【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物遗传学，公开了与先天性扩心病发生风险相关的一个新的突变位点及其检测方法，该位点位于dmd基因，发生的突变为c.31+1g>t,rs398123923。
技术介绍
1、先天性扩心病是一种罕见的心脏疾病，婴儿出生时就患有。它导致心脏的左心室和/或右心室扩大，使心脏无法有效泵血，最终可能导致患者因心力衰竭而死亡。通过使用高通量测序技术，研究人员已经鉴定出与先天性扩心病相关的多个基因，然而，仍有许多先天性扩心病患者无法明确致病基因，新的致病基因有待被发现。为此，需要优化现有基因检测方法，提供新的与先天性扩心病发病风险相关的基因和突变位点。
技术实现思路
1、针对现有问题的不足，本专利技术的目的是提供一种先天性扩心病风险相关dmd基因突变位点。
2、本专利技术解决其技术问题采用的技术方案是：
3、第一方面，本专利技术提供一个先天性扩心病风险相关dmd基因突变位点(c.31+1g>t,rs398123923)。
4、具体地，本专利技术通过对先天性扩心病患者及其家系成员进行分析，结果发现，该突变位点位于dmd基因肌肉特异性转录本亚型的第一外显子和第一内含子的接头处。其基因型在不同物种中具有高度的保守性。该位点位于第一内含子的供体序列上，rna splicerai模型预测结果提示该位点引起dmd基因肌肉亚型转录本的剪切位点后移，导致移码突变，使得m亚型dstrophin蛋白的表达完全缺失。即如果sanger测序结果显示rs39812
5、具体地，所述dmd基因的核苷酸序列如seq id no：1所示；所述dmd基因编码的蛋白如seq id no：2所示。
6、第二方面，本专利技术保护检测dmd基因突变位点的物质在制备筛查或辅助筛查先天性扩心病的产品中的应用。
7、第三方面，本专利技术保护检测dmd基因突变位点的物质在制备诊断或辅助诊断先天性扩心病的产品中的应用。
8、第四方面，本专利技术保护检测dmd基因突变位点的物质在制备预测先天性扩心病患病风险的产品中的应用。
9、在具体的实施方案中，所述突变位点为c.31+1g>t,rs398123923。
10、优选的，如果sanger测序结果显示rs398123923位点检测到等位基因g则为野生型，如果检测到等位基因t则为突变型。
11、在具体的实施方案中，所述产品包括系统，所述系统包括试剂和/或仪器，所述试剂包括芯片、试剂或试剂盒。
12、在具体的实施方案中，所述物质包括检测dmd基因或基因片段的引物。
13、优选的，所述引物如下：
14、前引物：5’-taattagtgagcttgtcacaaacta-3’；
15、后引物：5’-tggagcaataaagtttgaagaactt-3’。
16、第五方面，本专利技术保护一种检测先天性扩心病的产品，所述产品包括如下任一种：
17、(b1)检测编码dmd突变位点的基因或基因片段的引物；
18、(b2)含有(b1)引物的检测试剂；
19、(b3)含有(b1)引物或(b2)检测试剂的试剂盒。
20、在具体的实施方案中，所述引物如下：
21、前引物：5’-taattagtgagcttgtcacaaacta-3’；
22、后引物：5’-tggagcaataaagtttgaagaactt-3’。
23、第六方面，本专利技术提供一种检测先天性扩心病的方法，包括如下步骤：
24、(1)收集被检者血液、组织等，提取基因组dna。
25、(2)配制pcr体系，并进行扩增。
26、pcr引物如下：5’-taattagtgagcttgtcacaaacta-3’(前引物)，5’-tggagcaataaagtttgaagaactt-3’(后引物)。
27、pcr反应程序设定如下：95℃预变性5min；95℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸20s，共35循环。72℃终延伸5min。
28、(3)sanger测序。
29、将步骤(2)中得到的pcr产物进行sanger测序，对突变位点进行基因分型。
30、结果分析：如果sanger测序结果显示rs398123923位点检测到等位基因g则为野生型，如果检测到等位基因t则为突变型，提示被检者可能具有先天性扩心病的发病风险。
31、有益效果
32、本专利技术有益效果如下：
33、本专利技术提供的突变基因dmd新位点(c.31+1g>t,rs398123923)可以作为临床辅助诊断的生物标志物，对携带者进行风险评估，对先天性扩心病的早期诊断，筛查、辅助筛查或者辅助临床判断具有重要意义。基于突变基因dmd新位点(c.31+1g>t,rs398123923)的试剂开发的检测试剂盒，能够将携带c.31+1g>t突变的患者和正常人群区分开，可以为受试者提供优生优育指导和遗传咨询。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.检测DMD基因突变位点的物质在制备筛查或辅助筛查先天性扩心病的产品中的应用。
2.检测DMD基因突变位点的物质在制备诊断或辅助诊断先天性扩心病的产品中的应用。
3.检测DMD基因突变位点的物质在制备预测先天性扩心病患病风险的产品中的应用。
4.根据权利要求1-3任一所述的应用，所述突变为c.31+1G>T,rs398123923。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，如果Sanger测序结果显示rs398123923位点检测到等位基因G则为野生型，如果检测到等位基因T则为突变型。
6.根据权利要求1-3任一所述的应用，其特征在于，所述产品包括系统，所述系统包括试剂和/或仪器，所述试剂包括芯片、试剂或试剂盒。
7.根据权利要求1-3任一所述的应用，其特征在于，所述物质含有检测DMD基因或基因片段的引物。
8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述引物如下：
9.一种检测先天性扩心病的产品，其特征在于，包括如下任一种：
10.根据权利要求9所述的产品，其特征
...【技术特征摘要】
1.检测dmd基因突变位点的物质在制备筛查或辅助筛查先天性扩心病的产品中的应用。
2.检测dmd基因突变位点的物质在制备诊断或辅助诊断先天性扩心病的产品中的应用。
3.检测dmd基因突变位点的物质在制备预测先天性扩心病患病风险的产品中的应用。
4.根据权利要求1-3任一所述的应用，所述突变为c.31+1g>t,rs398123923。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，如果sanger测序结果显示rs398123923位点检测到等位基因g则为...
【专利技术属性】
技术研发人员：范佳豪，王冰玉，王蕾乐，王寒蒙，施华文，葛玉礼，盛明晨，李开，陈鹏，陈峰，
申请(专利权)人：南京医科大学，
类型：发明
国别省市：
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