【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，特别是涉及用于鉴定籽鹅品种的snp位点组合及鉴定方法。
技术介绍
1、籽鹅是黑龙江省地方品种，属小型鹅种，具有肉质好，抗寒、耐粗饲、生活力强，性成熟早、产蛋多等特点，其开发利用前景较大。目前市场上有较多的假冒籽鹅以及籽鹅与其他品种的杂交个体冒充销售，对籽鹅纯种个体市场造成了一定的冲击，严重影响了籽鹅品牌。因此提供一种能有效准确鉴定籽鹅品种的产品及方法是十分必要的。
2、目前市场上鉴别籽鹅的方法主要依靠外观观察。这种观察主观性较强，鉴定错误率较高，尤其在鉴定籽鹅与其他品种鹅杂种后代时，容易导致不正确的分类与鉴定。而且地方品种鹅刚出雏时较为相似，鉴定错误率也较高。
3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性，具有位点丰富、分布广泛、遗传稳定性高、具有代表性和检测便捷快速等特点。snp分子标记辅助鉴定，是利用个体基因组dna中特有的品种差异性较大的snp位点，通过不同位点组合的基因型进行品种鉴定，鉴定结果更加客观准确。鉴于此，科研和实践中均亟需开发一种能有效准确鉴定籽鹅品种的产品及方法，应用于籽鹅品种鉴定工作。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种用于鉴定籽鹅品种的snp位点组合及鉴定方法，以解决上述现有技术存在的问题。根据贝叶斯定理，可以通过本专利技术提供的snp位点组合联合基因型判断待测鹅个体属于籽鹅的概率，方法操作简便，
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供一种用于鉴定籽鹅品种的snp位点组合，包括下表所示的snp位点：
4、
5、
6、进一步地，当所述snp位点为ze1p时，该位点的基因型包括tt、tc和cc；
7、当所述snp位点为ze2p时，该位点的基因型包括cc、cg和gg；
8、当所述snp位点为ze3p时，该位点的基因型包括aa、ag和gg；
9、当所述snp位点为ze4p时，该位点的基因型包括gg、gc和cc；
10、当所述snp位点为ze5p时，该位点的基因型包括cc、ct和tt；
11、当所述snp位点为ze6p时，该位点的基因型包括tt、tc和cc；
12、当所述snp位点为ze7p时，该位点的基因型包括aa、ag和gg；
13、当所述snp位点为ze8p时，该位点的基因型包括cc、cg和gg；
14、当所述snp位点为ze9p时，该位点的基因型包括tt、tg和gg；
15、当所述snp位点为ze10p时，该位点的基因型包括tt、tc和cc；
16、当所述snp位点为ze11p时，该位点的基因型包括cc、ct和tt；
17、当所述snp位点为ze12p时，该位点的基因型包括aa、ag和gg；
18、当所述snp位点为ze13p时，该位点的基因型包括tt、tg和gg；
19、当所述snp位点为ze14p时，该位点的基因型包括tt、tc和cc；
20、当所述snp位点为ze15p时，该位点的基因型包括tt、tc和cc。
21、本专利技术还提供一种鉴定籽鹅品种的引物对组合，所述引物对组合包括如下表所示的引物对：
22、
23、
24、本专利技术还提供所述的引物对组合在制备籽鹅品种鉴定试剂盒中的应用。
25、本专利技术还提供一种籽鹅品种鉴定的试剂盒，包括所述的引物对组合。
26、本专利技术还提供所述的snp位点组合、所述的引物对组合或所述的试剂盒在鉴定籽鹅品种中的应用。
27、本专利技术还提供一种鉴定籽鹅品种的方法，包括以下步骤：
28、以待测鹅个体基因组dna为模板，利用上述引物对组合中各snp位点的引物对分别进行pcr扩增，获得扩增产物；
29、对所述扩增产物进行测序，判断出所述snp位点组合中各snp位点的基因型；
30、根据各snp位点对应基因型的频率，由贝叶斯定理计算待测鹅个体属于籽鹅的概率和属于非籽鹅的概率；
31、进一步地，所述待测鹅个体属于籽鹅概率的计算公式为：
32、
33、该所述待测鹅个体属于非籽鹅概率的计算公式为：
34、其中，pi表示snp位点组合中第i个snp中籽鹅品种对应基因型的频率，qi表示snp位点组合中第i个snp中其他品种对应基因型的频率；
35、所述pi和qi的值根据下表得出：
36、
37、
38、根据计算结果，为保证准确率，以0.95为阈值，属于籽鹅的概率大于等于0.95则判定为籽鹅；属于非籽鹅的概率大于等于0.95则判定为非籽鹅；如果小于0.95，则只能判定为一种可能性，比如属于籽鹅的概率为0.85，则认为只有85％的可能性属于籽鹅。
39、进一步地，所述pcr扩增的反应程序为：94℃1min；94℃30s、55℃30s、72℃30s，共35个循环；72℃5min。
40、进一步地，所述pcr扩增的反应体系为：dna模板2μl，10ng/μl正反向引物各1.5μl，2×pcr试剂10μl，超纯水补至20μl。
41、本专利技术公开了以下技术效果：
42、本专利技术提供了15个与籽鹅品种鉴定相关的特异性snp位点，通过检测这15个snp位点的联合基因型，结合各snp位点对应基因型的频率，可以通过贝叶斯定理计算待测个体为籽鹅的概率，以此鉴定籽鹅品种。这种鉴定方法操作简便，准确性高，可以有效打击市场假冒籽鹅的泛滥程度。
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1.一种用于鉴定籽鹅品种的SNP位点组合，其特征在于，包括下表所示的SNP位点：
2.根据权利要求1所述的SNP位点组合，其特征在于，当所述SNP位点为ZE1P时，该位点的基因型包括TT、TC和CC；
3.一种鉴定籽鹅品种的引物对组合，其特征在于，所述引物对组合包括如下表所示的引物对：
4.如权利要求3所述的引物对组合在制备籽鹅品种鉴定试剂盒中的应用。
5.一种籽鹅品种鉴定的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物对组合。
6.如权利要求1或2所述的SNP位点组合、权利要求3所述的引物对组合或权利要求5所述的试剂盒在鉴定籽鹅品种中的应用。
7.一种鉴定籽鹅品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：
8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述待测鹅个体属于籽鹅概率的计算公式为：
9.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序为：94℃1min；94℃30s、55℃30s、72℃30s，共35个循环；72℃5min。
10.根据权利要求7所述的方法，其特
...【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定籽鹅品种的snp位点组合，其特征在于，包括下表所示的snp位点：
2.根据权利要求1所述的snp位点组合，其特征在于，当所述snp位点为ze1p时，该位点的基因型包括tt、tc和cc；
3.一种鉴定籽鹅品种的引物对组合，其特征在于，所述引物对组合包括如下表所示的引物对：
4.如权利要求3所述的引物对组合在制备籽鹅品种鉴定试剂盒中的应用。
5.一种籽鹅品种鉴定的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物对组合。
6.如权利要求1或2所述的snp位点组合、权利要求3所述的引物对组合或权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘宏祥，宋卫涛，李慧芳，章双杰，朱春红，陶志云，王志成，徐文娟，
申请(专利权)人：江苏省家禽科学研究所，
类型：发明
国别省市：
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