System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种用于鉴别鱼翅种的DNA条形码引物对及其应用制造技术_技高网

一种用于鉴别鱼翅种的DNA条形码引物对及其应用制造技术

技术编号:40833264 阅读:6 留言:0更新日期:2024-04-01 14:57
本发明专利技术公开了一种用于鉴别鱼翅种的DNA条形码引物对及其应用;所述引物对包括正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明专利技术通过基于CO I基因的DNA条形码技术设计得到用于鉴别鱼翅种的DNA条形码引物对;利用该条形码引物对待检物种进行PCR扩增,将扩增产物用于测序,测序得到的序列与本发明专利技术提供的参考序列进行比对,构建系统进化树来确定待检物种的种类,可以有效鉴别鱼翅种的来源。本发明专利技术用于鉴别鱼翅种的方法简单易行,结果准确可靠,能有效用于鲨鱼物种识别、保护和相关研究。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物,具体涉及一种用于鉴别鱼翅种的dna条形码引物对及其应用。


技术介绍

1、鲨鱼是鱼翅的主要来源,在物种分类中属于软骨鱼纲(chondrichthyes)板鳃亚纲(elasmobranchⅱ)脊椎动物,迄今全球共发现8目25科494种,因此急需建立一种快速、有效的鲨鱼翅物种鉴定方法,可以对背景不明,形态不完整的干鱼翅进行快速物种鉴定,为有关部门履行cites公约提供技术支持。


技术实现思路

1、本专利技术旨在至少解决上述现有技术中存在的技术问题之一。为此,本专利技术提出一种用于鉴别鱼翅种的dna条形码引物对。

2、本专利技术还提出一种含有上述dna条形码引物对的试剂盒。

3、本专利技术还提出上述dna条形码引物对和试剂盒的应用。

4、本专利技术还提出一种鱼翅的检测方法。

5、根据本专利技术的一个方面,提出了一种用于鉴别鱼翅种的dna条形码引物对,所述引物对包括正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如seq id no:1所示;所述反向引物的核苷酸序列如seq id no:2所示。

6、在本专利技术的一些实施方式中,所述鱼翅种包括大青鲨、镰状真鲨、半锯鲨、长鳍真鲨、直齿真鲨、公牛真鲨、钝吻真鲨、沙拉真鲨、尖头斜齿鲨、无沟双髻鲨、路氏双髻鲨、黑斑星鲨、尖吻鲭鲨、深海长尾鲨、浅海长尾鲨、圆犁头鳐、澳洲尖犁头鳐、黑颌犁头鳐、大犁头鳐。

7、在本专利技术的一些实施方式中,所述鱼翅包括干鱼翅。

8、根据本专利技术的第二方面,提出了一种试剂盒,所述试剂盒含有上述dna条形码引物对。

9、在本专利技术的一些实施方式中,所述试剂盒还包括pcr反应混合液。

10、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr反应混合液为taq pcr master mix。

11、根据本专利技术的第三方面,提出了上述dna条形码引物对和试剂盒的应用,所述应用为在制备检测鱼翅的试剂中的应用。

12、在本专利技术的一些实施方式中,所述应用为在鉴别鱼翅真伪中的应用。

13、在本专利技术的一些实施方式中,所述鉴别鱼翅真伪包括鉴别鲨鱼和鳐鱼。

14、在本专利技术的一些实施方式中,所述应用为在检测鱼翅品种中的应用。

15、在本专利技术的一些实施方式中,所述鱼翅的品种包括大青鲨、镰状真鲨、半锯鲨、长鳍真鲨、直齿真鲨、公牛真鲨、钝吻真鲨、沙拉真鲨、尖头斜齿鲨、无沟双髻鲨、路氏双髻鲨、黑斑星鲨、尖吻鲭鲨、深海长尾鲨、浅海长尾鲨、圆犁头鳐、澳洲尖犁头鳐、黑颌犁头鳐、大犁头鳐的鱼翅。

16、在本专利技术的一些实施方式中,所述鱼翅包括干鱼翅。

17、根据本专利技术的第四方面,提出了一种鱼翅的检测方法,所述方法包括以下步骤:采用上述引物或试剂盒对待测样本进行pcr扩增;将pcr扩增得到的产物采用琼脂糖凝胶电泳进行检测,若pcr扩增产物的电泳条带位于约950bp的位置,则待测样品为鲨鱼鱼翅。

18、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr扩增采用的扩增反应体系为:

19、

20、

21、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr扩增采用的扩增程序为:92~96℃预变性3-5min;然后进入循环阶段:92~96℃变性25~35s,50~60℃退火25~35s,70~75℃延伸50~70s,35个循环;70~75℃延伸8~12min。

22、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr扩增采用的扩增程序为:94℃预变性4min;然后进入循环阶段:94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸60s,35个循环;72℃延伸10min。

23、根据本专利技术的第五方面,提出了一种鱼翅品种的鉴定方法,所述方法包括以下步骤:

24、(1)提取待测样本的dna;

25、(2)用上述dna条形码引物或试剂盒对待测样本的dna进行pcr扩增;

26、(3)将pcr扩增产物进行测序,得到待测核苷酸序列;将所述待测核苷酸序列与参考序列进行同源性比对,鉴别鱼翅品种,并进行聚类分析。

27、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr扩增采用的扩增反应体系为:

28、

29、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr扩增采用的扩增程序为:92~96℃预变性3-5min;然后进入循环阶段:92~96℃变性25~35s,50~60℃退火25~35s,70~75℃延伸50~70s,35个循环;70~75℃延伸8~12min。

30、在本专利技术的一些实施方式中,所述pcr扩增采用的扩增程序为:94℃预变性4min;然后进入循环阶段:94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸60s,35个循环;72℃延伸10min。

31、在本专利技术的一些实施方式中,所述同源性比对采用ncbi genbank数据库搜索工具blast进行。

32、在本专利技术的一些实施方式中,所述鉴别鱼翅品种还包括,将所得序列通过mega7.0软件进行分析比对,基于kimura two-parameter model(kimura两参数模型),选择transition substitution(转换替换)以计算各物种的种内和种间遗传距离的步骤。

33、在本专利技术的一些实施方式中,所述聚类分析为构建系统发育树。

34、在本专利技术的一些实施方式中,所述系统发育树采用邻接法构建得到。

35、根据本专利技术的一些实施方式,至少具有以下有益效果:本专利技术提供了一种用于鉴别鱼翅种的dna条形码引物对。通过基于co i基因的dna条形码技术设计得到用于鉴别鱼翅种的dna条形码引物对;利用该条形码引物对待检物种进行pcr扩增,将扩增产物用于测序,测序得到的序列与本专利技术提供的参考序列进行比对,构建系统进化树来确定待检物种的种类,可以有效鉴别鱼翅种的来源。本专利技术用于鉴别鱼翅种的方法简单易行,结果准确可靠,灵敏度高,能有效用于鲨鱼物种识别、保护和相关研究。

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【技术保护点】

1.一种用于鉴别鱼翅种的DNA条形码引物对,其特征在于,所述引物对包括正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。

2.根据权利要求1所述的DNA条形码引物对,其特征在于,所述鱼翅种包括大青鲨、镰状真鲨、半锯鲨、长鳍真鲨、直齿真鲨、公牛真鲨、钝吻真鲨、沙拉真鲨、尖头斜齿鲨、无沟双髻鲨、路氏双髻鲨、黑斑星鲨、尖吻鲭鲨、深海长尾鲨、浅海长尾鲨、圆犁头鳐、澳洲尖犁头鳐、黑颌犁头鳐、大犁头鳐。

3.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1或2所述的DNA条形码引物对。

4.权利要求1-2任一项所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在制备检测鱼翅的试剂中的应用。

5.权利要求1-2任一项所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在鉴别鱼翅真伪中的应用。

6.权利要求1-2任一项所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在检测鱼翅品种中的应用。

7.一种鱼翅的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:采用权利要求1-2任一项所述的引物或权利要求3所述的试剂盒对待测样本进行PCR扩增;将PCR扩增得到的产物采用琼脂糖凝胶电泳进行检测,若PCR扩增产物的电泳条带位于约950bp的位置,则待测样品为鲨鱼鱼翅。

8.根据权利7所述的检测方法,其特征在于,所述PCR扩增采用的扩增程序为:92~96℃预变性3-5min;然后进入循环阶段:92~96℃变性25~35s,50~60℃退火25~35s,70~75℃延伸50~70s,35个循环;70~75℃延伸8~12min。

9.一种鱼翅品种的鉴定方法,其特征在于,所述鉴定方法包括以下步骤:

10.根据权利要求9所述的鉴定方法,其特征在于,所述聚类分析为构建系统发育树。

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【技术特征摘要】

1.一种用于鉴别鱼翅种的dna条形码引物对,其特征在于,所述引物对包括正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如seq id no:1所示;所述反向引物的核苷酸序列如seq id no:2所示。

2.根据权利要求1所述的dna条形码引物对,其特征在于,所述鱼翅种包括大青鲨、镰状真鲨、半锯鲨、长鳍真鲨、直齿真鲨、公牛真鲨、钝吻真鲨、沙拉真鲨、尖头斜齿鲨、无沟双髻鲨、路氏双髻鲨、黑斑星鲨、尖吻鲭鲨、深海长尾鲨、浅海长尾鲨、圆犁头鳐、澳洲尖犁头鳐、黑颌犁头鳐、大犁头鳐。

3.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1或2所述的dna条形码引物对。

4.权利要求1-2任一项所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在制备检测鱼翅的试剂中的应用。

5.权利要求1-2任一项所述的引物或权利要求3所述的试剂盒在鉴别鱼翅真伪中的应用。

6.权利...

【专利技术属性】
技术研发人员:罗宝正陈轩蒋晓霞黄海超邵建宏沙才华林志达赵福振周傲白雪徐博文
申请(专利权)人:拱北海关技术中心
类型:发明
国别省市:

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