果糖、乙醇胺、n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+、本胆烷醇酮、泛酸、甜菜碱醛、3 -羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、n-乙酰胞壁酸。

8、优选地,所述舌苔代谢物的组分还包括:n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+、本胆烷醇酮、苏氨酸亮氨酸、d-丙氨酰-d-丙氨酸、蔗糖、邻苯二甲酸酐、n-甲基酪胺、丁酸、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、3-羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、4-乙酰氨丁酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、普糖、n-乙酰胞壁酸、山梨糖。

9、优选地,所述舌苔代谢物的组分还可以是:n-乙酰-亮氨酸、n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+、丙酰肉碱、本胆烷醇酮、17α-雌二醇、n-乙酰-d-半乳糖胺、左旋肾上腺素、‘丙基肉桂酸酯;3-二甲基烯丙基-4-羟基苯甲醛’、17α-羟基孕酮、乳果糖、苏氨酸亮氨酸、精氨酸-丙氨酸、皮质醇、d-丙氨酰、d-丙氨酸、雄酮、蔗糖、2-羟基-2-甲基丁酸、邻苯二甲酸酐、n-甲基酪胺、雌二醇-17β 3-硫酸酯、丙氨酰-亮氨酸、亮氨酰-缬氨酸、4-氨基-4-脱氧鸟苷、胸腺嘧啶、β-羟基苯乙醛、苯乙醛、β-丙氨酸、对羟基肉桂醇糖苷、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、β-羟基苯甲醛、蛋氨酸、熊去氧胆酸、β-羟基丁酸、异丁酰甘氨酸、4-乙酰氨丁酸、正十六烷二酸二酸盐;十六烷二酸盐、精氨酸、鸟氨酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、来普糖、n-乙酰胞壁酸、山梨糖。

10、优选地,所述舌苔代谢物的组分还包括:n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+(n-acetyl-d-galactosamine [m+h-h2o]+)、本胆烷醇酮(etiocholanone)、n-乙酰半糖胺、左旋间羟肾上腺素、‘丙基肉桂酸酯;3-二甲基烯丙基-4-羟基苯甲醛’、17α-羟基孕酮、苏氨酸亮氨酸(threonylleucine)、瓜氨酸、n-乙酰胞壁酸、胞壁酸、‘精氨酸-丙氨酸’、 甲基亮氨酸酯、皮质醇、乙基-4-二甲基氨基苯甲酸酯(ethyl-4-dimethylaminobenzoate)、d-丙氨酰-d-丙氨酸、雄甾酮(androsterone)、云杉苷、蔗糖、2-羟基-2-甲基丁酸、邻苯二甲酸酐、n-甲基酪胺、17β-雌二醇-3-硫酸酯(estradiol-17beta 3-sulfate)、丙氨酰-亮氨酸、腺嘌呤、缬氨酸-缬氨酸(valylvaline)、γ-谷氨酰-γ-氨基丁醛、亮氨酰-缬氨酸、‘4-氨基-4-脱氧鸟苷;胸苷’、 3β-羟基孕-5-烯-20-酮硫酸酯(3beta-hydroxypregn-5-en-20-onesulfate)、正丁酸、雌酮葡糖苷酸、辛基甲氧肉桂酸酯、γ-谷氨酰谷氨酰胺、n-辛酰甘氨酸、苯甲酰胺、苯乙醛、n-ε-乙酰赖氨酸、香豆酰基鸟氨酸、1,3-二环己基脲、n5-(l-1-羧乙基)-l-鸟氨酸、2-氨基丁酸、尿嘧啶、4-羟肉桂醇4-d-葡萄糖苷、‘安沙明;香豆素醋酸盐’、磷酸胆碱(lpe 14:0)、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、肌酐、腐胺、丙烯酰胺、鞘氨醇1-磷酸酯(sphingosine 1-phosphate)、吲哚乙酸、2-苯乙酰胺、3-乙氧基-4-羟基苯甲醛、3-羟基苯甲醛、γ-谷氨酰基蛋氨酸、甲酰甲硫氨酸、磷酸吡哆胺、苯、天冬氨酸、苯甲酸、4-羟基-l-谷氨酸、羟乙基磺酸(isethionic acid)、d-核糖酸、丝氨酸、3-羟基丁酸、甘油磷酰胆碱、l-羟基赖氨酸、4-羟基苯基甘氨酸、4-羟基粘液酸、雄甾二醇(androstenediol)、异丁酰甘氨酸、4-乙酰胺基丁酸、乙醛酸、n-乙酰-l-谷氨酸 5-磷酸、尿苷、鸟氨酸、十六烷二酸、油酸、瓜氨酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、琥珀酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、4-氨基丁酸、n-甲酰基-l-谷氨酸、来普糖(lyxose)、n-乙酰半乳糖胺、n-乙酰胞壁酸、山梨糖、d-山梨糖醇。

11、优选地,所述步骤s3中,针对所述舌苔代谢物样本数据集进行前处理,得到最终舌苔代谢物样本数据集,包括:

12、确定所述每个舌苔代谢物样本数据子集的缺失值个数;

13、剔除所述缺失值个数超过缺失值阈值的舌苔代谢物样本数据子集,得到符合缺失值要求的舌苔代谢物样本数据子集;

14、对符合缺失值要求的舌苔代谢物样本数据子集进行插补,得到插补后的舌苔代谢物样本数据集;

15、针对插补后的舌苔代谢物样本数据集进行归一化处理,获得最终舌苔代谢物样本数据集。

16、优选地,所述步骤s1中采集舌苔代谢物包括:

17、将采集的舌苔代谢物溶于水和甲醇的混合溶液中,所述水和甲醇的混本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分包括还包括:本胆烷醇酮、3-羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、6β-羟基-17β-雌二醇、N-乙酰胞壁酸。

3.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还可以是:N-乙酰-亮氨酸、丙酰肉碱、17α-雌二醇、乳果糖、乙醇胺、N-乙酰-D-半乳糖胺[M+H-H2O]+、本胆烷醇酮、泛酸、甜菜碱醛、3 -羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、5Z,7E,9E,14Z,17Z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、N-乙酰胞壁酸。

4.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还包括:N-乙酰-D-半乳糖胺[M+H-H2O]+、本胆烷醇酮、苏氨酸亮氨酸、D-丙氨酰-D-丙氨酸、蔗糖、邻苯二甲酸酐、N-甲基酪胺、丁酸、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、3-羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、4-乙酰氨丁酸、5Z,7E,9E,14Z,17Z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、普糖、N-乙酰胞壁酸、山梨糖。

5.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还可以是:N-乙酰-亮氨酸、N-乙酰-D-半乳糖胺[M+H-H2O]+、丙酰肉碱、本胆烷醇酮、17α-雌二醇、N-乙酰-D-半乳糖胺、左旋肾上腺素、‘丙基肉桂酸酯;3-二甲基烯丙基-4-羟基苯甲醛’、17α-羟基孕酮、乳果糖、苏氨酸亮氨酸、精氨酸-丙氨酸、皮质醇、D-丙氨酰、D-丙氨酸、雄酮、蔗糖、2-羟基-2-甲基丁酸、邻苯二甲酸酐、N-甲基酪胺、雌二醇-17β 3-硫酸酯、丙氨酰-亮氨酸、亮氨酰-缬氨酸、4-氨基-4-脱氧鸟苷、胸腺嘧啶、β-羟基苯乙醛、苯乙醛、β-丙氨酸、对羟基肉桂醇糖苷、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、β-羟基苯甲醛、蛋氨酸、熊去氧胆酸、β-羟基丁酸、异丁酰甘氨酸、4-乙酰氨丁酸、正十六烷二酸二酸盐;十六烷二酸盐、精氨酸、鸟氨酸、5Z,7E,9E,14Z,17Z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、来普糖、N-乙酰胞壁酸、山梨糖。

6.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还包括:N-乙酰-D-半乳糖胺[M+H-H2O]+、本胆烷醇酮、N-乙酰半糖胺、左旋间羟肾上腺素、‘丙基肉桂酸酯;3-二甲基烯丙基-4-羟基苯甲醛’、17α-羟基孕酮、苏氨酸亮氨酸、瓜氨酸、N-乙酰胞壁酸、胞壁酸、‘精氨酸-丙氨酸’、 甲基亮氨酸酯、皮质醇、乙基-4-二甲基氨基苯甲酸酯、D-丙氨酰-D-丙氨酸、雄甾酮、云杉苷、蔗糖、2-羟基-2-甲基丁酸、邻苯二甲酸酐、N-甲基酪胺、17β-雌二醇-3-硫酸酯、丙氨酰-亮氨酸、腺嘌呤、缬氨酸-缬氨酸、γ-谷氨酰-γ-氨基丁醛、亮氨酰-缬氨酸、‘4-氨基-4-脱氧鸟苷;胸苷’、 3β-羟基孕-5-烯-20-酮硫酸酯、正丁酸、雌酮葡糖苷酸、辛基甲氧肉桂酸酯、γ-谷氨酰谷氨酰胺、N-辛酰甘氨酸、苯甲酰胺、苯乙醛、N-ε-乙酰赖氨酸、香豆酰基鸟氨酸、1,3-二环己基脲、N5-(L-1-羧乙基)-L-鸟氨酸、2-氨基丁酸、尿嘧啶、4-羟肉桂醇4-D-葡萄糖苷、‘安沙明;香豆素醋酸盐’、磷酸胆碱、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、肌酐、腐胺、丙烯酰胺、鞘氨醇1-磷酸酯、吲哚乙酸、2-苯乙酰胺、3-乙氧基-4-羟基苯甲醛、3-羟基苯甲醛、γ-谷氨酰基蛋氨酸、甲酰甲硫氨酸、磷酸吡哆胺、苯、天冬氨酸、苯甲酸、4-羟基-L-谷氨酸、羟乙基磺酸、D-核糖酸、丝氨酸、3-羟基丁酸、甘油磷酰胆碱、L-羟基赖氨酸、4-羟基苯基甘氨酸、4-羟基粘液酸、雄甾二醇、异丁酰甘氨酸、4-乙酰胺基丁酸、乙醛酸、N-乙酰-L-谷氨酸 5-磷酸、尿苷、鸟氨酸、十六烷二酸、油酸、瓜氨酸、5Z,7E,9E,14Z,17Z-二十碳五烯酸、琥珀酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、4-氨基丁酸、N-甲酰基-L-谷氨酸、来普糖、N-乙酰半乳糖胺、N-乙酰胞壁酸、山梨糖、D-山梨糖醇。

7.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述步骤S3中,针对所述舌苔代谢物样本数据集进行前处理,得到最终舌苔代谢物样本数据集,包括:

8.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述步骤S1中采集舌苔代谢物包括:

9.如权利要求1-8任一项建立的基于舌苔代谢物的胃癌预测模...

【技术特征摘要】

1.基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分包括还包括:本胆烷醇酮、3-羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、6β-羟基-17β-雌二醇、n-乙酰胞壁酸。

3.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还可以是:n-乙酰-亮氨酸、丙酰肉碱、17α-雌二醇、乳果糖、乙醇胺、n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+、本胆烷醇酮、泛酸、甜菜碱醛、3 -羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、n-乙酰胞壁酸。

4.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还包括:n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+、本胆烷醇酮、苏氨酸亮氨酸、d-丙氨酰-d-丙氨酸、蔗糖、邻苯二甲酸酐、n-甲基酪胺、丁酸、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、3-羟基苯甲醛、3-羟基丁酸、4-乙酰氨丁酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、普糖、n-乙酰胞壁酸、山梨糖。

5.根据权利要求1所述的基于舌苔代谢物的胃癌预测模型的建立方法,其特征在于:所述舌苔代谢物的组分还可以是:n-乙酰-亮氨酸、n-乙酰-d-半乳糖胺[m+h-h2o]+、丙酰肉碱、本胆烷醇酮、17α-雌二醇、n-乙酰-d-半乳糖胺、左旋肾上腺素、‘丙基肉桂酸酯;3-二甲基烯丙基-4-羟基苯甲醛’、17α-羟基孕酮、乳果糖、苏氨酸亮氨酸、精氨酸-丙氨酸、皮质醇、d-丙氨酰、d-丙氨酸、雄酮、蔗糖、2-羟基-2-甲基丁酸、邻苯二甲酸酐、n-甲基酪胺、雌二醇-17β 3-硫酸酯、丙氨酰-亮氨酸、亮氨酰-缬氨酸、4-氨基-4-脱氧鸟苷、胸腺嘧啶、β-羟基苯乙醛、苯乙醛、β-丙氨酸、对羟基肉桂醇糖苷、泛酸、甜菜碱醛、甘露醇、β-羟基苯甲醛、蛋氨酸、熊去氧胆酸、β-羟基丁酸、异丁酰甘氨酸、4-乙酰氨丁酸、正十六烷二酸二酸盐;十六烷二酸盐、精氨酸、鸟氨酸、5z,7e,9e,14z,17z-二十碳五烯酸、6β-羟基-17β-雌二醇、4-羟基苯甲酸、来普糖、n-乙酰胞壁酸、山梨糖。

【专利技术属性】
技术研发人员:程向东潘利斌袁莉徐志远杜灵彬赵靖王亚楠
申请(专利权)人:浙江省肿瘤医院
类型:发明
国别省市:

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