【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子标记，具体涉及一种凡纳滨对虾快速生长分子标记lvkdz-s1及其应用。
技术介绍
1、凡纳滨对虾(penaeus vannamei)又称南美白对虾、白虾，隶属于节肢动物门(arthropoda)、软甲纲(malacostraca)、十足目(decapoda)、枝鳃亚目(dendrobranchiata)、对虾科(penaeidae)、对虾属(penaeus)。它是世界养殖虾类产量最高的三大种类之一，也是全球单一经济价值最高的海水养殖种类，全球产量超过630万吨。凡纳滨对虾的特点是生长快、适应性强，在人工控制的条件下，生长速度可达到0.3～0.5g/天，养殖周期3个月以内即可达到商品规格，因此生长速度一直是对虾遗传改良首先关注的极重要的经济性状。
2、以规模化家系选育和数量遗传学为基础的选择育种技术，已经广泛应用于凡纳滨对虾育种项目，以此选育出的快速生长品系，生长速度得到了明显改良。然而相比于畜牧物种和农作物，对虾选育仍存在选择进展慢、效率低等问题。其一方面重要原因是仅利用表型及系谱数据选育，选择的准确性和可靠性仍有待提高。而利用高通量基因组学信息，筛选出与生长显著关联的snp位点，鉴定出关键基因及通路，开展分子标记辅助育种可有效提高选择的准确性和可靠性，进一步加快遗传改良的进程。
3、分子标记目前在遗传改良中主要应用于亲缘关系鉴定、群体遗传背景分析等场景，而其更直接高效的利用方法是筛查到与目的性状基因紧密连锁的标记，进一步对选育群体个体进行包含目标位点的基因组位点分型、根据等位基因/基因
技术实现思路
1、本专利技术旨在提供一种凡纳滨对虾快速生长分子标记lvkdz-s1及其应用。所述分子标记lvkdz-s1可通过高通量低成本的芯片检测方法快速检测，从而用于凡纳滨对虾快速生长性状的高效辅助选育。
2、为实现上述专利技术目的，本专利技术采用以下技术方案予以实现：
3、本专利技术提供了一种凡纳滨对虾快速生长分子标记lvkdz-s1，其核苷酸序列如seqid no.1所示。
4、进一步的，所述分子标记lvkdz-s1的多态位点为a/t，即所述分子标记lvkdz-s1的核苷酸序列的第101位碱基为a或者t。
5、进一步的，所述分子标记lvkdz-s1位于凡纳滨对虾基因组17号连锁群的2,344,760物理位置。
6、本专利技术还提供了一种筛选生长快速的凡纳滨对虾的方法，其特征在于，包括以下步骤：
7、(1)提取待测的凡纳滨对虾的基因组dna；
8、(2)检测凡纳滨对虾基因组dna的17号连锁群的2,344,760物理位置的权利要求1所述的分子标记lvkdz-s1是否具有多态性并检测基因型；
9、(3)根据基因型的分型结果，筛选出生长快速的凡纳滨对虾。
10、进一步的，所述生长快速的凡纳滨对虾的基因型为aa基因型。
11、进一步的，所述步骤(2)中基因型的检测利用的是通过genobaits探针捕获技术的55k“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片。
12、本专利技术还提供了所述的分子标记lvkdz-s1在凡纳滨对虾快速生长性状的鉴定和筛选中的应用。
13、本专利技术还提供了所述的分子标记lvkdz-s1在凡纳滨对虾快速生长新品种/系的选育中的应用。
14、进一步的，所述凡纳滨对虾快速生长新品种/系为aa基因型。
15、进一步的，在选育过程中，提取凡纳滨对虾父本和母本的基因组dna，检测所述分子标记lvkdz-s1位点的基因型，根据分型结果：(1)保留均为aa基因型的父本和母本进行留种和传代；(2)若父本和母本并不均为aa基因型，则选择父本和母本分别为aa基因型与at基因型进行交配；或者选择父本和母本均为at基因型进行交配，并在交配后代中继续筛选出具有aa基因型的个体。
16、本专利技术与现有技术相比，具有以下优点：
17、1、本专利技术提供的凡纳滨对虾快速生长相关分子标记lvkdz-s1可以从分子水平上对生长快速个体进行选择，不受生长阶段和个体大小的限制，且能够在早期进行选择，提高选择的准确率和效率，加快生长速度的选育进程。
18、2、本专利技术提供的分子标记lvkdz-s1可使用高通量自动化的商品化液相芯片55k“黄海芯1号”检测，检测流程标准化、检测速度快，且成本远低于传统的重测序、简化基因组测序等技术方法，具有较高的实际应用价值。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种凡纳滨对虾快速生长分子标记LvKDZ-S1，其特征在于，所述分子标记LvKDZ-S1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
2.根据权利要求1所述的分子标记LvKDZ-S1，其特征在于，所述分子标记LvKDZ-S1的多态位点为A/T，即所述分子标记LvKDZ-S1的核苷酸序列的第101位碱基为A或者T。
3.根据权利要求1所述的分子标记LvKDZ-S1，其特征在于，所述分子标记LvKDZ-S1位于凡纳滨对虾基因组17号连锁群的2,344,760物理位置。
4.一种筛选生长快速的凡纳滨对虾的方法，其特征在于，包括以下步骤：
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述生长快速的凡纳滨对虾的基因型为AA基因型。
6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤(2)中基因型的检测利用的是通过GenoBaits探针捕获技术的55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片。
7.权利要求1-3任一项所述的分子标记LvKDZ-S1在凡纳滨对虾快速生长性状的鉴定和筛选中的应用。
8.权利要求1-3任一
9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，所述凡纳滨对虾快速生长新品种/系为AA基因型。
10.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，在选育过程中，提取凡纳滨对虾父本和母本的基因组DNA，检测所述分子标记LvKDZ-S1位点的基因型，根据分型结果：(1)保留均为AA基因型的父本和母本进行留种和传代；(2)若父本和母本并不均为AA基因型，则选择父本和母本分别为AA基因型与AT基因型进行交配；或者选择父本和母本均为AT基因型进行交配，并在交配后代中继续筛选出具有AA基因型的个体。
...【技术特征摘要】
1.一种凡纳滨对虾快速生长分子标记lvkdz-s1，其特征在于，所述分子标记lvkdz-s1的核苷酸序列如seq id no.1所示。
2.根据权利要求1所述的分子标记lvkdz-s1，其特征在于，所述分子标记lvkdz-s1的多态位点为a/t，即所述分子标记lvkdz-s1的核苷酸序列的第101位碱基为a或者t。
3.根据权利要求1所述的分子标记lvkdz-s1，其特征在于，所述分子标记lvkdz-s1位于凡纳滨对虾基因组17号连锁群的2,344,760物理位置。
4.一种筛选生长快速的凡纳滨对虾的方法，其特征在于，包括以下步骤：
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述生长快速的凡纳滨对虾的基因型为aa基因型。
6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤(2)中基因型的检测利用的是通过genobaits...
【专利技术属性】
技术研发人员：傅强，王平，孔杰，栾生，孟宪红，强光峰，罗坤，代平，陈宝龙，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院黄海水产研究所，
类型：发明
国别省市：
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