【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及医疗诊断技术，具体来说，涉及外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法。
技术介绍
1、肺腺癌依然是人类健康的一大威胁，早诊断早治疗依然是控制和预防肿瘤的有效手段。液体活检（liquid biopsy）作为体外诊断的一个分支，是通过取样脑脊液、唾液、胸水、血液、腹水、尿液等体液对疾病进行诊断的技术。相比于组织活检，液体活检主要有无侵入性、可实现早期诊断、可动态监测等优势。液体活检可应用于疾病早期筛查、诊断分型、药物伴随检测、患者病情监测，发展潜力巨大。传统的肿瘤液体活检主要分为循环肿瘤细胞和循环肿瘤核酸，然而二者均存在检出率低、特异性低以及个体差异大等缺陷。
2、近些年，外泌体携带的分子标志物逐渐成为肿瘤液体活检的主要内容之一。外泌体circrna作为新的遗传信息分子，促进肿瘤细胞和微环境细胞（如免疫细胞、成纤维细胞等）之间的交流，从而调节癌症进展的关键方面，包括免疫逃逸、肿瘤血管生成、耐药性、增殖和转移。
3、鉴于circrna在外泌体中具有内在稳定性、高表达丰度和分布广泛性的特征，外泌体circrna可以在液体活检中作为优秀的诊断和预后生物标志物。然而，目前尚未有公认的外周血来源的外泌体circrnas用于诊断肿瘤。
4、针对相关技术中的问题，目前尚未提出有效的解决方案。
技术实现思路
1、针对相关技术中的问题，本专利技术提出外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，以克服现有相关技术所存在的上述技术问题。p>
2、为此，本专利技术采用的具体技术方案如下：
3、外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，该方法包括：
4、s1、收集早期肺腺癌患者与健康志愿者的血清外泌体，并在外泌体circrna转录组测序后，随机划分为训练队列与验证队列；
5、s2、基于支持向量机递归特征消除、套索-逻辑回归以及受试者操作特征曲线，从训练队列中筛选早期肺腺癌的分子标签；
6、s3、基于分子标签的表达矩阵，建立评分体系，评估早期肺腺癌的诊断效率，并展示训练队列中样本的风险分布；
7、s4、基于曲线下面积模型及决策曲线，在验证队列中，论证分子标签的诊断效率，并展示验证队列的风险分布。
8、进一步的，在外泌体circrna转录组测序后，随机划分为训练队列与验证队列包括：
9、s11、设定差异分析标准，执行外泌体circrna转录组测序，筛选满足标准的差异circrnas，其中，差异circrnas的数量为64；
10、s12、将早期肺腺癌患者的与健康志愿者的差异circrnas分别随机划分为训练与验证队列，且训练队列与验证队列的比例是1：1。
11、进一步的，差异分析标准的表达式为：
12、；
13、式中， log2fc表示基因在两个条件之间的表达水平的对数折叠变化； pvalue表示差异分析的统计显著性水平；&表示逻辑运算中的与。
14、进一步的，基于支持向量机递归特征消除、套索-逻辑回归以及受试者操作特征曲线，从训练队列中筛选早期肺腺癌的分子标签包括：
15、s21、基于支持向量机递归特征消除，评估差异circrnas的特征的重要性，从差异circrnas中筛选出错误率最小且准确性最高的第一特征性circrnas；
16、s22、基于套索-逻辑回归，利用惩罚系数选择分类错误的最小目标参量，从差异circrnas中筛选出第二特征性circrnas；
17、s23、基于受试者操作特征曲线建立曲线下面积模型，并设定曲线下面积阈值，从差异circrnas中筛选出符合曲线下面积阈值要求的第三特征性circrnas；
18、s24、利用韦恩图选取三者的交集标签，作为有效的分子标签并展示。
19、进一步的，第一特征性circrnas的数量为32，第二特征性circrnas的数量为22，第三特征性circrnas的数量为21。
20、进一步的，曲线下面积模型表示受试者操作特征曲线下的面积，曲线下面积阈值为0.7。
21、进一步的，利用韦恩图选取三者的交集标签，作为有效的分子标签并展示包括：
22、s241、利用第一特征性circrnas、第二特征性circrnas及第三特征性circrnas绘制韦恩图；
23、s242、在韦恩图中选取三者的交集标签circrnas，作为有效的分子标签，且分子标签的数量为7；
24、s243、绘制火山图与小提琴图展示分子标签在早起肺腺癌患者与健康志愿者之间的表达差异。
25、进一步的，基于分子标签的表达矩阵，建立评分体系，评估早期肺腺癌的诊断效率，并展示训练队列中样本的风险分布包括：
26、s31、提取分子标签的表达矩阵，并通过曲线拟合，构建评分体系；
27、s32、通过评分体系输出评分结果的灵敏度与特异度，计算生成最大约登指数，并根据最大约登指数映射至最佳临界值；
28、s33、利用曲线下面积模型比较分子标签中单个circrna曲线下面积与全部circrnas曲线下面积，拟论证最佳诊断正确性的分子标签；
29、s34、利用决策曲线比较分子标签中部分circrna的净收益与全部circrnas的净收益，拟论证最优净收益的分子标签；
30、s35、将训练队列中的样本按照评分结果由低至高排序，再按照最佳临界值划分为低风险与高风险两组，并绘制风险热图，展示训练队列的风险分布。
31、进一步的，约登指数的计算表达式为：
32、；
33、式中， j表示约登指数； a表示敏感度； b表示特异度。
34、进一步的，基于曲线下面积模型及决策曲线，在验证队列中，论证分子标签的诊断效率，并展示验证队列的风险分布包括：
35、s41、从验证队列中筛选早期肺腺癌的分子标签；
36、s42、利用曲线下面积模型比较分子标签中单个circrna曲线下面积与全部circrnas曲线下面积，拟论证最佳诊断正确性的分子标签；
37、s43、利用决策曲线比较分子标签中部分circrna的净收益与全部circrnas的净收益，拟论证最优净收益的分子标签；
38、s44、将验证队列中的样本按照评分结果由低至高排序，再按照最佳临界值划分为低风险与高风险两组，并绘制风险热图，展示验证队列的风险分布。
39、本专利技术的有益效果为：通过对早期肺腺癌患者和健康志愿者外泌体进行cirrna转录组测序，采用svm-rfe、lasso-logistic和roc三种模型在训练本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，该方法包括：
2.根据权利要求1所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述在外泌体circRNA转录组测序后，随机划分为训练队列与验证队列包括：
3.根据权利要求2所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述差异分析标准的表达式为：
4.根据权利要求2所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述基于支持向量机递归特征消除、套索-逻辑回归以及受试者操作特征曲线，从所述训练队列中筛选早期肺腺癌的分子标签包括：
5.根据权利要求4所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述第一特征性circRNAs的数量为32，所述第二特征性circRNAs的数量为22，所述第三特征性circRNAs的数量为21。
6.根据权利要求4所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述曲线下面积模型表示受试者操作特征曲线下的面积，所述
7.根据权利要求4所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述利用韦恩图选取三者的交集标签，作为有效的分子标签并展示包括：
8.根据权利要求2所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述基于所述分子标签的表达矩阵，建立评分体系，评估早期肺腺癌的诊断效率，并展示所述训练队列中样本的风险分布包括：
9.根据权利要求8所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述约登指数的计算表达式为：
10.根据权利要求2所述的外泌体circRNAs诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述基于曲线下面积模型及决策曲线，在所述验证队列中，论证所述分子标签的诊断效率，并展示所述验证队列的风险分布包括：
...【技术特征摘要】
1.外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，该方法包括：
2.根据权利要求1所述的外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述在外泌体circrna转录组测序后，随机划分为训练队列与验证队列包括：
3.根据权利要求2所述的外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述差异分析标准的表达式为：
4.根据权利要求2所述的外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述基于支持向量机递归特征消除、套索-逻辑回归以及受试者操作特征曲线，从所述训练队列中筛选早期肺腺癌的分子标签包括：
5.根据权利要求4所述的外泌体circrnas诊断早期肺腺癌的效率评估方法，其特征在于，所述第一特征性circrnas的数量为32，所述第二特征性circrnas的数量为22，所述第三特征性circrnas的数量为21。
6.根据权利要求4所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：张海健，韩毅，曹小庆，朱广，刘长冬，许乃宁，
申请(专利权)人：南通大学附属医院，
类型：发明
国别省市：
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