本发明专利技术公开了用于鉴定钢鹅品种的SNP位点组合及其鉴定方法，属于生物技术领域。本发明专利技术筛选出GE1P到GE15P 15个SNP位点，利用扩增上述SNP位点的引物组合，确定各位点的基因型，并根据贝叶斯定理判定该个体属于钢鹅的概率。通过实验验证，证实15个SNP位点联合使用判断待测个体是否属于钢鹅，当概率大于0.95时则判定为钢鹅，准确率可达到100％。本发明专利技术公开的鉴定钢鹅品种的方法操作简便，准确性高，可以有效打击市场假冒钢鹅的泛滥程度。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，特别是涉及用于鉴定钢鹅品种的snp位点组合及其鉴定方法。
技术介绍
1、钢鹅是四川省地方品种，属中型鹅种，耐粗饲、易肥、肉嫩味鲜、适应性强等特点，其开发利用前景较大。目前市场上有较多的假冒钢鹅以及钢鹅与其他品种的杂交个体冒充销售，对钢鹅纯种个体市场造成了一定的冲击，严重影响了钢鹅品牌。因此提供一种能有效准确鉴定钢鹅品种的产品及方法是十分必要的。
2、目前市场上鉴别钢鹅的方法主要依靠外观观察。这种观察主观性较强，鉴定错误率较高，尤其在鉴定钢鹅与其他品种鹅杂种后代时，容易导致不正确的分类与鉴定。而且地方品种鹅刚出雏时较为相似，鉴定错误率也较高。
3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性，具有位点丰富、分布广泛、遗传稳定性高、具有代表性、检测便捷快速等特点。snp标记，利用个体基因组dna中特有的品种差异性较大的snp位点，通过不同位点组合的基因型进行品种鉴定，鉴定结果更加客观、准确。鉴于此，科研和实践中均急需开发一种能有效准确鉴定钢鹅品种的产品及方法，应用于钢鹅品种鉴定工作中。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供用于鉴定钢鹅品种的snp位点组合及其鉴定方法，以解决上述现有技术存在的问题，通过检测提供的钢鹅15个snp位点的基因型来联合判断待测个体是否属于钢鹅，这种方法操作简便，准确性高，可以有效打击市场假冒钢鹅的泛滥程度。</p>2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供一种用于鉴定钢鹅品种的引物组合，所述引物组合为用于扩增ge1p-ge15p所示snp位点组合的引物组合，所述ge1p-ge15p所示snp位点组合为：
4、ge1p位于nw_025927662.1染色体上第13858336位，其多态性为c或a；
5、ge2p位于nw_025927662.1染色体上第13871111位，其多态性为t或c；
6、ge3p位于nw_025927662.1染色体上第13877045位，其多态性为a或c；
7、ge4p位于nw_025927662.1染色体上第13913067位，其多态性为c或t；
8、ge5p位于nw_025927662.1染色体上第13913660位，其多态性为a或c；
9、ge6p位于nw_025927702.1染色体上第2733521位，其多态性为g或a；
10、ge7p位于nw_025927702.1染色体上第2786509位，其多态性为t或c；ge8p位于nw_025927805.1染色体上第1359142位，其多态性为t或c；ge9p位于nw_025927846.1染色体上第569545位，其多态性为a或g；ge10p位于nw_025927846.1染色体上第570245位，其多态性为t或g；ge11p位于nw_025927846.1染色体上第575545位，其多态性为a或g；ge12p位于nw_025927846.1染色体上第580601位，其多态性为t或c；ge13p位于nw_025927846.1染色体上第581196位，其多态性为a或g；ge14p位于nw_025927846.1染色体上第582351位，其多态性为t或c；ge15p位于nw_025927846.1染色体上第1023753位，其多态性为c或g。优选的是，所述ge1p-ge15p所示snp位点组合的扩增引物组合为：ge1f：5’-ggggctgctctgcttagaaa-3’(seq id no:1)；
11、ge1r：5’-agaccataaagtgcccctgc-3’(seq id no:2)；ge2f：5’-aaggtgtagggattgactcgc-3’(seq id no:3)；ge2r：5’-tacacaaatagagtcagcccagt-3’(seqid no:4)；
12、ge3f：5’-ggagcaatcacatccccgaa-3’(seq id no:5)；ge3r：5’-tgcagaagcgagaaggttga-3’(seq id no:6)；ge4f：5’-ccggttctttcaggactcaca-3’(seq idno:7)；
13、ge4r：5’-ccactctgacccagacgaga-3’(seq id no:8)；
14、ge5f：5’-gcaggtcaccgcaagaaata-3’(seq id no:9)；ge5r：5’-tttaatcccacgtcggggaac-3’(seq id no:10)；
15、ge6f：5’-cggcagcttcttagagcgat-3’(seq id no:11)；ge6r：5’-gctcacacacagcaatcagc-3’(seq id no:12)；
16、ge7f：5’-tcgatgtgccgtgtactgag-3’(seq id no:13)；ge7r：5’-ttggctgtttccaccccaaa-3’(seq id no:14)；
17、ge8f：5’-cactggctgttgttttggca-3’(seq id no:15)；ge8r：5’-tggacacgtgtgatgtgagg-3’(seq id no:16)；
18、ge9f：5’-ttggctggaagcacgtttct-3’(seq id no:17)；ge9r：5’-aaagcgacccaaaagcaagc-3’(seq id no:18)；
19、ge10f：5’-ccgggagcttaattcttggtga-3’(seq id no:19)；
20、ge10r：5’-gtggggtctcggacctatg-3’(seq id no:20)；ge11f：5’-ggctttggggtgtctccatt-3’(seq id no:21)；ge11r：5’-ccaaaagcctgtggtgcaaa-3’(seq idno:22)；
21、ge12f：5’-acctgatgatcaagcccgtg-3’(seq id no:23)；
22、ge12r：5’-ttgttgatcctctcggccac-3’(seq id no:24)；
23、ge13f：5’-tgaactaggttgggccactt-3’(seq id no:25)；
24、ge13r：5’-cactgctccatttcgtgcttag-3’(seq id no:26)；
25、ge14f：5’-aggggttatcccacctcctc-3’(seq id no:27)；
26、ge14r：5’-ggtctccgacagtttgctga-3’(seq id 本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种用于鉴定钢鹅品种的引物组合，其特征在于，所述引物组合为用于扩增GE1P-GE15P所示SNP位点组合的引物组合，所述GE1P-GE15P所示SNP位点组合为：
2.如权利要求1所述的引物组合，其特征在于，所述GE1P-GE15P所示SNP位点组合的扩增引物组合为：
3.一种鉴定钢鹅品种的方法，其特征在于，包括如下步骤：
4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，根据贝叶斯定理判定所述待测鹅属于钢鹅的概率，计算公式如下：
5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，根据计算结果，为保证准确率，以0.95为阈值，属于钢鹅的概率大于等于0.95则判定为钢鹅；属于非钢鹅的概率大于等于0.95则判定为非钢鹅。
6.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述SNP位点在钢鹅及其他品种中的基因型、基因型平均频率如下所示：
7.如权利要求4或6所述的方法，其特征在于，所述其他品种包括长乐鹅、豁眼鹅、道州灰鹅、定安鹅、酃县白鹅、狮头鹅、乌鬃鹅、永康灰鹅和籽鹅。
8.一种鉴定钢鹅品种的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1或2所述的引物组合。
9.如权利要求1-2任一项所述的引物组合或权利要求8所述的试剂盒在鉴定钢鹅品种的应用。
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【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定钢鹅品种的引物组合，其特征在于，所述引物组合为用于扩增ge1p-ge15p所示snp位点组合的引物组合，所述ge1p-ge15p所示snp位点组合为：
2.如权利要求1所述的引物组合，其特征在于，所述ge1p-ge15p所示snp位点组合的扩增引物组合为：
3.一种鉴定钢鹅品种的方法，其特征在于，包括如下步骤：
4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，根据贝叶斯定理判定所述待测鹅属于钢鹅的概率，计算公式如下：
5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，根据计算结果，为保证准确率，以0.95为...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘宏祥，李慧芳，陶志云，朱春红，徐文娟，宋卫涛，王志成，章双杰，
申请(专利权)人：江苏省家禽科学研究所，
类型：发明
国别省市：
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