System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种人体肠道菌群检测方法以及装置制造方法及图纸_技高网

一种人体肠道菌群检测方法以及装置制造方法及图纸

技术编号:40504084 阅读:7 留言:0更新日期:2024-03-01 13:17
本发明专利技术公开了一种人体肠道菌群检测方法以及装置,所述方法包括以下步骤:从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息;利用基因提取设备提取所述人体粪菌检测样品中肠道微生物的基因组DNA信息;基于所述图像特征信息以及所述基因组DNA信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量,本申请实施例中通过图像特征信息以及基因组DNA信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量,可以更准确地对人体肠道内的微生物种类以及含量进行分析。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及菌群检测领域,具体涉及一种人体肠道菌群检测方法以及装置


技术介绍

1、目前,肠道微生物指动物肠道中存在的数量庞大的微生物,这群微生物依靠动物的肠道生活,同时帮助寄主完成多种生理生化功能。肠道不仅是人体消化吸收的重要场所,同时也是最大的免疫器官,在维持正常免疫防御功能中发挥着极其重要的作用。

2、人体肠道为微生物提供了良好的栖息环境,具有人体自身不具备的代谢功能。作为人体最庞大、最复杂的微生态系统,肠道微生物本身及其代谢产物不仅能调节人体健康,更在膳食和宿主之间起到了重要的桥梁作用。正如诺贝尔奖获得者joshua lederberg曾指出的,人体与人体共生微生物构成了超级生物体(superorganism)。

3、然而,现有非诊断目的的肠道微生物定性定量的检测方法dna提取效率普遍偏低,且稳定性差;同时,对肠道微生物信息分析不直观,工作量大。


技术实现思路

1、本专利技术的目的就在于为了解决上述问题而提供一种人体肠道菌群检测方法以及装置,详见下文阐述。

2、为实现上述目的,本专利技术提供了以下技术方案:

3、本专利技术提供的一种人体肠道菌群检测方法,所述方法包括以下步骤:从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息;利用基因提取设备提取所述人体粪菌检测样品中肠道微生物的基因组dna信息;基于所述图像特征信息以及所述基因组dna信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量,本申请实施例中通过图像特征信息以及基因组dna信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量,可以更准确地对人体肠道内的微生物种类以及含量进行分析。

4、作为优选,所述利用基因提取设备提取所述人体粪菌检测样品中肠道微生物的基因组dna信息,之前包括以下步骤:通过扩增模块利pcr扩增技术对肠道微生物进行扩展处理,获取拓展处理后的肠道微生物;利用基因提取设备提取所述拓展处理后的肠道微生物的拓展dna信息。

5、作为优选,所述从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息,包括以下步骤:将所述微观图像通过不同分块法进行均分,获取同一分块法下多个大小相同的子图像;对每一所述子图像分别进行空间结构处理,获取每一所述子图像的梯度值和像素均值;基于所述梯度值以及所述像素均值,获取所述微观图像在同一分块的二进制序列。

6、作为优选,所述从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息,还包括以下步骤:基于所述不同分块法下的二进制序列,获取在各个不同分块法下的选取特征信息;利用遗传算法提取各个所述选取特征信息中的最优个体;基于所述最优个体,获取所述微观图像中的图像特征信息。

7、作为优选,所述基于所述图像特征信息以及所述基因组dna信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量,包括以下步骤:对测序完成后的基因组dna信息进行拆分和过滤,得到过滤后的肠道微生物样本序列;对过滤后的样本序列进行聚类比对和物种注释分类;对物种注释分类的结果进行谱分析。

8、作为优选,所述所述谱分析包括alpha多样性分析、beta多样性分析以及益生菌含量和病原菌含量分析。

9、作为优选,所述方法还包括:根据菌群功能及疾病关联数据库对谱分析的结果进行自动解读,并生成分析报告;将自动解读的结果和谱分析的结果自动提交给可视化平台进行可视化展示和审核。

10、本专利技术第二方面提供了一种人体肠道菌群检测装置,所述装置包括:特征提取将模块,其用于从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息;dna信息提取模块,其用于利用基因提取设备提取所述人体粪菌检测样品中肠道微生物的基因组dna信息;微生物解析模块,其用于基于所述图像特征信息以及所述基因组dna信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量。

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【技术保护点】

1.一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述利用基因提取设备提取所述人体粪菌检测样品中肠道微生物的基因组DNA信息,之前包括以下步骤:

3.根据权利要求2所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息,包括以下步骤:

4.根据权利要求2所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息,还包括以下步骤:

5.根据权利要求1所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述基于所述图像特征信息以及所述基因组DNA信息,获取人体肠道中微生物种类以及各种类的微生物含量,包括以下步骤:

6.根据权利要求5所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述谱分析包括alpha多样性分析、beta多样性分析以及益生菌含量和病原菌含量分析。

7.根据权利要求1所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述方法还包括:

8.一种人体肠道菌群检测装置,其特征在于,所述装置包括:

9.一种终端设备,包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至7任一项所述的方法。

10.一种计算机可读存储介质,所述计算机可读存储介质存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述的方法。

...

【技术特征摘要】

1.一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述利用基因提取设备提取所述人体粪菌检测样品中肠道微生物的基因组dna信息,之前包括以下步骤:

3.根据权利要求2所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息,包括以下步骤:

4.根据权利要求2所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述从人体粪菌检测样品中采集肠道微生物的微观图像,并提取所述微观图像中的图像特征信息,还包括以下步骤:

5.根据权利要求1所述一种人体肠道菌群检测方法,其特征在于,所述基于所述图像特征信息以及所述基因组dna信息,获取人体肠道中...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈辉彭灿辉黄穰浪
申请(专利权)人:中南大学湘雅三医院
类型:发明
国别省市:

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