System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种用于鉴定狮头鹅品种的SNP位点组合及其鉴定方法技术_技高网

一种用于鉴定狮头鹅品种的SNP位点组合及其鉴定方法技术

技术编号:40479859 阅读:7 留言:0更新日期:2024-02-26 19:14
本发明专利技术公开了一种用于鉴定狮头鹅品种的SNP位点组合及其鉴定方法,涉及生物技术领域。该SNP位点组合,包括15个SNP位点ST1P‑ST15P。该鉴定方法包括以下步骤:提取待测鹅的基因组DNA;以所述基因组DNA为模板,进行PCR扩增,之后测序得到该SNP位点组合中各SNP位点的基因型;根据基因型检测结果,计算得到所述待测鹅属于狮头鹅的概率。根据贝叶斯定理,可以通过该SNP位点组合中各SNP位点的基因型,判断待检鹅个体是否属于狮头鹅,这种方法操作简便,准确性高,可以有效打击市场假冒狮头鹅的泛滥程度。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物,特别是涉及一种用于鉴定狮头鹅品种的snp位点组合及其鉴定方法。


技术介绍

1、狮头鹅是广东省地方品种,属大型鹅种,具有体型大、生长快、饲养期短、耐粗饲、饲料转化率高、适应性强等特点,其开发利用前景较大。目前市场上有较多的假冒狮头鹅以及狮头鹅与其他品种的杂交个体冒充销售,对狮头鹅纯种个体市场造成了一定的冲击,严重影响了狮头鹅品牌。因此提供一种能有效准确鉴定狮头鹅品种的产品及方法是十分必要的。

2、目前市场上鉴别狮头鹅的方法主要依靠外观观察。这种观察主观性较强,鉴定错误率较高,尤其在鉴定狮头鹅与其他品种鹅杂种后代时,容易导致不正确的分类与鉴定。而且地方品种鹅刚出雏时较为相似,鉴定错误率也较高。

3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性,具有位点丰富、分布广泛、遗传稳定性高、具有代表性、检测便捷快速等特点。snp标记,利用个体基因组dna中特有的品种差异性较大的snp位点,通过不同位点组合的基因型进行品种鉴定,鉴定结果更加客观、准确。鉴于此,科研和实践中均急需开发一种能有效准确鉴定狮头鹅品种的产品及方法,应用于狮头鹅品种鉴定工作。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是提供一种用于鉴定狮头鹅品种的snp位点组合及其鉴定方法,以解决上述现有技术存在的问题,通过该snp位点组合可以准确鉴定待检鹅个体是否属于狮头鹅。

2、为实现上述目的,本专利技术提供了如下方案:

3、本专利技术提供一种用于鉴定狮头鹅品种的snp位点组合,包括如下表所示的15个snp位点st1p-st15p:

4、

5、

6、本专利技术还提供一种用于鉴定狮头鹅品种的引物组合,包括如下所示的引物:

7、

8、

9、本专利技术还提供上述的snp位点组合或引物组合在鉴定狮头鹅品种中的应用。

10、本专利技术还提供上述的引物组合在制备鉴定狮头鹅品种的试剂盒中的应用。

11、本专利技术还提供一种鉴定狮头鹅品种的试剂盒,包括上述的引物组合。

12、本专利技术还提供一种狮头鹅品种的鉴定方法,包括以下步骤:

13、提取待测鹅的基因组dna;

14、以所述基因组dna为模板,进行pcr扩增,之后测序得到上述snp位点组合中各snp位点的基因型;

15、根据基因型检测结果,计算得到所述待测鹅属于狮头鹅的概率,当所述概率大于0.95时,判定所述待测鹅属于狮头鹅;

16、所述待测鹅属于狮头鹅的概率按照以下公式计算:

17、

18、其中,pi表示snp组合中第i个snp中狮头鹅品种对应基因型的频率,qi表示snp组合中第i个snp中其他品种对应基因型的平均频率;

19、所述狮头鹅品种对应基因型的频率和所述其他品种对应基因型的平均频率如下:

20、

21、

22、

23、进一步地,采用酚-氯仿法提取得到所述基因组dna。

24、进一步地,所述pcr扩增利用上述的引物组合进行。

25、进一步地,所述pcr扩增的反应体系为:模板2μl、正反向引物各1.5μl和2×pcr试剂10μl,超纯水补足至20μl。

26、进一步地,所述pcr扩增的反应程序为:94℃1min;94℃30s,55℃30s,72℃30s,35个循环;72℃5min。

27、本专利技术公开了以下技术效果:

28、本专利技术开发了一种用于鉴定狮头鹅品种的snp位点组合,包括15个snp位点st1p-st15p。根据贝叶斯定理,可以通过该snp位点组合中各snp位点的基因型,判断待检鹅个体是否属于狮头鹅。这种方法操作简便,准确性高,可以有效打击市场假冒狮头鹅的泛滥程度。

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【技术保护点】

1.一种用于鉴定狮头鹅品种的SNP位点组合,其特征在于,包括如下表所示的15个SNP位点ST1P-ST15P:

2.一种用于鉴定狮头鹅品种的引物组合,其特征在于,包括如下表所示的引物:

3.一种如权利要求1所述的SNP位点组合或权利要求2所述的引物组合在鉴定狮头鹅品种中的应用。

4.一种如权利要求2所述的引物组合在制备鉴定狮头鹅品种的试剂盒中的应用。

5.一种鉴定狮头鹅品种的试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的引物组合。

6.一种狮头鹅品种的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

7.根据权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于,采用酚-氯仿法提取得到所述基因组DNA。

8.根据权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于,所述PCR扩增利用权利要求2所述的引物组合进行。

9.根据权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为:模板2μL、正反向引物各1.5μL和2×PCR试剂10μL,超纯水补足至20μL。

10.根据权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:94℃1min;94℃30s,55℃30s,72℃30s,35个循环;72℃5min。

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【技术特征摘要】

1.一种用于鉴定狮头鹅品种的snp位点组合,其特征在于,包括如下表所示的15个snp位点st1p-st15p:

2.一种用于鉴定狮头鹅品种的引物组合,其特征在于,包括如下表所示的引物:

3.一种如权利要求1所述的snp位点组合或权利要求2所述的引物组合在鉴定狮头鹅品种中的应用。

4.一种如权利要求2所述的引物组合在制备鉴定狮头鹅品种的试剂盒中的应用。

5.一种鉴定狮头鹅品种的试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的引物组合。

6.一种狮头鹅品种的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

【专利技术属性】
技术研发人员:王志成李慧芳宋卫涛刘宏祥朱春红陶志云段炼徐文娟章双杰
申请(专利权)人:江苏省家禽科学研究所
类型:发明
国别省市:

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