【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及图片数据处理，特别涉及一种基于数字病理切片文件的自动上传系统。
技术介绍
1、目前，数字病理切片文件一般包含利用全自动显微镜或光学放大系统扫描采集得到高分辨数字图像和全切片病理图像(whole slide image，wsi)。其中，全切片图像是通过计算机将高分辨数字图像进行高精度多视野无缝隙拼接和处理后获得的多层级可视化的图像。全切片病理图像是数字化病理学的基础，高质量病理图像为病理ai诊断、远程会诊、病理数据共享、教学等多方面提供了便利条件。现如今病理学已经进入数字化时代，自动化的病理图像文件上传系统的出现提高了切片上传管理的效率和准确性。
2、但是，对于全切片病理图像的大量数据上传和管理，现有技术方案中的自动化的病理图像文件上传系统仅可通过扫描装置扫描数字病理切片(例如公开号为cn107493403b，名称为“一种数字病理切片扫描系统”的专利)实现数字病理切片的自动上传和远程传输，这样的数字病理切片上传方式导致上传的切片图像信息较为单一，无法获得全切片图像的图像多层级信息。
3、因此，本专利技术提出了一种基于数字病理切片文件的自动上传系统。
技术实现思路
1、本专利技术提供一种基于数字病理切片文件的自动上传系统，用以克服
技术介绍
中提出的问题。
2、本专利技术提供一种基于数字病理切片文件的自动上传系统，包括：
3、自动接收模块，用于从自动上传接收端口接收医护人员输入的数字病理切片，并与已存储的数字病理切片分类汇总，获
4、同部位拼接模块，用于对患者的数字病理切片源进行同部位视野统一并拼接，获得至少一个部位的全切片图像，并基于全切片图像生成对应部位的层级拼接信息；
5、文件生成模块，用于将层级拼接信息和当前获得的患者同部位的所有数字病理切片进行分别存储，获得患者每个部位的最新待存储切片文件；
6、自动上传模块，用于当检测到患者的最新待存储切片文件被更新时，则将更新后的最新待存储切片文件自动上传至云端系统。
7、优选的，自动接收模块，包括：
8、自动接收子模块，用于从自动上传接收端口接收医护人员输入的数字病理切片；
9、分类汇总子模块，用于将输入的每张数字病理切片与在云端系统存储的属于同一患者的数字病理切片进行汇总，获得每个患者的数字病理切片源。
10、优选的，同部位拼接模块，包括：
11、部位划分子模块，用于对患者的数字病理切片源进行部位划分，获得至少一个部位的数字病理切片集；
12、切片拼接子模块，用于对数字病理切片集中的所有数字病理切片进行视野统一并拼接，获得至少一个部位的全切片图像，并基于全切片图像生成对应部位的层级拼接信息。
13、优选的，切片拼接子模块，包括：
14、参考视规模确定单元，用于将数字病理切片集中所有数字病理切片的像素规模的众数当作参考像素规模；
15、像素规模统一单元，用于基于参考像素规模对数字病理切片集中的所有数字病理切片进行像素规模统一，获得统一数字病理切片集以及每个数字病理切片的规模统一参数；
16、统一切片拼接单元，用于基于数字病理切片集中所有数字病理切片的视野获取参数，将统一数字病理切片集中的所有统一数字病理切片进行拼接，获得对应部位的全切片图像以及每个统一数字病理切片的拼接位置参数；
17、层级信息生成单元，用于基于数字病理切片集中每个数字病理切片的规模统一参数和每个统一数字病理切片的拼接位置参数以及全切片图像，生成对应部位的层级拼接信息。
18、优选的，统一切片拼接单元，包括：
19、粗定位子单元，用于基于数字病理切片集中所有数字病理切片的视野获取参数，对统一数字病理切片集中的所有统一数字病理切片进行粗定位，获得所有统一数字病理切片的粗略相对位置；
20、粗拼接子单元，用于基于统一数字病理切片集中所有统一数字病理切片的粗略相对位置和所有统一数字病理切片中包含的轮廓线，对统一数字病理切片集中的所有统一数字病理切片进行粗拼接，获得粗拼接切片；
21、高精度修复子单元，用于基于统一数字病理切片集以及每个数字病理切片的规模统一参数，对粗拼接切片进行高分辨率修复，获得全切片图像，并确定出每个统一数字病理切片的拼接位置参数。
22、优选的，高精度修复子单元基于统一数字病理切片集以及每个数字病理切片的规模统一参数，对粗拼接切片进行高分辨率修复，获得全切片图像，并确定出每个统一数字病理切片的拼接位置参数的方法，包括：
23、基于规模统一参数确定出数字病理切片集中每个数字病理切片的规模变换倍数，并结合数字病理切片的分辨率，确定出对应部位的粗拼接切片的标准像素规模；
24、基于标准像素规模识别出粗拼接切片的低分辨率区域，并对低分辨率区域进行高分辨率修复，获得全切片图像；
25、基于标准像素规模和全切片图像的像素参数，搭建出全切片图像的像素矩阵，并结合每个统一数字病理切片在全切片图像中的所在位置，确定出每个统一数字病理切片到全切片图像的像素矩阵变换式作为对应统一数字病理切片的拼接位置参数。
26、优选的，层级信息生成单元，包括：
27、第一搭建子单元，用于基于数字病理切片集中每个数字病理切片的规模统一参数，搭建出每个数字病理切片的统一子流程；
28、第二搭建子单元，用于基于每个统一数字病理切片的拼接位置参数，并将全切片图像当成流程输出结果，搭建出拼接子流程；
29、流程拼接子单元，用于将数字病理切片集中的所有数字病理切片的统一子流程和拼接子流程进行拼接，获得对应部位的拼接流程；
30、超链接绑定子单元，用于将拼接流程与全切片图像进行分区域超链接绑定，获得对应部位的层级拼接信息。
31、优选的，文件生成模块，包括：
32、检索目标确定子模块，用于确定当前全切片图像的目标患者和对应的目标部位；
33、第一文件生成子模块，用于当在云端系统中检索出目标患者的目标部位的切片文件时，则基于目标患者的目标部位在云端系统中存储的切片文件中的层级拼接信息对应的拼接流程和当前获得的患者同部位的所有数字病理切片，生成目标患者的目标部位的最新待存储切片文件；
34、第二文件生成子模块，用于当在云端系统中未检索出目标患者的目标部位的切片文件时，则将当前层级拼接信息和当前获得的患者同部位的所有数字病理切片进行分别存储，获得患者每个部位的最新待存储切片文件。
35、优选的，第一文件生成子模块，包括：
36、差异流程确定单元，用于当在云端系统中检索出目标患者的目标部位的切片文件时，则确定出目标患者的目标部位在云端系统中存储的切片文件中的层级拼接信息对应的拼接流程与当前层级拼接信息对应的拼接流程之间的差异流程；
37、第一文件生成单元，用于基于最新获得本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，自动接收模块，包括：
3.根据权利要求1所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，同部位拼接模块，包括：
4.根据权利要求3所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，切片拼接子模块，包括：
5.根据权利要求4所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，统一切片拼接单元，包括：
6.根据权利要求5所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，高精度修复子单元基于统一数字病理切片集以及每个数字病理切片的规模统一参数，对粗拼接切片进行高分辨率修复，获得全切片图像，并确定出每个统一数字病理切片的拼接位置参数的方法，包括：
7.根据权利要求4所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，层级信息生成单元，包括：
8.根据权利要求1所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，文件生成模块，包括：
9.根据
10.根据权利要求1所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，自动上传模块，包括：
...【技术特征摘要】
1.一种基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，自动接收模块，包括：
3.根据权利要求1所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，同部位拼接模块，包括：
4.根据权利要求3所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，切片拼接子模块，包括：
5.根据权利要求4所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，统一切片拼接单元，包括：
6.根据权利要求5所述的基于数字病理切片文件的自动上传系统，其特征在于，高精度修复子单元...
【专利技术属性】
技术研发人员：王书浩，李堃，
申请(专利权)人：北京透彻未来科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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