一种应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法技术

本发明专利技术公开了一种应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，包括：称取植物组织样品剪碎后装入已灭菌的离心管，液氮研磨；研磨好的样品用RIPA缓冲液破裂细胞核，以便释放染色质；通过微球菌核酸酶将染色质片段化；染色质片段化产物中加入Protein A/G磁珠，并加入期望的DNA结合蛋白的抗体，进行孵育，以便获得免疫共沉淀处理产物；免疫共沉淀处理产物用磁力架去除上清，用高盐洗涤缓冲液洗涤磁珠2次后用MNase缓冲液重悬，加入SDS和蛋白酶K，解交联，以便使染色质和蛋白质分离获得解交联产物；解交联产物用VAHTS DNA Clean Beads磁珠纯化，以便富集DNA；文库构建与上机测序。本发明专利技术方法起始材料消耗量少，操作简单，选择性、准确性、分辨率高。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，具体涉及一种应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀的方法。

技术介绍

1、表观遗传学目前被定义为研究有丝分裂和/或减数分裂可遗传的基因功能变化，并且独立于dna序列的变化而发生。其旨在研究生物体中不依赖于dna序列的影响基因表达水平的可遗传的变化，例如：dna甲基化、组蛋白修饰、组蛋白变体以及染色质重构等。因此，负责这些遗传变化的细胞活动被称为表观遗传机制。表观遗传是真核生物中保守的遗传调控机制。不同表观遗传修饰由特异的酶或者蛋白复合体介导催化、识别与去除，因此表观遗传修饰具有动态可逆调节等特征。而高通量测序平台是一种用于快速测定dna或rna序列的技术，它已经在基因组学、转录组学和表观基因组学研究中得到广泛应用。为了在这些研究中分析某些植物样本的基因组结构和功能，有时需要对植物细胞中的染色质进行特定蛋白质的免疫共沉淀。

2、染色质免疫沉淀测序(chip-seq是一种有效的方法，可以在任何生物体的整个核基因组中捕获转录因子的dna靶标或组蛋白修饰。这种技术可以用于捕获与染色质相关的蛋白质以及其与染色质上特本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，其特征在于：包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，其特征在于：所述RIPA缓冲液配方为：10 mM pH8.0 Tris-HCl，140 mM KCl，1 mM EDTA，1% TritonX-100，0.1%十二烷基硫酸钠，0.1%脱氧胆酸钠，0.1%二硫苏糖醇，1 mM苯甲基磺酰氟，1%蛋白酶抑制剂。

3.根据权利要求1所述的应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，其特征在于：所述高盐洗涤缓冲液配方为：140 mM KCl，5 m...

【技术特征摘要】

1.一种应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，其特征在于：包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，其特征在于：所述ripa缓冲液配方为：10 mm ph8.0 tris-hcl，140 mm kcl，1 mm edta，1% tritonx-100，0.1%十二烷基硫酸钠，0.1%脱氧胆酸钠，0.1%二硫苏糖醇，1 mm苯甲基磺酰氟，1%蛋白酶抑制剂。

3.根据权利要求1所述的应用于少量植物样本的高分辨率快速染色质免疫共沉淀方法，其特征在于：所述高盐洗涤缓冲液配方为：140 mm kcl，5 mm nacl，...

【专利技术属性】
技术研发人员：朱方捷，罗琳，肖嘉靖，毛飞，温成金，
申请(专利权)人：福建农林大学，
类型：发明
国别省市：