【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子检测，具体涉及兴隆水牛液相芯片，还涉及其应用。
技术介绍
1、兴隆水牛是热带地区优良的水牛品种，具有耐高湿、耐高热、抗病力强等品种特性，主要分布在海南省万宁县南和西北一带，其种质特性是在长期热带气候环境和基因突变的相互作用下，以及当地群众长期选育下逐渐形成的。近些年，由于盲目杂交改良和缺乏资源保护意识，各地方水牛的生产性能和产品质量受到了较大影响，水牛的数量也逐渐减少甚至濒临消失。分子标记辅助育种技术是一种利用分子标记和遗传信息来辅助传统育种方法的技术，它可以加速育种进程，提高选择效率，扩大遗传多样性，降低成本，并提高育种的精度和准确性。
2、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)，指的是在基因组水平上的单个核苷酸的变异。随着高通量测序和阵列技术的发展，大规模基因分型的成本已大大降低，选择snp作为遗传标记已成为一种趋势，已被广泛应用于性状关联分析、亲缘鉴定等动物分子遗传研究中。其中，靶向测序基因型分型(genotyping by target sequencing，gbts)技术是一种针对目标位点进行深度重测序的技术。相比于基于内切酶介导的测序基因分型技术，gbts技术具有更强的目标性、更高的位点覆盖度和样品均一性。gbts技术的独特之处在于其"靶向"的特性，其体系由genobaits技术和genoplexs技术组成。近些年发展起来的液相芯片即是一种基于snp的靶向测序基因型检测技术，通过检测目标分子与探针的结合情况，可以确定目标分子的存在与否，及其
3、目前市场上已有的水牛snp育种芯片，如axiom buffalo水牛基因分型芯片、水牛50ksnp芯片等，不适于兴隆水牛品种的遗传多样性研究和遗传评估。为了更好地挖掘和保护兴隆水牛这一宝贵的种质资源，设计属于兴隆水牛的snp液相芯片是迫切需要的。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供兴隆水牛液相芯片，以实现兴隆水牛的品种鉴定及亲缘关系分析。
2、本专利技术的另一目的是提供上述兴隆水牛液相芯片在兴隆水牛育种中的应用。
3、本专利技术所采用的技术方案是，兴隆水牛液相芯片，该芯片的基因分型对象包括1208个snp位点，1208个snp位点定位于水牛参考基因组cusa_swp(gwhaajz00000000)上的位置信息如下所示：
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15、本专利技术所采用的另一技术方案是，兴隆水牛液相芯片在兴隆水牛血统分析、水牛遗传多样性评估、种质资源和亲缘关系鉴定、遗传图谱构建及基因定位、全基因组关联分析和水牛分子标记辅助育种中的应用。
16、本专利技术的有益效果是：本专利技术的兴隆水牛液相芯片具有低成本基因分型的优势；有助于兴隆水牛的品种鉴定和亲缘关系分析；能够为兴隆水牛的杂交改良工作提供科学引导；有助于保护和开发兴隆水牛的种质资源。此外，通过使用该芯片，可以实现更精确的基因分型结果，为水牛育种工作提供更准确的信息。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.兴隆水牛液相芯片，其特征在于，该芯片的基因分型对象包括1208个SNP位点，1208个SNP位点定位于水牛参考基因组CUSA_SWP上的位置信息如下所示：
2.如权利要求1所述的兴隆水牛液相芯片在兴隆水牛血统分析、水牛遗传多样性评估、种质资源和亲缘关系鉴定、遗传图谱构建及基因定位、全基因组关联分析和水牛分子标记辅助育种中的应用。
【技术特征摘要】
1.兴隆水牛液相芯片，其特征在于，该芯片的基因分型对象包括1208个snp位点，1208个snp位点定位于水牛参考基因组cusa_swp上的位置信息如下所示：
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【专利技术属性】
技术研发人员：王凤阳，高宏岩，陈思，陈巧玲，吴慧，蒙勇，焦玉清，满初日嘎，杜丽，
申请(专利权)人：海南大学，
类型：发明
国别省市：
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