【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学、种质资源学领域，涉及一种用于构建木姜叶柯dna指纹图谱的snp分子标记组合及其检测分子标记的引物对。
技术介绍
1、木姜叶柯(lithocarpus litseifolius(hance)chun)是壳斗科常绿乔木，俗称“甜茶”、“溆浦瑶茶”，主要分布于长江以南各省份，作为日常饮品已有数千年的历史。木姜叶柯因为二氢查尔酮含量高，是天然甜味剂的良好来源。此外，近些年来，人们还发现了木姜叶柯的药用价值，其黄酮类化合物因具有抗氧化、抗过敏和抑菌特性以及降低血压、降低胆固醇和预防糖尿病的能力而被重视。木姜叶柯是一种特色植物资源，具有重要的经济、药用和育种价值。
2、迄今，国内没有标准化的木姜叶柯种质资源圃，木姜叶柯种质资源的鉴定一直以形态性状鉴定为主要依据。然而，木姜叶柯属于高大乔木，有性世代周期长，性状鉴定过程中不仅鉴定周期较长，而且其农艺性状易受环境条件和栽培管理措施的影响。此外，传统的鉴定方法对于一些性状差异较小、亲缘关系较近的种质资源的鉴定十分困难，给木姜叶柯种质资源的鉴定带来了诸多不便。因此，亟需准确的分子标记方法来对木姜叶柯种质资源进行鉴定。
3、分子标记分析方法均以dna的多态性为基础，如rflp、rapd、aflp、issr、ssr、以及snp标记等，它们均能产生具有高度个体特异性的dna指纹图谱。早期rflp、rapd、aflp分子标记技术曾被应用到多个物种的dna指纹图谱建库上，但以上几个标记技术在使用中经常出现稳定性差、多态性低、以及数据整合困难等问题未能被广泛应用
技术实现思路
1、有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种用于构建木姜叶柯dna指纹图谱的snp分子标记组合及其检测分子标记的引物对。
2、为达到上述目的，本专利技术提供如下技术方案：
3、1.用于构建木姜叶柯dna指纹图谱的snp分子标记组合，具体包括以下snp分子标记：
4、第1个snp分子标记306676_61，其核苷酸序列如seq id no.37所示；
5、第2个snp分子标记409640_49，其核苷酸序列如seq id no.38所示；
6、第3个snp分子标记49102_44，其核苷酸序列如seq id no.39所示；
7、第4个snp分子标记221537_45，其核苷酸序列如seq id no.40所示；
8、第5个snp分子标记328712_97，其核苷酸序列如seq id no.41所示；
9、第6个snp分子标记250643_87，其核苷酸序列如seq id no.42所示；
10、第7个snp分子标记15302_129，其核苷酸序列如seq id no.43所示；
11、第8个snp分子标记85497_65，其核苷酸序列如seq id no.44所示；
12、第9个snp分子标记8463_141，其核苷酸序列如seq id no.45所示。
13、进一步用于构建木姜叶柯dna指纹图谱的snp分子标记组合，还包括以下snp分子标记：
14、第10个snp分子标记185295_75，其核苷酸序列如seq id no.46所示；
15、第11个snp分子标记48830_118，其核苷酸序列如seq id no.47所示；
16、第12个snp分子标记12424_72，其核苷酸序列如seq id no.48所示。
17、2.扩增上述snp分子标记组合的pcr扩增引物对组合，根据snp分子标记位点序列进行设计，分别包括2条上游分型引物和1条下游通用引物；其中，
18、针对第1个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.1-3所示；
19、针对第2个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.4-6所示；
20、针对第3个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.7-9所示；
21、针对第4个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.10-12所示；
22、针对第5个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.13-15所示；
23、针对第6个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.16-18所示；
24、针对第7个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.19-21所示；
25、针对第8个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.22-24所示；
26、针对第9个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.25-27所示。
27、进一步所述snp分子标记组合的pcr扩增引物对组合，还包括以下引物对：
28、针对第10个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.28-30所示；
29、针对第11个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.31-33所示；
30、针对第12个snp分子标记的pcr扩增引物对核苷酸序列如seq id no.34-36所示。
31、3.一种检测seq id no.37-48所示的snp分子标记组合的引物对组合在构建木姜叶柯dna指纹图谱中的应用。
32、进一步所述的应用中，所述引物对组合为seq id no.1-27所示的pcr扩增引物对组合。
33、进一步所述的应用中，所述引物对组合为seq id no.28-36所示的pcr扩增引物对组合。
34、4.一种检测seq id no.37-48所示的snp分子标记组合的引物对组合在鉴定木姜叶柯种质中的应用。
35、进一步所述的应用中，所述引物对组合为seq id no.1-27所示的pcr扩增引物对组合。
36、进一步所述的应用中，所述引物对组合为seq id no.28-36所示的pcr扩增引物对组合。
37、5.含有seq id no.1-27所示的pcr扩增引物的检测试剂或试剂盒。
38、进一步，含有seq id no.1-36所示的pcr扩增引物的检测试本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.用于构建木姜叶柯DNA指纹图谱的SNP分子标记组合，其特征在于，包括以下SNP分子标记：
2.根据权利要求1所述的用于构建木姜叶柯DNA指纹图谱的SNP分子标记组合，其特征在于，还包括以下SNP分子标记：
3.扩增权利要求1或2所述SNP分子标记组合的PCR扩增引物对组合，其特征在于，根据SNP分子标记位点序列进行设计，分别包括2条上游分型引物和1条下游通用引物；其中，
4.根据权利要求3所述SNP分子标记组合的PCR扩增引物对组合，其特征在于，还包括以下引物对：
5.一种检测权利要求1或权利要求2所述的SNP分子标记组合的引物对组合在构建木姜叶柯DNA指纹图谱中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述引物对组合为权利要求3或权利要求4所述的PCR扩增引物对组合。
7.一种检测权利要求1或权利要求2所述的SNP分子标记组合的引物对组合在鉴定木姜叶柯种质中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述引物对组合为权利要求3或权利要求4所述的PCR扩增引物对组合。
...【技术特征摘要】
1.用于构建木姜叶柯dna指纹图谱的snp分子标记组合，其特征在于，包括以下snp分子标记：
2.根据权利要求1所述的用于构建木姜叶柯dna指纹图谱的snp分子标记组合，其特征在于，还包括以下snp分子标记：
3.扩增权利要求1或2所述snp分子标记组合的pcr扩增引物对组合，其特征在于，根据snp分子标记位点序列进行设计，分别包括2条上游分型引物和1条下游通用引物；其中，
4.根据权利要求3所述snp分子标记组合的pcr扩增引物对组合，其特征在于，还包括以下引物对：
5.一种检测权...
【专利技术属性】
技术研发人员：邱小燕，肖深根，田玉桥，伍贤进，陈阳峰，李自强，向助文，王依清，石兴雨，汪明磊，
申请(专利权)人：湖南农业大学，
类型：发明
国别省市：
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