【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，特别是涉及用于鉴定豁眼鹅品种的snp位点组合及其鉴定方法。
技术介绍
1、豁眼鹅是山东省地方品种，属小型鹅种，具有耐粗饲、生长速度快、无抱窝性、产蛋多等特点，其开发利用前景较大。目前市场上有较多的假冒豁眼鹅以及豁眼鹅与其他品种的杂交个体冒充销售，对豁眼鹅纯种个体市场造成了一定的冲击，严重影响了豁眼鹅品牌。因此提供一种能有效准确鉴定豁眼鹅品种的产品及方法是十分必要的。
2、目前市场上鉴别豁眼鹅的方法主要依靠外观观察。这种观察主观性较强，鉴定错误率较高，尤其在鉴定豁眼鹅与其他品种鹅杂种后代时，容易导致不正确的分类与鉴定。而且地方品种鹅刚出雏时较为相似，鉴定错误率也较高。
3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性，具有位点丰富、分布广泛、遗传稳定性高、具有代表性、检测便捷快速等特点。snp标记，利用个体基因组dna中特有的品种差异性较大的snp位点，通过不同位点组合的基因型进行品种鉴定，鉴定结果更加客观、准确。鉴于此，科研和实践中均急需开发一种能有效准确鉴定豁眼鹅品种的产品及方法，应用于豁眼鹅品种鉴定工作中。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供用于鉴定豁眼鹅品种的snp位点组合及其鉴定方法，以解决上述现有技术存在的问题，通过检测提供的豁眼鹅15个snp位点的基因型来联合判断待测个体是否属于豁眼鹅，这种方法操作简便，准确性高，可
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供一种用于鉴定豁眼鹅品种的引物组合，所述引物组合为用于扩增hy1p-hy15p所示snp位点组合的引物组合，所述hy1p-hy15p所示snp位点组合为：
4、hy1p位于nw_025927674.1染色体上第8149755位，其多态性为t或c；
5、hy2p位于nw_025927674.1染色体上第8203321位，其多态性为a或g；
6、hy3p位于nw_025927679.1染色体上第2351173位，其多态性为t或c；
7、hy4p位于nw_025927682.1染色体上第3059353位，其多态性为c或t；
8、hy5p位于nw_025927697.1染色体上第6435171位，其多态性为a或g；
9、hy6p位于nw_025927698.1染色体上第5160223位，其多态性为g或a；hy7p位于nw_025927702.1染色体上第2291555位，其多态性为c或a；hy8p位于nw_025927731.1染色体上第2770782位，其多态性为a或c；hy9p位于nw_025927732.1染色体上第1509689位，其多态性为a或g；hy10p位于nw_025927766.1染色体上第2111483位，其多态性为g或a；hy11p位于nw_025927777.1染色体上第847200位，其多态性为t或c；hy12p位于nw_025927777.1染色体上第847596位，其多态性为a或g；hy13p位于nw_025927786.1染色体上第2195673位，其多态性为c或t；hy14p位于nw_025927805.1染色体上第1174874位，其多态性为c或a；hy15p位于nw_025927847.1染色体上第1194180位，其多态性为t或c。优选的是，所述hy1p-hy15p所示snp位点组合的扩增引物组合为：hy1f：5’-acagctggaagtcacgaagg-3’(seq id no：1)；
10、hy1r：5’-atgggaagcaggcagttacc-3’(seq id no：2)；
11、hy2f：5’-cctcttcatctcctgccagc-3’(seq id no：3)；hy2r：5’-gatgctttctgcaccaggga-3’(seq id no：4)；hy3f：5’-ctggtaactgcctagcagatgg-3’(seq idno：5)；
12、hy3r：5’-agcagaattacagcttctgggttt-3’(seq id no：6)；
13、hy4f：5’-ctaacaatgcgtgcctcagc-3’(seq id no：7)；hy4r：5’-taacaccttcccccagacca-3’(seq id no：8)；hy5f：5’-accacccttcccctacagat-3’(seq idno：9)；
14、hy5r：5’-cgcagagcagcagctaca-3’(seq id no：10)；hy6f：5’-aagaggatccgctgaggtct-3’(seq id no：11)；
15、hy6r：5’-agttgcctgctaggtcatcg-3’(seq id no：12)；
16、hy7f：5’-ttgcaaggactggctaacaac-3’(seq id no：13)；
17、hy7r：5’-aatcattaagcacaggtgcgg-3’(seq id no：14)；
18、hy8f：5’-tgctcgacatgtctcgtctg-3’(seq id no：15)；hy8r：5’-gaaagctggactgagggagtc-3’(seq id no：16)；
19、hy9f：5’-tgaggggtgaggaagggaat-3’(seq id no：17)；
20、hy9r：5’-ctaaatcgcgctgctgttcc-3’(seq id no：18)；
21、hy10f：5’-agtttccatggctacgtcaca-3’(seq id no：19)；
22、hy10r：5’-gtcaggccaatcaaagatgcc-3’(seq id no：20)；
23、hy11f：5’-gaacaggatgcacccaagga-3’(seq id no：21)；
24、hy11r：5’-gctcatcagagcagtggtca-3’(seq id no：22)；
25、hy12f：5’-gaggcttcaggtgagacgag-3’(seq id no：23)；
26、hy12r：5’-ctgttgctgaacctcccact-3’(seq id no：24)；
27、hy13f：5’-gctccttcacagaacagcct-3’(seq id no：25)；
28、hy13r：5’-tgccaagcagatagccagtc-3’(seq id no：26)；
29、hy14f：5’-agactgtgaagacaacaaggga-3’(se本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于鉴定豁眼鹅品种的引物组合，其特征在于，所述引物组合为用于扩增HY1P-HY15P所示SNP位点组合的引物组合，所述HY1P-HY15P所示SNP位点组合为：
2.如权利要求1所述的引物组合，其特征在于，所述HY1P-HY15P所示SNP位点组合的扩增引物组合为：
3.一种鉴定豁眼鹅品种的方法，其特征在于，包括如下步骤：
4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，根据贝叶斯定理判定所述待测鹅属于豁眼鹅的概率，计算公式如下：
5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，根据计算结果，为保证准确率，以0.95为阈值，属于豁眼鹅的概率大于等于0.95则判定为豁眼鹅；属于非豁眼鹅的概率大于等于0.95则判定为非豁眼鹅。
6.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述HY1P到HY15P所示位点在豁眼鹅及其他品种中的基因型、基因型平均频率如下所示：
7.如权利要求4或6所述的方法，其特征在于，所述其他品种包括长乐鹅、定安鹅、钢鹅、道州灰鹅、酃县白鹅、狮头鹅、乌鬃鹅、永康灰鹅和籽鹅。
8.一种鉴定豁眼鹅品种
9.如权利要求1-2任一项所述的引物组合或权利要求8所述的试剂盒在鉴定豁眼鹅品种的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定豁眼鹅品种的引物组合，其特征在于，所述引物组合为用于扩增hy1p-hy15p所示snp位点组合的引物组合，所述hy1p-hy15p所示snp位点组合为：
2.如权利要求1所述的引物组合，其特征在于，所述hy1p-hy15p所示snp位点组合的扩增引物组合为：
3.一种鉴定豁眼鹅品种的方法，其特征在于，包括如下步骤：
4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，根据贝叶斯定理判定所述待测鹅属于豁眼鹅的概率，计算公式如下：
5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，根据计算结果，为保证准确率，以0.95为阈值，属于豁...
【专利技术属性】
技术研发人员：徐文娟，朱春红，刘宏祥，章双杰，李慧芳，王晓峰，陶志云，王志成，宋卫涛，
申请(专利权)人：江苏省家禽科学研究所，
类型：发明
国别省市：
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