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基于诱导多能干细胞的癌症疫苗制造技术

技术编号:40634472 阅读:3 留言:0更新日期:2024-03-13 21:18
在一个实施方式中,本申请公开了一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(iPSC);其中自体疫苗或同种异体疫苗表达选自由ASTE1、BIRC5、CDCA1、CDKN2A、DEPDC1、EGER、ERBB2、F0XM1、GPC3、HJURP、HSPA8、HSP90B1、IDH1、ID01、IGF2BP3、IMP3、KIF20A、KIF20B、MEEK、MGAT5、NUF2、PMEL、RAS、TAF1B、TOMM34、TTK、TP53、VEGFR1和VEGFR2组成的组的基因;并且其中自体疫苗或同种异体疫苗诱导患者的免疫应答用于癌症的治疗。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、yamanaka和同事(yamanaka s.et al.cell 126:663-76,2006;综述于shi y.etal.nat rev drug discov.16:115-130,2017)研发了将成体细胞恢复到胚胎状态(“重编程(reprogramming)”)的方法。这些诱导多能干细胞(ipsc)可以通过将四个转录因子引入至成年体细胞中来生成,该成年体细胞将其转录和表观遗传状态转化为与胚胎干细胞(esc)非常相似的多能状态。

2、kooreman等人(us2019/0290697,其通过参考整体并入本文)注意到,ipsc和癌细胞的基因表达有许多相似之处,并使用ipsc研发了一种防止多种癌症生长的疫苗。这些作者确定了该疫苗的最佳效果是从个体获得细胞,将那些细胞重编程为ipsc,并将该个体的ipsc与佐剂一起用作疫苗以用于该个体(“自体”疫苗接种)。这些研究人员还确认了一种特定类型的佐剂,该佐剂由短的、合成的、非甲基化的基于cpg基序的寡脱氧核苷酸(“cpg”)组成,在它们的模型中是最有效的。


技术实现思路

1、特别地,本专利公开披露了一种治疗患者中的癌症的方法,该方法包括对患者进行疫苗接种,其中疫苗包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物多能干细胞,并且疫苗还包含佐剂,该佐剂是一种可促进对疫苗的免疫应答的免疫试剂,并且其中疫苗接种包括向有需要的患者施用哺乳动物多能干细胞的步骤。在该方法的一个方面,多能干细胞是诱导多能干细胞(ipsc)。在该方法的另一个方面,哺乳动物多能干细胞是未分化的多能干细胞。在该方法的另一个方面,采用含有四种重编程因子(包括oct4、c-myc、klf-4和sox2)的微小内含子(mini-intronic)质粒生成多能干细胞,并且可以加入shrna p53。在另一个方面,通过对体细胞重编程获得的干细胞选自由成纤维细胞、角质形成细胞、外周血细胞和肾上皮细胞组成的组。在又一个方面,根据以下方法中的至少一种施用疫苗:a)作为独立的疫苗接种;b)作为肿瘤切除前的辅助治疗;c)作为肿瘤切除后的辅助治疗;d)在转移环境中;e)在没有肿瘤或癌症的情况下作为预防性设置(措施,setting);和f)与化疗、免疫疗法、靶向治疗组合,使用生物试剂、使用小分子试剂,用包含生物试剂或小分子试剂或其组合的纳米颗粒。在该方法的又一个方面,癌症选自由乳腺癌、黑色素瘤和间皮瘤组成的组。在该方法的另一个方面,癌症选自由白血病、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、淋巴瘤、骨髓增生性疾病、鳞状细胞癌、腺癌、肉瘤、神经内分泌癌、膀胱癌、皮肤癌、脑和脊髓癌、头颈癌、甲状腺癌、骨癌、乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、胃肠道癌、(下)喉癌、食管癌、肝癌、肺癌、胰腺癌、前列腺癌、眼癌、肾细胞癌、肾癌、原发性肝癌、卵巢癌、胃癌、睾丸癌、甲状腺癌和胸腺癌组成的组。

2、在另一个实施方式中,本专利公开披露了一种对哺乳动物进行多能干细胞癌症疫苗接种的方法,该方法包括:引入通过对来自接受者的体细胞重编程而获得的哺乳动物多能干细胞,其中疫苗还包含佐剂,其中该佐剂是一种促进对疫苗的免疫应答的免疫试剂;以及向接受者提供疫苗。在该方法的一个方面,哺乳动物细胞是未分化的多能细胞。在另一个方面,采用含有四种重编程因子(包括oct4、c-myc、klf-4和sox2)的微小内含子质粒生成多能干细胞。在又一个方面,通过对选自由成纤维细胞、角质形成细胞、外周血细胞和肾上皮细胞组成的组的体细胞重编程获得多能干细胞。在又一个方面,在疫苗接种前先对疫苗进行辐照。

3、在本专利公开的一个实施方式中,提供了一种热稳定疫苗组合物,该组合物包含有效量的通过对来自哺乳动物的体细胞重编程而获得的哺乳动物多能干细胞和促进对疫苗的免疫应答的佐剂或免疫试剂。在疫苗组合物的一个方面,多能干细胞是诱导多能干细胞(ipsc)。在另一个方面,哺乳动物多能干细胞是未分化的多能干细胞。在又一个方面,通过对体细胞重编程获得的干细胞是通过对选自由成纤维细胞、角质形成细胞、外周血细胞和肾上皮细胞组成的组的体细胞重编程获得的。在又一个方面,佐剂选自由cpg、qs21、聚(二(羧酸酯基苯氧基)磷腈;脂多糖的衍生物如单磷酰脂质a、胞壁酰二肽(mdp;ribi)、苏氨酰胞壁酰二肽(t-mdp;ribi);om-174;霍乱毒素(ct)和利什曼原虫延伸因子组成的组。

4、本专利技术人发现,需要研发能够呈递额外抗原以增强对个体癌症的应答的ipsc。还需要研发现成产品,其中来自一个个体的ipsc可以用于治疗遗传不相关的个体(“同种异体疫苗接种”)以及还需要确认可致使更强或更有效免疫应答的其他佐剂和靶向策略。还需要制定ipsc癌症疫苗在其生产期间的有效性(“释放标准”)以及向个体施用后的有效性(“生物标记物”)的判断标准。

5、在一个实施方式中,本申请提供了用于生成预防性或治疗性靶向多种类型癌症的癌症疫苗的组合物和方法。在一个方面,疫苗包含佐剂以及ipsc或生成微小内含子质粒的ipsc(mip-ipsc)。在一个变体中,佐剂与ipsc混合。可以通过将细胞与佐剂一起温育而将佐剂负载到ipsc上。在一个变体中,佐剂被基因编码在ipsc中。

6、在一个实施方式中,癌症疫苗是自体的(或自生的(autogenous))。如本文所用,自体或自生疫苗是指一种可以通过对来自个体的细胞重编程制备的并且可以用于为同一个体提供免疫性的疫苗。

7、在一个实施方式中,癌症疫苗是一种现成的同种异体产品。

8、在一个实施方式中,提供了用于自体和同种异体癌症疫苗生成和疫苗接种方案(制度,regimen)的方法。本专利技术人出乎意料地发现,在一个具体的方面,同种异体ipsc疫苗不如自体疫苗有效并且已经研发了提高自体和同种异体疫苗接种的效力的方法。

9、在一个方面,癌症疫苗被基因工程化以提高抗原呈递的效力。

10、在组合物和方法的另一个实施方式中,自体或同种异体疫苗被基因改变以表达抗体或抗体片段。抗体可以是单克隆抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单链抗体、抗体片段、或其组合。抗体可以由ips细胞分泌,或者它们可以作为跨膜蛋白在细胞表面表达。抗体对例如癌症抗原、细胞因子、生长因子或其受体、或在t细胞表面表达的蛋白质具有反应性。术语“抗体”可以用于限定任何能够结合配体的完整细胞表面蛋白,包括但不限于由重链和轻链组成的免疫球蛋白;单链可变片段(scfv),其是免疫球蛋白重链(vh)和轻链(vl)可变区的融合蛋白;骆驼科(camelid)单结构域抗体;纳米抗体或本领域已知的其他变体。

11、在一个变体中,ips细胞被基因改变以在其细胞表面表达抗cd28和抗cd80。

12、在一个变体中,自体或同种异体疫苗被基因工程化以表达选自由icam1、lfa-1、lfa-3、cd80、cd81、cd28、icos、4-1bb、抗dec-205抗体、抗clec9a(dngr)抗体、抗dcir本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(iPSC):

2.根据权利要求1所述的疫苗,其中所选择的一种或多种基因由所述患者中的癌症类型确定,所述癌症类型选自由以下组成的组:

3.一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(iPSC):

4.根据权利要求3所述的疫苗,其中所述抑制性RNA选自由反义RNA、siRNA、shRNA、miRNA、lncRNA、pri-miRNA、反义寡核苷酸和pre-miRNA组成的组。

5.根据权利要求3或4所述的疫苗,其中所述抑制性RNA抑制选自由MHC I类、MHC II类、β2微球蛋白和LAMP组成的组的基因的表达。

6.根据权利要求5所述的疫苗,其中所述抑制性RNA抑制选自包括PD-1、PDL-1、PDL-2、Nodal、细胞因子信号传导1(SOCS1)、IL-10、IL-10R、TGF-β和TGF-βR的列表的基因的表达。

7.一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(iPSC):

8.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由ICAM1、LFA-1、LFA-3、CD80、CD81、CD28、ICOS、4-1BB、抗DEC-205抗体、抗CLEC9A(DNGR)抗体、抗DCIR-2抗体、抗DECTIN抗体、抗ASGPR抗体、抗甘露糖受体抗体和抗CLEC12(DCAL-2)抗体组成的组。

9.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由XCR1、CCL3、CCL4、CCL5、CCL20、CCL25和FLT3L组成的组。

10.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由GM-CSF、INF-α、INF-β、IL-2、IL-12、IL-15和IL-21.9组成的组。

11.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由gp96、hsp90、hsp70、CD91、钙网蛋白和LOX-1组成的组。

12.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由B7、OX40、CD28、CD40L、TLR4、CD70、MHC I类、MHC II类和OX40L组成的组。

13.根据权利要求1至12中任一项所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述哺乳动物诱导多能干细胞是非存活的并且在细胞表面表达选自由钙网蛋白、Hsp70和HSP90组成的组的蛋白质。

14.根据权利要求13所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述哺乳动物诱导多能干细胞通过体外施用化疗剂被杀死。

15.根据权利要求14所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述化疗剂选自由奥沙利铂和多柔比星组成的组。

16.根据权利要求1至3中任一项所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述疫苗还包含树突细胞,其中所述树突细胞获自所述患者。

17.根据权利要求16所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述树突细胞用由获自所述患者的成体细胞重编程的iPS细胞进行冲激。

18.根据权利要求16所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述树突细胞在组织培养物中生长并且在将其递送回所述患者前用来自所述诱导多能干细胞的抗原进行冲激。

19.根据权利要求18所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述树突细胞选自用全多能干细胞、来自多能干细胞的提取物、来自多能干细胞的mRNA、来自多能干细胞的cDNA或者来自多能干细胞的蛋白质或肽冲激的树突细胞的组。

20.根据权利要求1至19中任一项所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,其中所述癌症选自由白血病、多发性骨髓瘤、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、淋巴瘤、骨髓增生性疾病、鳞状细胞癌、腺癌、肉瘤、神经内分泌癌、膀胱癌、皮肤癌、脑和脊髓癌、头颈癌、甲状腺癌、骨癌、乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、胃肠道癌、(下)喉癌、食管癌、肝癌、肺癌、胰腺癌、前列腺癌、眼癌、肾细胞癌、肾癌、原发性肝癌、卵巢癌、胃癌、睾丸癌、甲状腺癌和胸腺癌组成的组。

21.根据权利要求20所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗组合物,其中佐剂是CpG并且每剂量CpG的量为1mg、2mg、3mg、4mg、5mg、6mg、7mg、8mg、9mg或10mg。

22.根据权利要求21所述的哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗组合物,其中每剂量iPS细胞数为1000万、2500万、5000万、1亿、2亿、4亿...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(ipsc):

2.根据权利要求1所述的疫苗,其中所选择的一种或多种基因由所述患者中的癌症类型确定,所述癌症类型选自由以下组成的组:

3.一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(ipsc):

4.根据权利要求3所述的疫苗,其中所述抑制性rna选自由反义rna、sirna、shrna、mirna、lncrna、pri-mirna、反义寡核苷酸和pre-mirna组成的组。

5.根据权利要求3或4所述的疫苗,其中所述抑制性rna抑制选自由mhc i类、mhc ii类、β2微球蛋白和lamp组成的组的基因的表达。

6.根据权利要求5所述的疫苗,其中所述抑制性rna抑制选自包括pd-1、pdl-1、pdl-2、nodal、细胞因子信号传导1(socs1)、il-10、il-10r、tgf-β和tgf-βr的列表的基因的表达。

7.一种哺乳动物自体疫苗或同种异体疫苗,包含有效量的通过对来自患者的体细胞重编程而获得的哺乳动物诱导多能干细胞(ipsc):

8.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由icam1、lfa-1、lfa-3、cd80、cd81、cd28、icos、4-1bb、抗dec-205抗体、抗clec9a(dngr)抗体、抗dcir-2抗体、抗dectin抗体、抗asgpr抗体、抗甘露糖受体抗体和抗clec12(dcal-2)抗体组成的组。

9.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由xcr1、ccl3、ccl4、ccl5、ccl20、ccl25和flt3l组成的组。

10.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由gm-csf、inf-α、inf-β、il-2、il-12、il-15和il-21.9组成的组。

11.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由gp96、hsp90、hsp70、cd91、钙网蛋白和lox-1组成的组。

12.根据权利要求7所述的疫苗,其中所述基因选自由b7、ox40、cd28、cd40l、tlr4、cd70、mhc i类、...

【专利技术属性】
技术研发人员:斯蒂芬·D·沃尔普琳内·A·布伊奈杰尔·G·科雷曼
申请(专利权)人:克洛里斯生物科学有限公司
类型:发明
国别省市:

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