用于空间组学分析的样本处理方法技术

技术编号:40737237 阅读:19 留言:0更新日期:2024-03-25 19:58
本申请提出了一种用于空间组学分析的样本处理方法,所述样本处理方法包括:向芯片上的生物样本施加100%浓度的甘油,以使所述生物样本被100%浓度的甘油浸润。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及空间组学,具体涉及一种用于空间组学分析的样本处理方法


技术介绍

1、空间转录组技术是一种致力于将空间位置上对应的转录信息量化的技术,它在传统的转录组测序基础上带来了详细的空间信息,帮助研究者辨别组织内部转录的位置,具体可以精确到细胞级别甚至更高的分辨率,促进了对单个细胞和整个组织内细胞群体的认识和解读。

2、在空间转录组技术的基础上,基于原位捕获的空间定位方法也从转录组拓展到其他组学,引发了空间蛋白组、空间免疫组等多组学技术的快速发展。这些多组学技术涉及利用与已知目标多组学物质定向结合、随后进行成像探测的方式来获取空间上的多组学信息;或者通过具备空间坐标的随机探针原位捕获相应的多组学信息、随后转换成cdna进行测序来同时获得捕获产物在空间的定位坐标。

3、在涉及多组学的空间技术中,可以使用染料对样品的组织切片进行荧光染色,之后使用盐溶液洗去多余染料,然后通过荧光显微镜拍照以显示单细胞的分布。然而,相关技术中,荧光信号的淬灭快,且清洗后组织切片表面仍有大量盐的残留,影响芯片track线(相当于芯片上的栅格坐标)的显示,进而本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于空间组学分析的样本处理方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:在向芯片上的生物样本施加100%浓度的甘油前,对所述生物样本进行前处理,其中所述前处理包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述低盐溶液为0.1×SSC缓冲液、20mMNaCl或20mM KCl。

4.根据权利要求2或3中任一项所述的方法,其特征在于,所述前处理还包括:在使用低盐溶液或水对经染色的生物样本进行清洗后,对所述芯片上的生物样本进行干燥,

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其特征在于,所...

【技术特征摘要】

1.一种用于空间组学分析的样本处理方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:在向芯片上的生物样本施加100%浓度的甘油前,对所述生物样本进行前处理,其中所述前处理包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述低盐溶液为0.1×ssc缓冲液、20mmnacl或20mm kcl。

4.根据权利要求2或3中任一项所述的方法,其特征在于,所述前处理还包括:在使用低盐溶液或水对经染色的生物样本进行清洗后,对所述芯片上的生物样本进行干燥,

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

6.根据权利要求1...

【专利技术属性】
技术研发人员:许军强李彩灵廖莎陈奥章文蔚王冰李兆勋
申请(专利权)人:深圳华大生命科学研究院
类型:发明
国别省市:

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