【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子遗传学，具体涉及一种鸡whamm基因snp分子标记及其在鸡蛋用性状选育中的应用。
技术介绍
1、whamm是wiskott-aldrich综合征蛋白(wasp)家族的成员，是一种肌动蛋白成核促进因子(npf)，定位于顺高尔基体装置和肾小管-囊泡膜转运中间体，是微管和肌动蛋白细胞骨架界面上起作用的膜动力学的重要调节剂，对于维持高尔基体结构和促进顺行膜转运具有重要意义(campellone kg et al.，2008)。whamm(与肌动蛋白、高尔基体膜和微管相关的was蛋白同系物)作为成核促进因子参与高尔基体膜缔合、微管结合和肌动蛋白成核，其激活肌动蛋白相关蛋白2/3复合物(arp2/3复合物)。是小鼠卵母细胞减数分裂过程中纺锤体迁移和不对称细胞分裂所必需的(huang x et al.，2013)。whamm在纺锤体形成的早期阶段调节纺锤体的形成并影响微管组织中心(mtoc)的定位。whamm的耗竭使纺锤体肌动蛋白和染色体排列无法形成，这可能是染色体非整倍性和异常、不对称分裂的原因。这些发现表明whamm是肌动蛋白细胞骨架机制的重要组成部分，并且在卵母细胞成熟中起着至关重要的作用，可能是通过通过arp2/3复合物激活纺锤体肌动蛋白的形成来控制正常长度的纺锤体的形成(jo yj et al.，2021)。
2、whamm基因目前仅在哺乳动物中进行了相关研究，禽类方面还没有相关的探索分析，也未见有鸡whamm基因snp分子标记与产蛋性能关联性的相关报道。
技术实现思路>
1、针对上述现有技术，本专利技术的目的是提供鸡whamm基因snp分子标记及其在鸡蛋用性状育种中应用。本专利技术研究发现鸡whamm基因第10内含子的g.9976位点与鸡的产蛋性状相关联，可用于提高鸡产蛋性能的分子标记辅助育种。
2、为实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
3、本专利技术的第一方面，提供一种鸡whamm基因snp分子标记，所述鸡whamm基因snp分子标记为对应于如seq id no.1所示序列自5′端起第433位碱基是g或a；具体如下：
4、ggatgacccttcagaaagccctgcactgcacaaacaggatgactcatccaggaggtctataaataattgcataggtaagtaggctcacattgactgatgtttttcattcttcctttctggtattcttgagttctccctctggttctagacaatagtagcatacagtctttctcaagagaaagaagttcttagaaattcagtttaaaatcagcatgcagtaacaccacaggtcaggatcctaaatgagtaaccatggttggttgatccagtttgatatgctccacaggatcctgacttccagagtgtatgacttggtgttttgggggaaatgctgtctagttgaacattcagtttgatattttaaaacatctgcacttgctgaagatcccgctggtgtaagaggtagaaaggtgtcagaaattccaggta//gag[g/a]gaatttattcatgttgttcatgttggtggta agcaacccttattaccagacttattttttccccagttttacaacagttgaacagaatgactcattttgatgaggataaatcacctgtccagtcaaa agaccgctgtgggtagat。
5、注：序列中，“//”表示限制性内切酶bsc4i的酶切位点；“[g/a]”为snp位点，在序列表中以“n”进行表示。
6、所述鸡whamm基因snp分子标记位于鸡10号染色体whamm基因第10内含子上(参考基因组：grcg6a(gcf_000002315.6))，将其命名为g.9976，研究发现该位点与鸡的产蛋性状极显著关联。
7、本专利技术的第二方面，提供上述鸡whamm基因snp分子标记在鸡遗传育种中的应用。
8、上述应用中，所述鸡遗传育种包括：52周龄产蛋总数高和/或最长连产天数长的蛋鸡品种选育。
9、进一步的，上述应用中，所述snp标记的gg基因型个体表现出52周龄产蛋总数高和最长连产天数较长的产蛋性状。
10、本专利技术的第三方面，提供用于检测上述鸡whamm基因snp分子标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列分别如seq id no.2和seq id no.3所示。具体如下：
11、g.9976-f：5′-ggatgacccttcagaaagc-3′；(seq id no.2)
12、g.9976-r：5′-atctacccacagcggtctt-3′。(seq id no.3)
13、本专利技术的第四方面，提供一种用于检测上述鸡whamm基因snp分子标记的试剂盒，所述试剂盒中包含seq id no.2和seq id no.3所示的引物对。
14、本专利技术的第五方面，提供上述引物对和/或试剂盒在辅助选育蛋鸡品种或品系中的应用；所述蛋鸡品种或品系具有52周龄产蛋总数高和/或最长连产天数长的产蛋性状。
15、本专利技术的第六方面，提供一种鉴定蛋鸡产蛋性状的方法，包括以下步骤：
16、以待测蛋鸡的基因组dna为模板，利用seq id no.2和seq id no.3所示的引物对进行pcr扩增，得到扩增产物；将扩增产物用限制性内切酶bsc4i酶切处理，若出现149bp和429bp两条条带，则待测蛋鸡对应的鸡whamm基因snp分子标记为gg基因型；若出现578bp一条条带，则待测蛋鸡为aa基因型；若出现149bp、429bp、578bp三条条带，则待测蛋鸡为ga基因型；
17、所述gg基因型的蛋鸡的52周龄产蛋总数和最长连产天数均高于aa基因型和ga基因型。
18、上述方法中，pcr扩增的体系为：2×rapid taq master mix 10μl、seq id no.2和seq id no.3所示的引物各1μl、dna模板1μl、ddh2o 7μl。
19、pcr扩增的反应程序为：98℃5min；95℃15s，64℃15s，58.3℃15s，35个循环；72℃10s，72℃5min。
20、本专利技术的第七方面，提供一种与鸡产蛋性状相关联的snp分子标记组合，包括：分子标记g.8752、分子标记rs735101591、分子标记g.9976和分子标记rs315273441；
21、所述分子标记g.8752的物理位置为10_11543984，核苷酸多态性为a或g；分子标记rs735101591的物理位置为10_11544148，核苷酸多态性为a或c；分子标记g.9976的物理位置为10_11545372，核苷酸多态性为a或g；分子标记rs315273441的物理位置为10_11546390，核苷酸多态本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种鸡WHAMM基因SNP分子标记，其特征在于，所述鸡WHAMM基因SNP分子标记为对应于如SEQ ID NO.1所示序列自5′端起第433位碱基是G或A。
2.权利要求1所述的鸡WHAMM基因SNP分子标记在蛋鸡遗传育种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述蛋鸡遗传育种包括：52周龄产蛋总数高和/或最长连产天数长的蛋鸡品种选育。
4.用于检测权利要求1所述的鸡WHAMM基因SNP分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。
5.一种用于检测权利要求1所述的鸡WHAMM基因SNP分子标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包含SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的引物对。
6.权利要求4所述的引物对和/或权利要求5所述的试剂盒在辅助选育蛋鸡品种或品系中的应用；所述蛋鸡品种或品系具有52周龄产蛋总数高和/或最长连产天数长的产蛋性状。
7.一种鉴定蛋鸡产蛋性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
8.一
9.权利要求8所述的SNP分子标记组合在鸡遗传育种中的应用；所述鸡遗传育种包括：52周龄产蛋总数高和/或最长连产天数长的蛋鸡品种或品系选育。
10.一种利用权利要求8所述的SNP分子标记组合辅助选育蛋鸡品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：
...【技术特征摘要】
1.一种鸡whamm基因snp分子标记，其特征在于，所述鸡whamm基因snp分子标记为对应于如seq id no.1所示序列自5′端起第433位碱基是g或a。
2.权利要求1所述的鸡whamm基因snp分子标记在蛋鸡遗传育种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述蛋鸡遗传育种包括：52周龄产蛋总数高和/或最长连产天数长的蛋鸡品种选育。
4.用于检测权利要求1所述的鸡whamm基因snp分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列分别如seq id no.2和seq id no.3所示。
5.一种用于检测权利要求1所述的鸡whamm基因snp分子标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包含seq id no.2和seq id no.3...
【专利技术属性】
技术研发人员：康丽，吕佳蓓，黄振邦，姜运良，孙亿，唐辉，李显耀，
申请(专利权)人：山东农业大学，
类型：发明
国别省市：
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