【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及基因工程，具体涉及一种花生长相关的snp分子标记及应用。
技术介绍
1、花(hemibarbus maculatus bleeker)俗称吉勾鱼、麻吉鱼，隶属于鲤形目、鲤科、鮈亚科、属，是我国淡水水域中重要的中小型经济鱼类之一。由于其肉质细嫩，出肉率高，刺少，而且蛋白质和多不饱和脂肪酸(pufa)的含量较高，深受消费者的喜爱。随着花人工繁养技术的突破，其养殖规模逐渐扩大，但是在养殖生产中存在生长速度慢，大小规格分化严重和良种匮乏等问题。因此，研究花生长发育调控的分子机制，改善其生长性能具有重要意义。
2、在水产动物育种中，生长性状是最具有价值的经济性状之一，也是水产动物遗传改良的主要目标。众所周知，遗传因子和环境因子(温度、光照、溶氧、营养等)对鱼类的生长发育具有重要作用。基因是调节和控制鱼类生长的内在因素，随着基因测序技术的高速发展，人们已鉴定出一些与生长性状相关的候选基因和分子标记。单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphisms，snp)作为最新一代分子遗传标记，已广泛应用于水产动物遗传育种研究中。snp是指在生物体内基因组上单个核苷酸变异产生的dna序列多态性，利用这些单碱基差异可以来鉴别同种生物不同个体之间的遗传差异。snp标记具有遗传稳定性高、数量多、检测方便以及基因分型准确率高等优点，是一种理想的分子标记。因此，snp标记被广泛运用到水产动物遗传育种中，是分子标记辅助育种的一种重要的技术手段。
3、近年来发展的简化基因组测序(genotyping b
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于克服现有技术的不足之处而提供一种花生长相关的snp分子标记及应用，以获得与花生长性状相关的分子标记，为提高花的养殖效率以及育种改良提供有效途径。
2、为实现上述目的，本专利技术采取的技术方案如下：
3、第一方面，本专利技术提供了一种花生长相关的snp分子标记，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示；seq id no.1所示序列自5'端起第47位碱基为snp位点；所述snp位点为a或t。
4、本专利技术的花生长性状相关的snp分子标记能够从分子层面为花的遗传育种提供参考，进行优良品种选育，加速育种进程。
5、作为本专利技术所述的snp分子标记的优选实施方式，若基因型为aa，则对应花生长状态差，若基因型为at，则对应花生长状态优良。
6、第二方面，本专利技术提供了一种用于检测花生长性状的引物对，所述引物对的核苷酸序列为cataaaatgcacagtt和tgttcagcgtgcgta。
7、第三方面，本专利技术提供了一种用于检测花生长性状的试剂盒，包含所述的引物对。
8、第四方面，本专利技术将所述的snp分子标记、所述的引物对、所述的试剂盒在花分子标记辅助选择育种中应用。
9、第五方面，本专利技术将所述的snp分子标记、所述的引物对、所述的试剂盒在鉴定花生长性状中应用。
10、作为本专利技术所述的应用的优选实施方式，所述生长性状包括体重、体高和头长。
11、第六方面，本专利技术提供了一种鉴定花生长性状的方法，包括以下步骤：
12、(1)提取花组织的dna；
13、(2)利用所述的引物对，对步骤(1)所提取样品进行pcr扩增；
14、(3)对步骤(2)中的扩增产物测序；判定生长性状。
15、作为本专利技术所述的方法的优选实施方式，在步骤(2)中，所述pcr扩增的条件为：94℃预变性3min；94℃30s，52℃1min，72℃1min，扩增30个循环，72℃延伸5min，最后降温至12℃。
16、作为本专利技术所述的方法的优选实施方式，在步骤(3)中，所述判定生长性状的标准为：所述测序条带的基因型为aa，则对应花生长状态差；所述测序条带的基因型为at，则对应花生长状态优良。
17、与现有技术相比，本专利技术的有益效果为：
18、本专利技术的花生长性状相关的snp分子标记能够从分子层面为花的遗传育种提供参考，进行优良品种选育，加速育种进程。
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1.一种花生长相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；SEQ ID NO.1所示序列自5'端起第47位碱基为SNP位点；所述SNP位点为A或T。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，若基因型为AA，则对应花生长状态差，若基因型为AT，则对应花生长状态优良。
3.一种用于检测花生长性状的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列为CATAAAATGCACAGTT和TGTTCAGCGTGCGTA。
4.一种用于检测花生长性状的试剂盒，其特征在于，包含权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1所述的SNP分子标记、权利要求3所述的引物对、权利要求4所述的试剂盒在花分子标记辅助选择育种中的应用。
6.权利要求1所述的SNP分子标记、权利要求3所述的引物对、权利要求4所述的试剂盒在鉴定花生长性状中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述生长性状包括体重、体高和头长。
8.一种鉴定花生长性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：<...
【技术特征摘要】
1.一种花生长相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示；seq id no.1所示序列自5'端起第47位碱基为snp位点；所述snp位点为a或t。
2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其特征在于，若基因型为aa，则对应花生长状态差，若基因型为at，则对应花生长状态优良。
3.一种用于检测花生长性状的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列为cataaaatgcacagtt和tgttcagcgtgcgta。
4.一种用于检测花生长性状的试剂盒，其特征在于，包含权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1所述的snp分子标记、权利要求3所述的引物对、权利要求4所述的试剂盒在花分子标记辅助选择育种中的...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘慧芬，王月颖，王新宇，张俊泰，王宇颉，马晓，田雪，李学军，
申请(专利权)人：河南师范大学，
类型：发明
国别省市：
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