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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学,具体涉及一种snp位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用。
技术介绍
1、盱眙山区水牛是役肉兼用型水牛地方品种,也是国内公认的著名良种水牛之一。盱眙山区水牛原产于江苏省淮安市盱眙县,周边的淮安、扬州、南京等丘陵山区均有散养分布,南通、泰州、常州、无锡也有零星分布。2006年江苏省盱眙山区水牛存栏量约9000头,中心产区存栏5400头。但目前役用逐渐减少,主要用于产肉,近年来用摩拉水牛改良较多。近20年来盱眙山区水牛存栏量呈逐渐下降趋势,处于濒危状态。为了了解盱眙山区水牛遗传背景、遗传结构以及遗传多样性以及个体识别。而仅从外观等表征上很难进行这项工作,因此制定更加精准的鉴定方法是十分有必要的。
2、dna指纹图谱是指dna样品用特定分子标记技术处理显示出具有特定dna片段的总称。随着生物技术的进步与发展,dna指纹图谱技术在品种资源多样性和品种鉴定研究中得到广泛的应用。其中,用于构建dna指纹图谱的snp分子标记具有多态性检出率高、基因组中分布广泛、结果稳定可靠等特点等优点。
3、目前,dna指纹图谱技术在水牛品种上的应用并不多,以snp分子标记来构建盱眙山区水牛dna指纹图谱的更是未见报道。基于snp标记的盱眙山区水牛dna指纹图谱的构建能够为盱眙山区水牛品种的区别鉴定提供了准确、高效的依据。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于克服现有技术的不足之处,提供了一种snp位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,解决了上述
技术介绍
中盱眙山区水
2、本专利技术解决其技术问题所采用的技术方案是:提供了一种snp位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,用于构建盱眙山区水牛dna指纹图谱;鉴定盱眙山区水牛品种真实性;分析盱眙山区水牛的遗传信息、遗传相似性、遗传分化程度;
3、snp位点组合由1086个snp位点组成,所述1086个snp位点的物理位置基于盱眙山区水牛的基因组序列比对确定。
4、优选地,包括检测所述1086个snp位点的分子标记探针,所述探针核苷酸序列为seq id no:1~seq id no:1086。
5、优选地,所述盱眙山区水牛的基因组序列版本号为nddb_sh_1。
6、本技术方案与
技术介绍
相比,它具有如下优点:
7、本专利技术采用盱眙山区水牛的基因组序列比对确定的1086个snp位点作为组合,能够构建盱眙山区水牛dna指纹图谱,准确、高效的鉴定盱眙山区水牛品种真实性,分析盱眙山区水牛的遗传信息、遗传相似性、遗传分化程度。
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1.一种SNP位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,其特征在于:用于构建盱眙山区水牛DNA指纹图谱;鉴定盱眙山区水牛品种真实性;分析盱眙山区水牛的遗传信息、遗传相似性、遗传分化程度;
2.根据权利要求1所述的一种SNP位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,其特征在于:包括检测所述1086个SNP位点的分子标记探针,所述探针核苷酸序列为SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:1086。
3.根据权利要求1所述的一种SNP位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,其特征在于:所述盱眙山区水牛的基因组序列版本号为NDDB_SH_1。
【技术特征摘要】
1.一种snp位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,其特征在于:用于构建盱眙山区水牛dna指纹图谱;鉴定盱眙山区水牛品种真实性;分析盱眙山区水牛的遗传信息、遗传相似性、遗传分化程度;
2.根据权利要求1所述的一种snp位点组合在鉴定盱眙山区水牛中的应用,其特征在于:...
【专利技术属性】
技术研发人员:夏淑雯,王慧利,陈坤琳,沈阳阳,丁强,赵芳,仲跻峰,高林娜,安振江,
申请(专利权)人:江苏省农业科学院,
类型:发明
国别省市:
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