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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医药,具体涉及一种前列腺癌辅助诊断的标志物。
技术介绍
1、前列腺腺癌(prostate adenocarcinoma,以下简称前列腺癌)是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤。美国癌症学会2019年统计数据显示,前列腺癌新发病数约占男性所有新发肿瘤病例数的20%,居第一位;而其死亡率仅次于肺癌,居第二位。中国近年统计数据亦显示,前列腺癌的发病率和检出率逐年上升,严重威胁中老年男性的健康。
2、snorna(small nucleolar rna,核仁小rna)是最初发现于真核生物细胞核内的非编码单链rna;长约60-300nt,根据其保守结构元件分为box c/d snorna和box h/acasnorna两大类。snorna在细胞中主要指导rrna转录后修饰,例如假尿嘧啶化修饰和2’-o-核苷酸甲基化(2’-o-me)修饰。在box c/d snorna的boxd上游存在10-21nt核苷酸序列,与靶rna严格配对;结合靶rna,募集nop56/58、p15.5kd蛋白和核仁纤维蛋白(fibrillarin),指导靶rna的2’-o-甲基化修饰。核仁纤维蛋白具有s-腺苷甲硫氨酸依赖的甲基化转移酶的重要结构特征。boxh/acasnorna与靶rna互补序列位于单个或者两个发夹内部的“假尿嘧啶化泡”(pseudouridylation pocket)内,与靶rna上被修饰位点的侧翼序列(约4-8nt)严格互补配对;结合nop10、nhp2、gar1和dyskerin,形成snornp,指导靶rna假
3、目前,人类细胞中已发现数百种snorna中仅少部分snorna有潜在修饰靶rna。近年的研究显示snorna可与多种分子结合,具有多种重要的功能,参与肿瘤的发生和演进,越来越受到研究者关注。与其他线性rna相比,snorna结构更稳定,功能复杂。近年研究显示snorna的异常参与细胞病理过程,与肿瘤发生发展有关。在多种肿瘤中检测到snorna异常表达,可发挥原癌基因或抑癌基因的作用,与预后相关。有些snorna的异常表达有组织特异性,可能成为诊断或预后的分子标记物。因此,探索snorna在肿瘤发生发展中的作用有望成为肿瘤生物医学领域研究的新方向。
4、为此,本专利技术提供一种前列腺癌辅助诊断的标志物及其应用。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是为了解决上述问题,提供一种前列腺癌辅助诊断的标志物。
2、为了达到上述目的,本专利技术的技术方案如下:
3、本专利技术提供了一种前列腺癌辅助诊断的标志物,所述标志物为chd8基因内含子编码的非编码rna snord9,其序列如seq id no.1所示。
4、seq id no.1:
5、tagtgcagcttccatggcagaggaggaagcatctgcagtcagcacagcggcagcccagttcaccaaacttcgccgaggcatggatgaaaaggagtttacagttcaaatcaaagatgtaagctcagcatttgggcattgggaagtggggaaggaggctggaatccttgctgtaactaattttactaataggttactaaactcatttggttagctaattttaaaaatgagaaaacagagcttacaaagatccatttaggaagaatcatttttcctggttgttttccttattgaaccctattgattattaatcctat taatattcaacaaaagtttcttaaattagtatgcttaggaatagcaggattttgcccctgtgatgagttgccatgctaatacggagacaccaggtagggagttttaccctaacttgggtgttgttgaaataaactctttctcgtaaatgctgaggggcactaggtgaagaagtgaaatctttctaaggaaaaagtgtgtatgttttcttgtatttctaattttaccctttagtcagatggccttccttctcaccatcattgggcaagaggatgacctatagcccacatccctcaaagcttaatctttactttgaaaaacatgtaccatatgatgtcttgggtgggtgggttgtcttcctaggaggaaggattgaagttaacattccagaagcacaagttgatggcgaatggagtaatgggagatggacat
6、本专利技术还提供了一种前列腺癌辅助诊断的标志物在制备前列腺癌辅助诊断的试剂盒中的应用。
7、进一步地,所述试剂盒包括逆转录反应体系和qpcr反应体系。
8、进一步地,所述试剂盒包括生物素标记的寡核苷酸探针和pcr引物。
9、进一步地,所述pcr引物为:
10、snord9:fp:5’-cccctgtgatgagttgccat-3’,
11、rp:5’-gcccctcagcatttacgaga-3’。
12、本专利技术解决技术问题的难度及意义在于:
13、snord9为核仁内小rna,长103nt,由chd8内含子编码。snord9属于box c/d snorna家族。box c/d snorna可指导其他rna的2’-o-甲基化修饰。snord9潜在修饰的靶rna为u6。u6在细胞内为rna剪切体的主要组分,参与pre-mrna的剪切加工。目前snord9在肿瘤中的表达和作用尚未见报道。因此,前列腺癌中snord9的表达及作用具有重要的意义。
14、与现有技术相比,本方案的有益效果:
15、1、本专利技术提供了一种前列腺癌辅助诊断的标志物,chd8基因内含子编码的非编码rna snord9能够作为辅助诊断前列腺癌的标志物,其在前列腺癌细胞株和组织中高表达,其表达高低便于指示患者预后生存期;
16、2、通过本专利技术的该标志物在制备前列腺癌辅助诊断的试剂盒中的应用,便于检测前列腺癌患者的活检样品中的snord9,便于快速、准确及清楚的判断前列腺癌患者的预后状况,为患者治疗方案的提供指导,具有较高的临床应用价值。
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1.一种前列腺癌辅助诊断的标志物,其特征是:所述标志物为CHD8基因内含子编码的非编码RNA snoRD9,其序列如SEQ ID NO.1所示。
2.如权利要求1所述的一种前列腺癌辅助诊断的标志物在制备前列腺癌辅助诊断的试剂盒中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征是:所述试剂盒包括逆转录反应体系和qPCR反应体系。
4.如权利要求3所述的应用,其特征是:所述试剂盒包括生物素标记的寡核苷酸探针和PCR引物。
5.如权利要求4所述的应用,其特征是:所述PCR引物为:
【技术特征摘要】
1.一种前列腺癌辅助诊断的标志物,其特征是:所述标志物为chd8基因内含子编码的非编码rna snord9,其序列如seq id no.1所示。
2.如权利要求1所述的一种前列腺癌辅助诊断的标志物在制备前列腺癌辅助诊断的试剂盒中的应用。
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