【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及西瓜中修饰(或突变型)基因的鉴定以及用于生成和/或选择包含该基因的修饰(或突变型)等位基因或该基因的野生型等位基因的植物和植物部分的方法。因为野生型基因被认为是拟南芥(arabidopsis thaliana)atdwarf14(atd14)基因的直向同源物，因此该基因被称为dwarf14或cldwarf14或cld14。在正常西瓜植物中，在8号染色体上发现野生型cld14基因，并且该基因编码267个氨基酸的cld14蛋白。在多分枝西瓜植物中发现该基因的修饰等位基因，该修饰等位基因含有8个氨基酸的重复，并且因此含有275个氨基酸的蛋白质，参见图1。针对cld14基因的这种修饰等位基因纯合的植物具有多分枝表型，其中二级枝的平均数量等于或高于45个二级枝。相反，针对修饰等位基因杂合或针对野生型等位基因纯合的西瓜植物具有正常的分枝表型，其中二级枝的平均数量显著低于45，诸如大约低于30个二级枝，例如平均大约20个二级枝。其他葫芦科(cucurbitaceae)，诸如甜瓜和黄瓜，也含有编码与西瓜cld14蛋白具有高序列同一性的d14蛋白的基因。这些被称为例如cmd14(甜瓜(cucumis melo))或csd14(黄瓜(cucumis sativus))基因和蛋白。西瓜、黄瓜和甜瓜的基因和蛋白质在本文中也可以仅称为d14基因、d14等位基因或d14蛋白。还令人惊讶地发现，包含8个氨基酸重复的突变型等位基因实际上编码非功能性cld14蛋白。这是出乎意料的，因为d14蛋白是复合蛋白质，该蛋白质与各种其他蛋白质相互作用，并且预期8个氨基酸重复不会完全
技术介绍
1、专利us7314979b2描述了称为hmbn等位基因的隐性等位基因，该等位基因以纯合形式增加二级分枝并将平均果实重量减少至0.87kg。
2、wo2006/060425也描述了称为hmbn等位基因的隐性等位基因。在第15页的[0090]，hmbn等位基因被描述为‘由西瓜培育项目产生的意想不到的突变型等位基因’。
3、专利申请us2020093086描述了由于纯合形式的hmbn等位基因和2号染本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种包含命名为ClD14(西瓜Dwarf14)的基因的突变型等位基因的西瓜植物，其中所述突变型等位基因包含在一个或多个调节序列中的突变，从而导致与相应的野生型等位基因相比减少的基因表达或无基因表达，或者其中所述突变型等位基因编码包含与由所述野生型等位基因编码的蛋白质相比一个或多个氨基酸的缺失、截短、插入或置换的蛋白质，从而导致ClD14蛋白的功能降低或功能丧失，其中当所述突变型等位基因呈纯合形式时，所述突变型等位基因导致所述植物发展增加的二级枝的平均数量，并且其中所述突变型等位基因不是编码SEQ ID NO:1的蛋白质的突变型等位基因，
2.根据权利要求1所述的西瓜植物，其中所述突变型等位基因编码其中插入、置换或缺失一个或多个氨基酸的蛋白质，从而导致所述蛋白质的功能降低，但不导致所述蛋白质的功能丧失，由此二级枝的平均数量高于针对所述野生型ClD14等位基因纯合的植物中的二级枝的平均数量，但不如针对编码非功能性蛋白质的突变型ClD14等位基因纯合的植物中的二级枝的平均数量高。
3.根据权利要求1或2所述的西瓜植物，其中所述植物针对所述突变型等位基因是纯合
4.一种种子，根据权利要求1至3中任一项所述的植物可以从所述种子生长。
5.一种用于检测以及任选地选择西瓜植物、种子或植物部分的方法，所述西瓜植物、种子或植物部分包含至少一个拷贝的命名为ClD14(西瓜Dwarf14)的基因的突变型等位基因，所述方法包括以下步骤：
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述ClD14等位基因特异性寡核苷酸引物或所述ClD14等位基因特异性寡核苷酸探针包含SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:6的互补链的至少10个核苷酸。
7.根据权利要求5或6所述的方法，其中所述突变型等位基因包含在所述等位基因的编码区中插入或重复的至少一个密码子，或者改变为另一个密码子的至少一个密码子，或者缺失或改变为终止密码子的至少一个密码子。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述突变型等位基因包含SEQ ID NO:5的序列。
9.根据权利要求5至8中任一项所述的方法，其中所述寡核苷酸引物或寡核苷酸探针包含与SEQ ID NO:6或与SEQ ID NO:6的互补序列互补的至少15个核苷酸。
10.根据权利要求5至9中任一项所述的方法，其中所述基因分型测定是KASP测定，所述KASP测定包括检测所述DNA样品中SEQ ID NO:6的野生型等位基因的第一正向引物，检测所述DNA样品中包含相对于SEQ ID NO:6插入、缺失或置换的一个或多个核苷酸的所述突变型等位基因的第二正向引物，以及一个共同的反向引物。
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种包含命名为cld14(西瓜dwarf14)的基因的突变型等位基因的西瓜植物，其中所述突变型等位基因包含在一个或多个调节序列中的突变，从而导致与相应的野生型等位基因相比减少的基因表达或无基因表达，或者其中所述突变型等位基因编码包含与由所述野生型等位基因编码的蛋白质相比一个或多个氨基酸的缺失、截短、插入或置换的蛋白质，从而导致cld14蛋白的功能降低或功能丧失，其中当所述突变型等位基因呈纯合形式时，所述突变型等位基因导致所述植物发展增加的二级枝的平均数量，并且其中所述突变型等位基因不是编码seq id no:1的蛋白质的突变型等位基因，
2.根据权利要求1所述的西瓜植物，其中所述突变型等位基因编码其中插入、置换或缺失一个或多个氨基酸的蛋白质，从而导致所述蛋白质的功能降低，但不导致所述蛋白质的功能丧失，由此二级枝的平均数量高于针对所述野生型cld14等位基因纯合的植物中的二级枝的平均数量，但不如针对编码非功能性蛋白质的突变型cld14等位基因纯合的植物中的二级枝的平均数量高。
3.根据权利要求1或2所述的西瓜植物，其中所述植物针对所述突变型等位基因是纯合的，并且发展与针对所述野生型等位基因纯合的所述植物相比增加的二级枝的平均数量。
4.一种种子，根据权利要求1至3中任一项所述的植物可以从所述种子生长。
5.一种用于检测以及任选地选择西...
【专利技术属性】
技术研发人员：J·阿卢瓦达，M·马扎赫里，E·基亚帕里诺，
申请(专利权)人：纽海姆有限公司，
类型：发明
国别省市：
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