MYCN扩增差异基因和衰老基因组合神经母细胞瘤预后模型制造技术

本发明专利技术为MYCN扩增差异基因和衰老基因组合神经母细胞瘤预后模型。该发明专利技术率先从MYCN扩增与非扩增患者中筛选出差异基因并与衰老基因进行交集选取候选基因构建本模型。该模型涉及6个基因，如下所示：Risk score=(0.506*PDGFRA基因表达水平)+(0.472*DLL3基因表达水平)+(0.390*TP53基因表达水平)‑(0.598*S100B基因表达水平)‑(0.363*IL7基因表达水平)‑(0.360*TP63基因表达水平)。通过E‑MTAB‑8248数据集验证了该模型预测神经母细胞瘤不良预后的良好效果，通过细胞系RT‑PCR实验发现该多基因组合的预后评分模型可能比单个高危基因预测神经母细胞瘤预后更准确，共培养实验验证了该模型还具有评估不同来源神经母细胞瘤肿瘤微环境对T细胞产生不同表型改变的作用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于医学领域，具体为一种基于mycn扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型及其建立的方法。

技术介绍

1、神经母细胞瘤(nb)是最常见的儿童实体肿瘤，但它在治疗方面提出了挑战。大约一半的患者被诊断为高危nb，并接受了强化的多模式治疗，但5年总生存率(os)仍低于20%。mycn基因扩增是公认的可能影响神经母细胞瘤不良预后因素，但mycn靶点本身难以形成药物，已知nb的预后还受年龄、高危基因遗传学改变，肿瘤细胞分化和mycn扩增等因素的影响，但仍然有临床上难以解释的现象，如表达某些高危基因或者高龄患者临床表现却为低危患者。其可能原因是独立的单一因素分析高度异质化的神经母细胞瘤预后并不准确。

2、免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors, icis)疗法可以增强免疫系统识别和消除肿瘤细，但在nb中疗效有限。根据免疫细胞尤其是t淋巴细胞的分布及其对免疫治疗的差异反应，可将肿瘤分为“冷”和“热”两类。nb是一种冷肿瘤，为研究其转化为热肿瘤以提高免疫治疗疗效提供了契机，被认为是研究免疫治疗耐药的良好本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于MYCN扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型构建方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.权利要求1所述的基于MYCN扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型构建方法，其特征在于：

3.权利要求1-2任一项所述的基于MYCN扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型构建方法，其特征在于，符合正态分布数据采用非配对t检验，当数据呈非正态分布时采用Wilcoxon检验；采用Fisher精确检验比较两组间定性变量的差异，P <0.05定义为具有统计学差异，使用R软件进行统计分析。

4.权利要求1-2任一项所述的基...

【技术特征摘要】

1.一种基于mycn扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型构建方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.权利要求1所述的基于mycn扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型构建方法，其特征在于：

3.权利要求1-2任一项所述的基于mycn扩增差异基因和衰老基因组合预测神经母细胞瘤预后模型构建方法，其特征在于，符合正态分布数据采用非配对t检验，当数据呈非正态分布时采用wilcoxon检验；采用...

【专利技术属性】
技术研发人员：谭家雄，王超宇，赵强，龚宝成，靳燕，夏雨人，
申请(专利权)人：天津市肿瘤医院天津医科大学肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：