一种鉴定茶树早生性状的SNP位点、CAPS分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术提供一种鉴定茶树早生性状的SNP位点、CAPS分子标记及其应用。所述SNP位点位于茶树4号染色体第227558248位碱基，碱基多态性为C/G，所述SNP位点命名为Chr04:227558248_C/G；经SNP位点转化的CAPS分子标记的引物序列为引物F：5'‑CTGCCAACTTCCCTTATTGTTGTT‑3'；引物R：5'‑ATGCTCAAGACGCAACAATCTTACT‑3'。以茶树基因组DNA为模板进行PCR扩增，扩增产物经限制性内切酶BstNI酶切，通过琼脂糖凝胶电泳、酶切片段分析等过程，对不同茶树品种进行了纯合、杂合和野生型酶切分型，1条带为纯合GG型早生品种，3条带为杂合CG型中生品种，2条带为野生CC型晚生品种。本发明专利技术提供的CAPS分子标记带型稳定、准确率高且成本低，能很好地分辨不同的春梢萌发类型茶树品种，可以为今后茶树早生品种的早期基因型鉴定与育种选择工作提供新途径。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子标记，一种鉴定茶树早生性状的snp位点、caps分子标记及其应用。

技术介绍

1、茶树(camellia sinensis)作为一种叶用型经济植物，春梢萌发时间是其主要农艺性状之一，萌发早的茶树茶叶产量与品质更佳，因而具有更高经济价值。

2、caps分子标记是将pcr技术和限制性酶切结合为一体的技术。该标记原理为，基因组片段上碱基的突变会引起限制性内切酶识别位点的改变，根据已知序列设计特异性引物，利用特异性引物对snp突变位点进行pcr扩增，通过特异性的限制性内切酶酶切pcr产物，用琼脂糖凝胶电泳检测其酶切产物，电泳结果会出现部分基因型扩增片段可被完全酶切呈2条带，部分基因型扩增片段不被酶切或酶切不完全呈1条或3条带的情况，从而进行单核苷酸多态性分析。研究表明，该技术具有多态性高、共显性、所需dna量少、操作简便、结果稳定可靠等优点。

3、目前鉴定茶树早生品种的方法主要以表型选择为主，分子标记辅助选择应用较少，如简单序列重复标记(simple sequence repeat，ssr)。人工选择茶树早生品种费时费力，本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种鉴定茶树早生性状的SNP位点，其特征在于，所述SNP位点位于茶树4号染色体第227558248位碱基，碱基多态性为C/G, 所述SNP位点命名为Chr04:227558248_C/G。

2.一种鉴定茶树早生性状的CAPS分子标记，其特征在于，所述CAPS分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述核苷酸序列包含权利要求1所述的SNP位点。

3.扩增权利要求2所述的CAPS分子标记的引物，其特征在于，所述引物的序列如下：

4.一种利用权利要求2所述的CAPS分子标记鉴定茶树早生性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：</p>

5.根据...

【技术特征摘要】

1.一种鉴定茶树早生性状的snp位点，其特征在于，所述snp位点位于茶树4号染色体第227558248位碱基，碱基多态性为c/g, 所述snp位点命名为chr04:227558248_c/g。

2.一种鉴定茶树早生性状的caps分子标记，其特征在于，所述caps分子标记的核苷酸序列如seq id no:1所示，所述核苷酸序列包含权利要求1所述的snp位点。

3.扩增权利要求2所述的caps分子标记的引物，其特征在于，所述引物的序列如下：

4.一种利用权利要求2所述的caps分子标记鉴定茶树早生性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，每份步骤（2）中所述pcr扩增的反应体系包括：1μl引物f，1μl引物r，1μl模板dna，10μl 2×rapid taq master mix， 7μl ddh2o。

6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，步骤（2）中所述pc...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘硕谦，黄梦迪，田娜，苏芹，刘仲华，黄建安，
申请(专利权)人：湖南农业大学，
类型：发明
国别省市：