【技术实现步骤摘要】
技术介绍
技术实现思路
1、本公开提供包括以下一项或多项的组合物和方法：(1)“casz”蛋白(也称为casz多肽)、编码casz蛋白的核酸和/或包含casz蛋白(和/或编码所述casz蛋白的核酸)的修饰的宿主细胞；(2)与casz蛋白结合并提供针对casz蛋白的序列特异性的casz指导rna、编码casz指导rna的核酸和/或包含casz指导rna(和/或编码所述casz指导rna的核酸)的修饰的宿主细胞；以及(3)casz反式激活非编码rna(trancrna)(在本文中称为“casz trancrna”)、编码casz trancrna的核酸和/或包含casz trancrna(和/或编码所述casz trancrna的核酸)的修饰的宿主细胞。
【技术保护点】
1.一种将CasZ多肽导向至靶核酸的靶序列的方法，
2.如权利要求1所述的方法，其中所述接触在靶细胞内部发生。
3.如权利要求2所述的方法，其中所述接触包括：将以下至少一项引入所述靶细胞中：
4.如权利要求3所述的方法，其中编码所述CasZ多肽的所述核酸是经密码子优化以在所述靶细胞中表达的非天然序列。
5.如权利要求2-4中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是真核细胞。
6.如权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述靶细胞在体外培养物中。
7.如权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是体内的。
8.如权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是离体的。
9.如权利要求5所述的方法，其中所述真核细胞选自由以下组成的组：植物细胞、真菌细胞、单细胞真核生物体、哺乳动物细胞、爬行动物细胞、昆虫细胞、禽细胞、鱼细胞、寄生虫细胞、节肢动物细胞、无脊椎动物细胞、脊椎动物细胞、啮齿动物细胞、小鼠细胞、大鼠细胞、灵长类动物细胞、非人灵长类动物细胞和人细胞。
10.如权利要求2
11.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述靶核酸与CasZ反式激活非编码RNA(trancRNA)接触。
12.如权利要求2-10中任一项所述的方法，其中所述接触包括：将CasZ反式激活非编码RNA(trancRNA)和/或编码所述CasZ trancRNA的核酸引入所述靶细胞中。
13.如权利要求11或权利要求12所述的方法，其中所述trancRNA包含与表2的trancRNA序列具有70％或更高的同一性的核苷酸序列。
14.一种包含工程化的和/或非天然存在的复合物的组合物，所述复合物包含：
15.如权利要求14所述的组合物，其还包含CasZ反式激活非编码RNA(trancRNA)或编码所述CasZ trancRNA的核酸。
16.一种包含工程化的和/或非天然存在的复合物的试剂盒，所述复合物包含：
17.如权利要求16所述的试剂盒，其还包含CasZ反式激活非编码RNA(trancRNA)或编码所述CasZ trancRNA的核酸。
18.一种遗传修饰的真核细胞，其包含以下至少一项：
19.如前述权利要求中任一项所述的组合物、试剂盒或真核细胞，其特征在于以下至少一项：
20.一种检测样品中的靶DNA的方法，所述方法包括：
21.一种用于检测样品中的靶DNA的试剂盒，所述试剂盒包含：
22.一种切割单链DNA(ssDNA)的方法，所述方法包括：
...【技术特征摘要】
1.一种将casz多肽导向至靶核酸的靶序列的方法，
2.如权利要求1所述的方法，其中所述接触在靶细胞内部发生。
3.如权利要求2所述的方法，其中所述接触包括：将以下至少一项引入所述靶细胞中：
4.如权利要求3所述的方法，其中编码所述casz多肽的所述核酸是经密码子优化以在所述靶细胞中表达的非天然序列。
5.如权利要求2-4中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是真核细胞。
6.如权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述靶细胞在体外培养物中。
7.如权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是体内的。
8.如权利要求2-5中任一项所述的方法，其中所述靶细胞是离体的。
9.如权利要求5所述的方法，其中所述真核细胞选自由以下组成的组：植物细胞、真菌细胞、单细胞真核生物体、哺乳动物细胞、爬行动物细胞、昆虫细胞、禽细胞、鱼细胞、寄生虫细胞、节肢动物细胞、无脊椎动物细胞、脊椎动物细胞、啮齿动物细胞、小鼠细胞、大鼠细胞、灵长类动物细胞、非人灵长类动物细胞和人细胞。
10.如权利要求2-9中任一项所述的方法，其中所述接触还包括：将dna供体模板引入所述靶细胞中。
11.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述方法包括使所述靶核酸与casz反式激活非编码rna(trancr...
【专利技术属性】
技术研发人员：J·A·都纳，D·博尔斯泰因，J·S·陈，L·B·哈灵顿，D·帕埃斯艾斯皮诺，J·F·班菲尔德，
申请(专利权)人：加利福尼亚大学董事会，
类型：发明
国别省市：
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