【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物分析领域，尤其涉及一种睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法及系统。
技术介绍
1、sd大鼠肠道菌群是一个复杂的生态系统，对宿主的生理和病理过程具有重要影响。研究肠道菌群的结构和功能，有助于揭示宿主与菌群之间的相互作用，为预防和治疗相关疾病提供新思路。
2、目前分析睡眠对sd大鼠肠道菌群的影响主要是通过分析睡眠sd大鼠和未睡眠sd大鼠的大鼠肠道菌群结构变换来实现，这种方法通常是采集睡眠sd大鼠和未睡眠sd大鼠的肠道样本直接进行肠道菌群分析，由于sd大鼠可能自身代谢不同，会导致采集的肠道样本肠道菌群基因序列不够完整，影响sd大鼠的肠道菌群结构，从而使得分析睡眠对sd大鼠肠道菌群的影响不够准确。
技术实现思路
1、本专利技术提供一种睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法及系统，其主要目的在于提高分析睡眠对肠道菌群影响的准确性。
2、为实现上述目的，本专利技术提供的一种睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，包括：
3、获取待检测sd大鼠的大鼠数据，基于所述大鼠数据，分析所述待检测sd大鼠的大鼠特征，基于所述大鼠特征，评估所述待检测sd大鼠的大鼠健康系数，通过所述大鼠健康系数，提取所述待检测sd大鼠中的目标sd大鼠，并将所述目标sd大鼠划分为对照sd大鼠和实验sd大鼠，其中，所述对照sd大鼠是指对实验假设而言，不接受实验变量处理的对象组，所述实验sd大鼠是指在实验过程中接受实验变量处理的对象组；
4、构建所述对照sd
5、构建所述实验sd大鼠的睡眠剥脱环境，利用所述睡眠剥脱环境对所述实验sd大鼠进行睡眠剥脱，以筛选出所述实验sd大鼠中睡眠剥脱sd大鼠；
6、分别采集所述睡眠充足sd大鼠和所述睡眠剥脱sd大鼠的睡眠充足粪便样本和睡眠剥脱粪便样本，分别提取所述睡眠充足粪便样本和所述睡眠剥脱粪便样本的睡眠充足基因序列和睡眠剥脱基因序列，对所述睡眠充足基因序列和所述睡眠剥脱基因序列进行扩增，得到睡眠充足扩增序列和睡眠剥脱扩增序列，分别对所述睡眠充足扩增序列和所述睡眠剥脱扩增序列进行测序，得到睡眠充足测序序列和睡眠剥脱测序序列；
7、分别对所述睡眠充足测序序列和所述睡眠剥脱测序序列进行肠道菌群可视化，得到睡眠充足肠道菌群图和睡眠剥脱肠道菌群图，分析所述睡眠肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的肠道菌群差异度，基于所述肠道菌群差异度，构建睡眠剥夺对所述待检测sd大鼠的肠道菌群影响报告。
8、进一步地，所述基于所述大鼠数据，分析所述待检测sd大鼠的大鼠特征，包括：
9、对所述大鼠数据进行预处理，得到处理大鼠数据；
10、将所述处理大鼠数据划分为大鼠文本数据和大鼠图像；
11、识别所述文本数据的数据相关系数；
12、基于所述数据相关系数，提取所述文本数据的文本数据特征；
13、对所述大鼠图像进行特征提取，得到大鼠图像特征；
14、将所述文本数据特征和所述大鼠图像特征进行融合，得到所述待检测sd大鼠的大鼠特征。
15、进一步地，所述对所述大鼠图像进行特征提取，得到大鼠图像特征，包括：
16、对所述大鼠图像进行去噪处理，得到去噪大鼠图像；
17、对所述去噪大鼠图像进行边缘检测，得到边缘大鼠图像；
18、提取所述边缘大鼠图像的边缘信息；
19、基于所述边缘信息，分析所述边缘大鼠图像的特征描述子；
20、基于所述特征描述子，识别所述边缘大鼠图像的大鼠图像特征。
21、进一步地，所述对所述去噪大鼠图像进行边缘检测，得到边缘大鼠图像，包括：
22、计算所述去噪大鼠图像的梯度幅值；
23、基于所述梯度幅值，利用下述公式计算所述所述去噪大鼠图像的图像边界值：
24、edgg_map＝max(gx,gy)>th
25、其中，edgg_map表示图像边界值，gx表示去噪大鼠图像水平方向的梯度幅值，gy表示去噪大鼠图像垂直方向的梯度幅值，th表示设定的边缘强度阈值；
26、基于所述图像边界值，构建所述去噪大鼠图像的边缘大鼠图像。
27、进一步地，所述基于所述大鼠特征，评估所述待检测sd大鼠的大鼠健康系数，包括：
28、基于所述大鼠特征，识别所述待检测sd大鼠的身体损失和行为损失；
29、分别分析所述身体损失和所述行为损失的身体损失影响系数和行为损失影响系数；
30、基于所述身体损失、所述行为损失、所述身体损失影响系数以及所述行为损失影响系数，评估所述待检测sd大鼠的大鼠健康系数。
31、进一步地，所述基于所述身体损失、所述行为损失、所述身体损失影响系数以及所述行为损失影响系数，评估所述待检测sd大鼠的大鼠健康系数，包括：
32、基于所述身体损失、所述行为损失、所述身体损失影响系数以及所述行为损失影响系数，利用下述公式计算所述待检测sd大鼠的大鼠缺失值：
33、
34、其中，表示待检测sd大鼠的大鼠缺失值，lc表示损失函数，rt表示第t个身体损失，mt表示第t个身体损失对应的身体损失影响系数，n表示身体损失的数量，rv表示第v个行为损失，sv表示第v个行为损失的行为损失影响系数，m表示行为损失的数量；
35、基于所述大鼠缺失值，评估所述待检测sd大鼠的大鼠健康系数。
36、进一步地，所述对所述睡眠充足基因序列和所述睡眠剥脱基因序列进行扩增，得到睡眠充足扩增序列和睡眠剥脱扩增序列，包括：
37、设计所述睡眠充足基因序列和所述睡眠剥脱基因序列的特异性引物；
38、构建所述特异性引物与所述睡眠充足基因序列和所述睡眠剥脱基因序列的反应体系；
39、基于所述反应体系和所述特异性引物对所述睡眠充足基因序列和所述睡眠剥脱基因序列进行扩增，得到所述睡眠充足扩增序列和所述睡眠剥脱扩增序列。
40、进一步地，所述分析所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的肠道菌群差异度，包括：
41、创建所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的睡眠充足共生矩阵和睡眠剥脱共生矩阵；
42、基于所述睡眠充足共生矩阵和所述睡眠剥脱共生矩阵，计算所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的睡眠充足像素对相关值和睡眠剥脱像素对相关值；
43、基于所述睡眠充足像素对相关值和所述睡眠剥脱像素对相关值，提取所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的睡眠充足纹理信息和睡眠剥脱纹理信息；
44、基于所述睡眠充足纹理信息和所述睡眠剥脱纹理信息，提取所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述方法包括：
2.如权利要求1所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述基于所述大鼠数据，分析所述待检测SD大鼠的大鼠特征，包括：
3.如权利要求2所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述对所述大鼠图像进行特征提取，得到大鼠图像特征，包括：
4.如权利要求3所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述对所述去噪大鼠图像进行边缘检测，得到边缘大鼠图像，包括：
5.如权利要求1所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述基于所述大鼠特征，评估所述待检测SD大鼠的大鼠健康系数，包括：
6.如权利要求5所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述基于所述身体损失、所述行为损失、所述身体损失影响系数以及所述行为损失影响系数，评估所述待检测SD大鼠的大鼠健康系数，包括：
7.如权利要求1所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述对所
8.如权利要求1所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述分析所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的肠道菌群差异度，包括：
9.如权利要求8所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述计算所述睡眠充足肠道菌群图和所述睡眠剥脱肠道菌群图的睡眠充足像素对相关值和睡眠剥脱像素对相关值，包括：
10.一种睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测系统，其特征在于，用于执行如权利要求1-9中任意一项所述的睡眠剥夺对SD大鼠肠道菌群影响的检测方法，所述系统包括：
...【技术特征摘要】
1.一种睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述方法包括：
2.如权利要求1所述的睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述基于所述大鼠数据，分析所述待检测sd大鼠的大鼠特征，包括：
3.如权利要求2所述的睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述对所述大鼠图像进行特征提取，得到大鼠图像特征，包括：
4.如权利要求3所述的睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述对所述去噪大鼠图像进行边缘检测，得到边缘大鼠图像，包括：
5.如权利要求1所述的睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述基于所述大鼠特征，评估所述待检测sd大鼠的大鼠健康系数，包括：
6.如权利要求5所述的睡眠剥夺对sd大鼠肠道菌群影响的检测方法，其特征在于，所述基于所述身体损失、所述行为损失、所述身体...
【专利技术属性】
技术研发人员：郑碧琼，刘昌毅，林诗竹，陈瀚燊，曾凯，
申请(专利权)人：福建医科大学附属第一医院，
类型：发明
国别省市：
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