System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种与花椰菜种子结实率性状连锁的KASP标记引物组及其应用制造技术_技高网

一种与花椰菜种子结实率性状连锁的KASP标记引物组及其应用制造技术

技术编号:40486367 阅读:8 留言:0更新日期:2024-02-26 19:18
本发明专利技术公开了一种与花椰菜种子结实率性状连锁的KASP标记引物组及其应用,该引物组包含:正向引物FAM、正向引物HEX和反向引物;其中,所述正向引物FAM的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述正向引物HEX的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明专利技术在C6染色体上定位到了主效QTL,且这两个QTL的物理位置有重叠,表明该共定位的QTL在不同遗传背景下对花椰菜种子的结实率起到稳定的调控作用。基于此,本发明专利技术开发了与花椰菜种子结实率紧密相关的KASP标记SIK256,用于快速、准确地筛选种子结实率表型,选择基因分型结果良好。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种,具体涉及一种与花椰菜种子结实率性状连锁的kasp标记引物组及其应用。


技术介绍

1、花椰菜(brassica oleracea.var.botrytis)是十字花科芸薹属甘蓝种中以花球为产品器官的一个变种,因其含有丰富的维生素c,矿物质及芥子油苷等营养物质,深受广大消费者的喜爱,是我国重要的蔬菜种类。近年来,我国花椰菜新品种选育科研机构联合种业公司,育成了一大批优秀的花椰菜品种,但是部分优势品种的制繁种产量严重不足,阻碍了其进一步示范和推广,已经成为影响我国花椰菜产业发展的瓶颈问题。

2、种子结实率是影响作物种子制繁种产量的关键因子。近年来,在模式作物水稻上,有关种子结实率的分子生物学研究取得重要进展,鉴定到了一批控制水稻穗结实率的关键基因,包括pollen tubeblocked 1(ptb1),oscngc13,lowseed settingrate1(lssr1)等(liet al.,2013;xu et al.,2017;xiang et al.,2019)。在芸薹属作物中,“自交不亲和”特性被认为是影响种子结实率的重要因素(takasaki et al.,2000)。众多研究结果表明,花椰菜等芸薹属作物属于典型的孢子体自交不亲和类型,在遗传上由1个具有多个复等位基因的s位点控制,又称s单元型(nasrallah andnasrallah,1993)。只有父本的雄性决定因子(scr,丝氨酸/苏氨酸受体激酶)和母本的雌性决定因子(srk,富含半胱氨酸的蛋白)分属不同的s单元型,落在柱头上的花粉才能萌发生长,完成受精产生种子(fujimoto et al.,2006)。除了s位点之外,还有许多其它基因参与自交不亲和反应,包括arc1(臂展重复蛋白)(indriolo et al.,2012,2014)、exo70a1(胞吐复合物)(samuel et al.,2009)等。我们前期研究发现,国内主要青花菜(花椰菜近似种)品种及育种材料中共包含19个s单元型,而有些育种亲本即使含有不同的s单元型,也表现出结实率很低的现象,暗示这一性状可能还受其它未知遗传位点和调控网络的控制。

3、因此,探究花椰菜中与种子结实率相关的基因位点,并开发与该位点紧密连锁的分子标记,可以高效、精准地鉴定花椰菜的种子结实率,提高花椰菜种子产量,为保障我国花椰菜品种的国际化优势地位提供重要的技术支撑。

4、参考文献:

5、1.li sc,li wenbo.,huang b.,cao xm,zhou xy,ye sm,li cb,gao fy.,zou t,xie kl,ren yun.,ai p,tang yf,li xm,deng qm,wang sq,zheng ap,zhu j,liu hn,wanglx,li p.2013.natural variation in ptb1 regulates rice seed setting rate bycontrolling pollen tube growth.nat commun,4,2793.doi:10.1038/ncomms3793。

6、2.xuy,yang j,wangyh,wang jc,yuy,longy,wangyl,zhang h,renyl,chen j,wang y,zhang x,guo xp,wu fq,zhu ss,lin qb,jiang l,wu cy,wang hy,wanjm.2017.oscngc13 promotes seed-setting rate by facilitatingpollen tube growthin stylar tissues.plos genet,13(7),e1006906.doi:10.1371/journal.pgen.1006906。

7、3.xiang xj,zhang pp,yuping.,zhangyx,yang zf,sun lp,wuwx,khan rm,abbasa,cheng sh,cao ly.2019.lssr1 facilitates seed setting rate by promotingfertilization in rice.rice.12(1),31.doi:10.1186/s12284-019-0280-3。

8、4.takasaki t,hatakeyama k,suzuki g,watanabe m,isogai a,and hinatak.2000.the s312 receptorkinase determines self-incompatibility inbrassicastigma.nature.403:913–916

9、5.nasrallahjb,nasrallahme.pollen-stigma signallinginthe sporophyticself-incompatibilityresponse.plantcell.1993,5(10):1325-1335。

10、6.fujimoto r,sugimura t,nishio t.gene conversion from slg to srkresulting in self-incompatibility inbrassica rapa.febs letters.2006,580(2):425-430。

11、7.indriolo e,tharmapalan p,wright si.,goring dr.2012.the arc1 e3ligase gene is frequently deleted in self-compatible brassicaceae species andhas a conserved role in arabidopsis lyrata self-pollen rejection.plant cell,24(11),4607-20.doi:10.1105/tpc.112.104943。

12、8.indriolo e,safavian d,goring dr.2014.the arc1 e3 ligase promotestwo different self-pollen avoidance traits in arabidopsis.plant cell,26(4),1525-1543.doi:10.1105/tpc.114.122879。

13、9.samuel ma,chongyt,haasen ke,aldea-brydges mg,stone sl.,goringdr.2009.cellular pathways regulating responses to compatible and self-incompatible pollen in brassica andarabidopsis stigmas intersect at e本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.与花椰菜种子结实率性状连锁的KASP标记的引物组,其特征在于,该引物组包含:正向引物FAM、正向引物HEX和反向引物;

2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物FAM的核苷酸序列的5'端增加核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的通用接头序列。

3.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物HEX的核苷酸序列的5'端增加核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的通用接头序列。

4.与花椰菜种子结实率性状连锁的KASP标记试剂盒,其特征在于,该试剂盒中的引物采用如权利要求1~3任意一项所述的引物组。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中的PCR预混液的组分包含:通用的FRET cassette荧光引物、ROX内参染料、KlearTaqDNA聚合酶、dNTP和MgCl2。

6.如权利要求1~3任意一项所述的引物组或如权利要求4或5所述的试剂盒的应用,其特征在于,该应用选自以下任意一种:

7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,采用如权利要求1~3任意一项所述的引物组或如权利要求4或5所述的试剂盒进行PCR,根据PCR产物的基因分型判断花椰菜的结实率;

8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述PCR的反应体系为:PCR预混液、如权利要求1~3任意一项所述的引物组和模板DNA。

9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述PCR的反应条件为:94℃预变性15min;94℃变性20s,61~55℃退火延伸60s,每个循环的退火温度降低0.6℃,共10个循环;94℃变性20s,55℃退火延伸60s,共26个循环。

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【技术特征摘要】

1.与花椰菜种子结实率性状连锁的kasp标记的引物组,其特征在于,该引物组包含:正向引物fam、正向引物hex和反向引物;

2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物fam的核苷酸序列的5'端增加核苷酸序列如seq id no.4所示的通用接头序列。

3.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物hex的核苷酸序列的5'端增加核苷酸序列如seq id no.5所示的通用接头序列。

4.与花椰菜种子结实率性状连锁的kasp标记试剂盒,其特征在于,该试剂盒中的引物采用如权利要求1~3任意一项所述的引物组。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒中的pcr预混液的组分包含:通用的fret cassette荧光引物、rox内参染料、kleartaqdn...

【专利技术属性】
技术研发人员:盛小光虞慧芳顾宏辉沈钰森王建升宋蒙飞
申请(专利权)人:浙江省农业科学院
类型:发明
国别省市:

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